66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1038 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_1038  invasion associated locus B  100 
 
 
242 aa  493  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0517  invasion associated locus B family protein  67.76 
 
 
176 aa  215  4e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0641  Invasion associated locus B family protein  66.67 
 
 
213 aa  214  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.285928 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0740  invasion associated locus B  62.13 
 
 
172 aa  214  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0601  Invasion associated locus B family protein  67.35 
 
 
213 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0466  hypothetical protein  64.58 
 
 
198 aa  202  3e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0471  hypothetical protein  64.58 
 
 
208 aa  202  3e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0580  invasion associated locus B family protein  64.79 
 
 
204 aa  202  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0222  invasion associated locus B  53.29 
 
 
195 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0254  invasion associated locus B  53.61 
 
 
186 aa  174  9e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0898  Invasion associated locus B family protein  49.19 
 
 
182 aa  174  9e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0813  invasion associated locus B  51.22 
 
 
214 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.181742  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4589  invasion associated locus B  50.88 
 
 
211 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0827  hypothetical protein  49.44 
 
 
203 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.187418 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4786  invasion associated locus B  54.23 
 
 
191 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.979313  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4649  invasion associated locus B family protein  54.61 
 
 
190 aa  166  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372829  normal  0.231313 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0731  invasion associated locus B family protein  46.02 
 
 
213 aa  163  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0906658 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0566  Invasion associated locus B family protein  48.59 
 
 
190 aa  157  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.165882 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1236  Invasion associated locus B family protein  50 
 
 
185 aa  157  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0497767 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0591  invasion associated locus B family protein  49.34 
 
 
180 aa  149  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.04899  normal  0.0705268 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0602  Invasion associated locus B family protein  49.29 
 
 
180 aa  146  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.100157 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1839  Invasion associated locus B family protein  47.48 
 
 
166 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0465261  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4885  invasion associated locus B family protein  45.39 
 
 
166 aa  142  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349132  normal  0.015779 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3491  invasion associated locus B family protein  46.81 
 
 
177 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482775  normal  0.0568392 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0404  invasion associated locus B family protein  28.99 
 
 
179 aa  95.1  9e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3526  invasion associated locus B family protein  31.32 
 
 
202 aa  69.7  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281562  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2193  invasion associated locus B family protein  26.62 
 
 
251 aa  68.9  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3384  invasion associated locus B family protein  27.54 
 
 
267 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.877703 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3693  Invasion associated locus B family protein  27.54 
 
 
267 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.468736  normal  0.931761 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3575  Invasion associated locus B family protein  27.03 
 
 
267 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0837139  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2614  invasion associated locus B  28.43 
 
 
253 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0807457  normal  0.637566 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3828  Invasion associated locus B family protein  25 
 
 
187 aa  58.2  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2049  invasion associated locus B  26.47 
 
 
250 aa  58.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.49734  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1381  invasion associated locus B family protein  27.15 
 
 
262 aa  57  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0695092  normal  0.770841 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3094  invasion associated locus B family protein  25.95 
 
 
185 aa  57.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.40204 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7180  Invasion associated locus B family protein  30.2 
 
 
260 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.467749  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1222  invasion associated locus B  25.53 
 
 
211 aa  57.4  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.307395  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6313  invasion associated locus B family protein  30.87 
 
 
253 aa  57  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1509  invasion associated locus B  26.47 
 
 
244 aa  55.5  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.138245  normal  0.0458793 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2942  Invasion associated locus B family protein  27.45 
 
 
248 aa  55.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2626  invasion associated locus B  26.47 
 
 
262 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.194034  decreased coverage  0.0000348412 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2846  invasion associated locus B  26.67 
 
 
263 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.798447  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5047  invasion associated locus B family protein  24.82 
 
 
227 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.413394  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0706  invasion associated locus B  28.49 
 
 
186 aa  52.8  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0575  hypothetical protein  25.68 
 
 
205 aa  52  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1615  hypothetical protein  24.61 
 
 
196 aa  51.2  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.338894 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4264  invasion associated locus B  24.18 
 
 
162 aa  51.2  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.536933  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0541  invasion associated locus B (IalB) protein  25.68 
 
 
205 aa  51.2  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0356  invasion protein B  23.42 
 
 
184 aa  50.1  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277938  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3637  invasion associated locus B family protein  26.21 
 
 
205 aa  49.7  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1390  invasion associated locus B family protein  25.68 
 
 
182 aa  48.5  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.931817  normal  0.600355 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5774  Invasion associated locus B family protein  26.43 
 
 
204 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.295733 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3104  invasion associated locus B family protein  25.32 
 
 
233 aa  48.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0726  invasion associated locus B  25.61 
 
 
207 aa  47  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4152  hypothetical protein  24.53 
 
 
258 aa  47  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154991  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0441  invasion associated locus B family protein  23.12 
 
 
172 aa  46.6  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0581786  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0778  invasion associated locus B family protein  23.64 
 
 
187 aa  46.6  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000182152  normal  0.361158 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1657  invasion associated locus B family protein  27.03 
 
 
257 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0264072 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0587  invasion associated locus B  23.61 
 
 
186 aa  43.5  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0857316  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1179  invasion associated locus B family protein  23.57 
 
 
172 aa  43.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0326  invasion protein B  22.99 
 
 
186 aa  42.7  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0942  hypothetical protein  27.14 
 
 
179 aa  42.7  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1039  invasion associated locus B family protein  28.87 
 
 
220 aa  42.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1007  Invasion associated locus B family protein  23.19 
 
 
176 aa  42.4  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1420  invasion associated locus B family protein  27.7 
 
 
222 aa  41.6  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2778  hypothetical protein  27.7 
 
 
222 aa  41.6  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>