89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0566 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_0566  Invasion associated locus B family protein  100 
 
 
190 aa  379  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.165882 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0602  Invasion associated locus B family protein  82.72 
 
 
180 aa  296  2e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.100157 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0591  invasion associated locus B family protein  81.05 
 
 
180 aa  290  1e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.04899  normal  0.0705268 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3491  invasion associated locus B family protein  88.73 
 
 
177 aa  265  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482775  normal  0.0568392 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4885  invasion associated locus B family protein  80.99 
 
 
166 aa  244  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349132  normal  0.015779 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1839  Invasion associated locus B family protein  82.73 
 
 
166 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0465261  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0898  Invasion associated locus B family protein  59.55 
 
 
182 aa  214  4e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0731  invasion associated locus B family protein  66.88 
 
 
213 aa  212  2.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0906658 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4649  invasion associated locus B family protein  67.61 
 
 
190 aa  211  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372829  normal  0.231313 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4589  invasion associated locus B  61.27 
 
 
211 aa  211  7e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1236  Invasion associated locus B family protein  67.38 
 
 
185 aa  207  9e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0497767 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0813  invasion associated locus B  60.69 
 
 
214 aa  205  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.181742  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0222  invasion associated locus B  64.38 
 
 
195 aa  204  7e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0466  hypothetical protein  60.98 
 
 
198 aa  203  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0254  invasion associated locus B  58.01 
 
 
186 aa  203  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0471  hypothetical protein  60.98 
 
 
208 aa  203  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4786  invasion associated locus B  65.96 
 
 
191 aa  201  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.979313  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0827  hypothetical protein  62.75 
 
 
203 aa  200  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.187418 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0580  invasion associated locus B family protein  68.7 
 
 
204 aa  196  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0740  invasion associated locus B  64.49 
 
 
172 aa  196  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0641  Invasion associated locus B family protein  59.87 
 
 
213 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.285928 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0601  Invasion associated locus B family protein  58.86 
 
 
213 aa  193  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0517  invasion associated locus B family protein  60.14 
 
 
176 aa  191  6e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1038  invasion associated locus B  51.8 
 
 
242 aa  153  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0404  invasion associated locus B family protein  36.49 
 
 
179 aa  117  7.999999999999999e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1222  invasion associated locus B  33.33 
 
 
211 aa  77  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.307395  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5774  Invasion associated locus B family protein  28.21 
 
 
204 aa  76.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.295733 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1615  hypothetical protein  31.69 
 
 
196 aa  74.7  0.0000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.338894 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1381  invasion associated locus B family protein  32.41 
 
 
262 aa  70.5  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0695092  normal  0.770841 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3526  invasion associated locus B family protein  29.14 
 
 
202 aa  69.7  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281562  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3094  invasion associated locus B family protein  28.9 
 
 
185 aa  66.2  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.40204 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0356  invasion protein B  28.96 
 
 
184 aa  62  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277938  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0587  invasion associated locus B  29.05 
 
 
186 aa  62  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0857316  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0942  hypothetical protein  33.78 
 
 
179 aa  60.8  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0541  invasion associated locus B (IalB) protein  32.11 
 
 
205 aa  58.5  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0575  hypothetical protein  32.11 
 
 
205 aa  58.5  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1039  invasion associated locus B family protein  29.25 
 
 
220 aa  57.8  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2193  invasion associated locus B family protein  30.15 
 
 
251 aa  56.6  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3637  invasion associated locus B family protein  31.48 
 
 
205 aa  56.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3104  invasion associated locus B family protein  25.81 
 
 
233 aa  56.6  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2372  hypothetical protein  29.65 
 
 
211 aa  55.1  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.889914  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2026  invasion associated locus B  29.8 
 
 
154 aa  54.7  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.201863 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1179  invasion associated locus B family protein  28.97 
 
 
172 aa  54.7  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1698  invasion associated locus B  31.25 
 
 
204 aa  54.7  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2778  hypothetical protein  27.89 
 
 
222 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1420  invasion associated locus B family protein  27.89 
 
 
222 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1390  invasion associated locus B family protein  28.21 
 
 
182 aa  54.3  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.931817  normal  0.600355 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0778  invasion associated locus B family protein  29.2 
 
 
187 aa  53.5  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000182152  normal  0.361158 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0441  invasion associated locus B family protein  26.57 
 
 
172 aa  53.1  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0581786  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3828  Invasion associated locus B family protein  27.41 
 
 
187 aa  52.4  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0726  invasion associated locus B  30.59 
 
 
207 aa  52  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0304  putative invasion protein B  28.47 
 
 
204 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760667 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3384  invasion associated locus B family protein  24.49 
 
 
267 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.877703 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3693  Invasion associated locus B family protein  24.49 
 
 
267 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.468736  normal  0.931761 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0706  invasion associated locus B  28.14 
 
 
186 aa  51.2  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0326  invasion protein B  27.08 
 
 
186 aa  51.2  0.000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1977  Invasion associated locus B family protein  27.66 
 
 
171 aa  50.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3575  Invasion associated locus B family protein  23.81 
 
 
267 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0837139  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1701  Invasion associated locus B family protein  31 
 
 
212 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1734  Invasion associated locus B family protein  32.14 
 
 
221 aa  49.3  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.228228 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1007  Invasion associated locus B family protein  24.62 
 
 
176 aa  48.9  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1918  Invasion associated locus B family protein  30.95 
 
 
219 aa  48.5  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308909  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4264  invasion associated locus B  25 
 
 
162 aa  48.5  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.536933  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5187  Invasion protein B  24.43 
 
 
175 aa  48.5  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4824  invasion associated locus B family protein  27.27 
 
 
225 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0332961 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3761  invasion associated locus B family protein  27.74 
 
 
183 aa  47.4  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0588  invasion associated locus B  24.82 
 
 
149 aa  47.4  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0223596  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3868  invasion associated locus B family protein  24.14 
 
 
267 aa  46.6  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5784  invasion associated locus B family protein  27.97 
 
 
205 aa  47  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.339896  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0483  invasion associated locus B family protein  22.88 
 
 
209 aa  45.1  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.269225  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5547  Invasion associated locus B family protein  27.82 
 
 
169 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.572174  hitchhiker  0.000199147 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1396  invasion associated locus B family protein  27.19 
 
 
209 aa  43.9  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.213972  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0450  hypothetical protein  32.08 
 
 
170 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2149  invasion associated family protein  20.99 
 
 
225 aa  44.3  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.838486  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2525  invasion associated locus B  25.45 
 
 
205 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.91457 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2792  invasion associated locus B family protein  26.62 
 
 
203 aa  43.5  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.120653 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0800  invasion associated locus B family protein  21.85 
 
 
204 aa  43.1  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1509  invasion associated locus B  19.47 
 
 
244 aa  42.7  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.138245  normal  0.0458793 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3312  hypothetical protein  31.13 
 
 
170 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2982  hypothetical protein  31.13 
 
 
170 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.337432  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2110  hypothetical protein  31.13 
 
 
170 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0255  hypothetical protein  31.13 
 
 
170 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0267  hypothetical protein  31.13 
 
 
170 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.443675  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3366  hypothetical protein  31.13 
 
 
170 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3054  invasion associated locus B family protein  25.66 
 
 
210 aa  42.4  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3297  putative invasion protein B  25.66 
 
 
210 aa  42  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284664 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3278  Invasion associated locus B family protein  24.78 
 
 
229 aa  42  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0231  hypothetical protein  31.13 
 
 
170 aa  41.6  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3254  Invasion associated locus B family protein  26.4 
 
 
236 aa  41.2  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351607  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>