127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2391 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2391  Methyltransferase type 12  100 
 
 
442 aa  884    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.708633  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3132  Methyltransferase type 12  46.07 
 
 
494 aa  351  2e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.058423  hitchhiker  0.0000598488 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1194  Methyltransferase type 12  48.39 
 
 
480 aa  348  1e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.268598  normal  0.023424 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1722  Methyltransferase type 12  46.34 
 
 
474 aa  344  2e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00139526  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0482  Methyltransferase type 12  46.12 
 
 
470 aa  335  5.999999999999999e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6753  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  44.01 
 
 
504 aa  334  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.549173 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5515  Methyltransferase type 12  44.61 
 
 
511 aa  332  9e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.172303 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1594  hypothetical protein  41.87 
 
 
461 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00372727  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2767  methyltransferase type 12  40.22 
 
 
465 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0943  Methyltransferase type 12  44.86 
 
 
468 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4015  methyltransferase type 12  40.95 
 
 
534 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.20547 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3501  Methyltransferase type 12  45.15 
 
 
455 aa  319  5e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.280234  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2985  methyltransferase type 12  40.44 
 
 
460 aa  319  6e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3745  hypothetical protein  44.91 
 
 
459 aa  319  7.999999999999999e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.946661  normal  0.0367829 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1976  methyltransferase type 12  41.24 
 
 
465 aa  316  5e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.019973  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37640  methyltransferase family protein  45.77 
 
 
524 aa  315  7e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3284  Methyltransferase type 12  39.43 
 
 
465 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00725459 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0171  methyltransferase type 12  39 
 
 
469 aa  282  1e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.738928  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0920  Methyltransferase type 12  53.04 
 
 
535 aa  220  3.9999999999999997e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3568  methyltransferase type 12  41.88 
 
 
202 aa  130  6e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00317327  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00420  hypothetical protein  26.38 
 
 
477 aa  82  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0136325  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3123  hypothetical protein  29.83 
 
 
426 aa  77.8  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000940695  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  42.42 
 
 
194 aa  58.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  29.94 
 
 
332 aa  57.4  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3207  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.36 
 
 
390 aa  55.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0295  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.1 
 
 
389 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3113  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.36 
 
 
390 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.638061  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3460  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.36 
 
 
390 aa  55.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0397  cyclopropane fatty acid synthase family protein  27.1 
 
 
389 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3438  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.36 
 
 
390 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3185  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.42 
 
 
390 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3426  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.42 
 
 
390 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0301  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.27 
 
 
392 aa  51.2  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  29.93 
 
 
303 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1068  methyltransferase type 11  33.9 
 
 
417 aa  48.5  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0824  methyltransferase type 11  27.74 
 
 
201 aa  48.9  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0330  hypothetical protein  32.8 
 
 
226 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.892923  normal  0.271742 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5080  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.46 
 
 
395 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0530  putative methylase  23.77 
 
 
269 aa  48.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04071  hypothetical protein  32.93 
 
 
266 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  40.43 
 
 
327 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  30 
 
 
240 aa  47.8  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1537  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  24.39 
 
 
382 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.225351  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  37.63 
 
 
335 aa  47.8  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  41.49 
 
 
354 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  41.49 
 
 
349 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1859  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  26.81 
 
 
382 aa  47.4  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000286761  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2374  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  26.81 
 
 
382 aa  47  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.049386  normal  0.0849585 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01622  hypothetical protein  26.81 
 
 
327 aa  47  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  46.94 
 
 
213 aa  47  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5415  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33 
 
 
394 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.424397 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  40.43 
 
 
342 aa  47  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2539  Methyltransferase type 11  34.51 
 
 
237 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.459192  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01632  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase (unsaturated-phospholipid methyltransferase)  26.81 
 
 
382 aa  46.6  0.0009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1979  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.81 
 
 
382 aa  46.6  0.0009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000157021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1741  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  26.81 
 
 
382 aa  46.6  0.0009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000985  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1536  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  26.81 
 
 
382 aa  46.6  0.0009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0998383  hitchhiker  0.00855528 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1605  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.69 
 
 
300 aa  46.2  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.664267 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2495  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.09 
 
 
238 aa  46.2  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3322  methyltransferase type 12  30.99 
 
 
318 aa  45.8  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.595734  normal  0.302163 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1875  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  26.81 
 
 
382 aa  46.6  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000001342  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2317  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.13 
 
 
414 aa  45.8  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.175202  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1968  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  26.81 
 
 
382 aa  46.6  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000279538 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1560  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  23.78 
 
 
382 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138047  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1523  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  23.78 
 
 
382 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1747  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  23.78 
 
 
382 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00423906  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1916  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  23.78 
 
 
382 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0810656  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1720  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.16 
 
 
440 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11260  trans-aconitate methyltransferase  40 
 
 
307 aa  46.6  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.22553  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5365  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.31 
 
 
428 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.552994  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7150  cyclopropane fatty-acyl-phospholipid synthase  30.77 
 
 
419 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133822  normal  0.013333 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2471  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.6 
 
 
253 aa  45.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0816  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.93 
 
 
403 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0386837  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5273  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.31 
 
 
418 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3366  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.85 
 
 
240 aa  45.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.06 
 
 
217 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  38.3 
 
 
328 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3020  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  36.08 
 
 
249 aa  44.7  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73140  hypothetical protein  30.23 
 
 
394 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0876  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.64 
 
 
245 aa  44.7  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000138589  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1204  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 
243 aa  44.7  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.602867  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4011  methyltransferase type 12  32.23 
 
 
317 aa  44.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.550687  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.22 
 
 
243 aa  45.1  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02731  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
235 aa  44.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  30.88 
 
 
1340 aa  44.7  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1905  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.75 
 
 
303 aa  44.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5144  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32 
 
 
394 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.278517  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.72 
 
 
232 aa  44.7  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4563  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.47 
 
 
394 aa  44.3  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.22 
 
 
234 aa  44.7  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2575  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  22.86 
 
 
383 aa  44.3  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1647  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.98 
 
 
436 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0262651  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.06 
 
 
234 aa  44.7  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  32.7 
 
 
237 aa  44.3  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0350  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.36 
 
 
391 aa  43.9  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.19303  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1106  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  29.46 
 
 
229 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3858  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.71 
 
 
260 aa  43.9  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000301378 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001055  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  27.94 
 
 
214 aa  44.3  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.829142  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  44.23 
 
 
199 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02158  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.08 
 
 
240 aa  43.9  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>