79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0813 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0813  invasion associated locus B  100 
 
 		 214 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.181742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4589  invasion associated locus B  90.62 
 
 		 211 aa  348  4e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0898  Invasion associated locus B family protein  84.95 
 
 		 182 aa  305  3e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0222  invasion associated locus B  84.66 
 
 		 195 aa  301  5.000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0254  invasion associated locus B  76.68 
 
 		 186 aa  290  1e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4786  invasion associated locus B  97.89 
 
 		 191 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.979313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0827  hypothetical protein  77.42 
 
 		 203 aa  285  5e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.187418 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4649  invasion associated locus B family protein  77.3 
 
 		 190 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372829  normal  0.231313 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0731  invasion associated locus B family protein  71.03 
 
 		 213 aa  225  4e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0906658 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1236  Invasion associated locus B family protein  68.97 
 
 		 185 aa  218  3.9999999999999997e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0497767 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4885  invasion associated locus B family protein  66.21 
 
 		 166 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349132  normal  0.015779 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0740  invasion associated locus B  64.54 
 
 		 172 aa  203  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0566  Invasion associated locus B family protein  67.38 
 
 		 190 aa  203  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.165882 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3491  invasion associated locus B family protein  65.96 
 
 		 177 aa  201  6e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482775  normal  0.0568392 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1839  Invasion associated locus B family protein  65.22 
 
 		 166 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0465261  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0591  invasion associated locus B family protein  62.5 
 
 		 180 aa  194  6e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.04899  normal  0.0705268 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0517  invasion associated locus B family protein  62.41 
 
 		 176 aa  194  9e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0580  invasion associated locus B family protein  60.99 
 
 		 204 aa  194  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0471  hypothetical protein  62.41 
 
 		 208 aa  194  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0466  hypothetical protein  62.41 
 
 		 198 aa  193  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0641  Invasion associated locus B family protein  60.84 
 
 		 213 aa  192  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.285928 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0601  Invasion associated locus B family protein  60.84 
 
 		 213 aa  192  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0602  Invasion associated locus B family protein  62.32 
 
 		 180 aa  188  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.100157 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1038  invasion associated locus B  53.9 
 
 		 242 aa  165  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0404  invasion associated locus B family protein  38.52 
 
 		 179 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1381  invasion associated locus B family protein  33.33 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0695092  normal  0.770841 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3094  invasion associated locus B family protein  26.4 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40204 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3526  invasion associated locus B family protein  27.61 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2193  invasion associated locus B family protein  21.9 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1179  invasion associated locus B family protein  28.87 
 
 		 172 aa  57.4  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1390  invasion associated locus B family protein  30.61 
 
 		 182 aa  57  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.931817  normal  0.600355 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3384  invasion associated locus B family protein  25 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.877703 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3693  Invasion associated locus B family protein  25 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.468736  normal  0.931761 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3575  Invasion associated locus B family protein  25.71 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0837139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0356  invasion protein B  26.62 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277938  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5774  Invasion associated locus B family protein  25.71 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.295733 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2026  invasion associated locus B  30.15 
 
 		 154 aa  54.3  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.201863 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1222  invasion associated locus B  25.53 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.307395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3828  Invasion associated locus B family protein  21.05 
 
 		 187 aa  52.4  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3761  invasion associated locus B family protein  29.71 
 
 		 183 aa  52.4  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1615  hypothetical protein  24.32 
 
 		 196 aa  52.4  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.338894 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1039  invasion associated locus B family protein  29.11 
 
 		 220 aa  51.6  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0541  invasion associated locus B (IalB) protein  27.71 
 
 		 205 aa  51.6  0.000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0575  hypothetical protein  27.71 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2778  hypothetical protein  28.48 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0441  invasion associated locus B family protein  24.29 
 
 		 172 aa  50.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0581786  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1420  invasion associated locus B family protein  28.48 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3868  invasion associated locus B family protein  28.36 
 
 		 267 aa  50.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1509  invasion associated locus B  22.3 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.138245  normal  0.0458793 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2049  invasion associated locus B  22.3 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.49734  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0587  invasion associated locus B  25 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0857316  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5187  Invasion protein B  24.24 
 
 		 175 aa  49.3  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3637  invasion associated locus B family protein  28.75 
 
 		 205 aa  48.9  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2614  invasion associated locus B  22.3 
 
 		 253 aa  48.5  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0807457  normal  0.637566 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0483  invasion associated locus B family protein  25.16 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.269225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2372  hypothetical protein  25.44 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.889914  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1701  Invasion associated locus B family protein  30.25 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2942  Invasion associated locus B family protein  21.58 
 
 		 248 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4824  invasion associated locus B family protein  25 
 
 		 225 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0332961 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1698  invasion associated locus B  22.73 
 
 		 204 aa  45.4  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6313  invasion associated locus B family protein  27.41 
 
 		 253 aa  45.1  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1734  Invasion associated locus B family protein  27.27 
 
 		 221 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.228228 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2626  invasion associated locus B  20.14 
 
 		 262 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.194034  decreased coverage  0.0000348412 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3054  invasion associated locus B family protein  26.72 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7180  Invasion associated locus B family protein  26.67 
 
 		 260 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.467749  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0588  invasion associated locus B  23.53 
 
 		 149 aa  43.9  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0223596  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3254  Invasion associated locus B family protein  26.5 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3104  invasion associated locus B family protein  20.57 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1396  invasion associated locus B family protein  26.14 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.213972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3278  Invasion associated locus B family protein  25.86 
 
 		 229 aa  43.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0304  putative invasion protein B  23.94 
 
 		 204 aa  43.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760667 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1918  Invasion associated locus B family protein  26.14 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5547  Invasion associated locus B family protein  28.08 
 
 		 169 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.572174  hitchhiker  0.000199147 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1007  Invasion associated locus B family protein  22.46 
 
 		 176 aa  43.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2846  invasion associated locus B  20.44 
 
 		 263 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.798447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0706  invasion associated locus B  26.62 
 
 		 186 aa  42.4  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0942  hypothetical protein  30.56 
 
 		 179 aa  42.4  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1977  Invasion associated locus B family protein  27.27 
 
 		 171 aa  42  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5784  invasion associated locus B family protein  25 
 
 		 205 aa  41.6  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.339896  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>