More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0728 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0728  response regulator receiver protein  100 
 
 		 190 aa  392  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4386  response regulator receiver protein  75.94 
 
 		 133 aa  215  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5315  response regulator receiver protein  29.92 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.813269  normal  0.296683 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4908  response regulator receiver protein  28.68 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00100675  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3221  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.3 
 
 		 443 aa  57  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0497788 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2099  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  26.12 
 
 		 402 aa  57  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.316821 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0424  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.13 
 
 		 441 aa  57  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.130175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2339  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.45 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2390  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.45 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3924  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  26.42 
 
 		 443 aa  56.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2281  two component transcriptional regulator  30.77 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.331932  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1991  two component transcriptional regulator  32.08 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2154  response regulator receiver  26.85 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0828561  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0108  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2116  two component transcriptional regulator  26.85 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.291778  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1803  two component transcriptional regulator  33.05 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.782093  normal  0.890279 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4308  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  27.21 
 
 		 552 aa  55.1  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0101  response regulator receiver domain-containing protein  31.58 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.720265  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0119  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0743  response regulator receiver protein  25.98 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2657  response regulator receiver protein  29.25 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0140925  normal  0.150861 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26471  two-component response regulator  27.05 
 
 		 268 aa  54.3  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.889517 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0758  response regulator receiver protein  26.23 
 
 		 132 aa  54.3  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540632 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2749  two component transcriptional regulator  28.15 
 
 		 241 aa  53.9  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000593879  unclonable  0.00000330773 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2281  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 280 aa  53.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.217898  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2161  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  25.66 
 
 		 1020 aa  53.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0428251  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5215  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.5 
 
 		 217 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1942  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 280 aa  53.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2468  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.52 
 
 		 1049 aa  53.9  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.858637  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0511  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  30.77 
 
 		 234 aa  52.8  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.473137 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5158  transcriptional regulator, XRE family  26.61 
 
 		 198 aa  52.8  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.503819  normal  0.690311 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0640  two component transcriptional regulator  30.19 
 
 		 233 aa  52.8  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772339  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1963  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.05 
 
 		 246 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.470012 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1936  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.05 
 
 		 246 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1498  two component transcriptional regulator  27.05 
 
 		 247 aa  52.4  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  28.57 
 
 		 969 aa  52.4  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2202  histidine kinase  32.46 
 
 		 613 aa  52.4  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.143763  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4134  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 503 aa  52.4  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.518236  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1893  two component transcriptional regulator  31.67 
 
 		 235 aa  52.4  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1917  two component transcriptional regulator  28.23 
 
 		 238 aa  52  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.332821 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2378  two component transcriptional regulator  26.23 
 
 		 262 aa  52  0.000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.936352 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2743  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 		 395 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5207  winged helix family two component transcriptional regulator  27.05 
 
 		 247 aa  51.6  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0976  DNA-binding response regulator  25.2 
 
 		 222 aa  51.6  0.000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0839  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.6 
 
 		 1207 aa  51.6  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0314  two component transcriptional regulator  27.78 
 
 		 259 aa  52  0.000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.645458  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.4 
 
 		 237 aa  51.6  0.000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4937  two component transcriptional regulator  27.87 
 
 		 257 aa  52  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3359  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 		 395 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1597  two component transcriptional regulator  26.72 
 
 		 237 aa  51.6  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0124  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 		 470 aa  51.6  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1861  putative PAS/PAC sensor protein  29.75 
 
 		 280 aa  51.6  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4918  two component transcriptional regulator  30.77 
 
 		 234 aa  51.6  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.134814 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01561  two-component response regulator  27.05 
 
 		 260 aa  51.6  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.22181  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.48 
 
 		 326 aa  51.2  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  28 
 
 		 1347 aa  51.2  0.000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0483  two component transcriptional regulator  26.83 
 
 		 229 aa  51.2  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3637  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.41 
 
 		 246 aa  51.2  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2188  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 		 384 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00677544 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5261  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.25 
 
 		 237 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0893  winged helix family two component transcriptional regulator  28.85 
 
 		 233 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1597  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  28.57 
 
 		 981 aa  50.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000711164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1398  response regulator receiver protein  26.72 
 
 		 123 aa  50.1  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8084  response regulator receiver protein  31.09 
 
 		 124 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2648  two component transcriptional regulator  25.47 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2704  response regulator receiver  25.47 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01471  two-component response regulator  27.05 
 
 		 260 aa  50.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.37604  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0095  two component transcriptional regulator  27.97 
 
 		 224 aa  50.1  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0130  two component transcriptional regulator  27.05 
 
 		 260 aa  50.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.907894  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2514  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.8 
 
 		 869 aa  50.1  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  27.62 
 
 		 971 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0781  two component transcriptional regulator  28.85 
 
 		 233 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.174075 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2540  two component transcriptional regulator  26.98 
 
 		 228 aa  50.1  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0509  two component transcriptional regulator  25.81 
 
 		 232 aa  50.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0638  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 453 aa  50.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2299  response regulator receiver protein  27.64 
 
 		 275 aa  50.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0218685  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01451  two-component response regulator  27.05 
 
 		 260 aa  50.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.480778  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1785  response regulator receiver protein  31.78 
 
 		 120 aa  50.4  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0637089  normal  0.834554 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0102  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 129 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.439006  normal  0.106313 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0840  response regulator receiver protein  28.21 
 
 		 132 aa  49.3  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1494  two component transcriptional regulator  27.05 
 
 		 265 aa  49.7  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.213712  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3508  response regulator receiver  26.27 
 
 		 119 aa  49.7  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02001  two-component response regulator  27.05 
 
 		 265 aa  49.7  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.824437 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4546  two component transcriptional regulator  24.79 
 
 		 230 aa  49.7  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3979  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.62 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487116  normal  0.704163 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0932  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 		 374 aa  49.3  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3770  response regulator receiver protein  27.43 
 
 		 391 aa  49.3  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1097  response regulator receiver protein  26.45 
 
 		 131 aa  48.9  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00801176  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1220  response regulator receiver protein  25 
 
 		 130 aa  49.3  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0077  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.16 
 
 		 457 aa  49.3  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1708  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.8 
 
 		 869 aa  48.9  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0095  two component transcriptional regulator  27.05 
 
 		 249 aa  48.9  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3116  two component transcriptional regulator  27.97 
 
 		 229 aa  48.9  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.202822  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.27 
 
 		 1271 aa  49.3  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4086  response regulator receiver protein  32.46 
 
 		 123 aa  48.5  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0365078  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3742  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.41 
 
 		 263 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1737  response regulator receiver domain-containing protein  28.18 
 
 		 277 aa  48.9  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.570794  normal  0.630295 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0905  response regulator receiver protein  25.23 
 
 		 295 aa  48.9  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000245258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0614  response regulator receiver protein  25.71 
 
 		 121 aa  48.9  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>