81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0591 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0591  invasion associated locus B family protein  100 
 
 		 180 aa  361  2e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.04899  normal  0.0705268 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0602  Invasion associated locus B family protein  98.33 
 
 		 180 aa  356  8e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.100157 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0566  Invasion associated locus B family protein  80.63 
 
 		 190 aa  300  1e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.165882 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3491  invasion associated locus B family protein  86.62 
 
 		 177 aa  258  3e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482775  normal  0.0568392 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4885  invasion associated locus B family protein  78.23 
 
 		 166 aa  241  5e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349132  normal  0.015779 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1839  Invasion associated locus B family protein  80.58 
 
 		 166 aa  235  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0465261  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0731  invasion associated locus B family protein  64.74 
 
 		 213 aa  213  9e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0906658 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1236  Invasion associated locus B family protein  66.44 
 
 		 185 aa  208  3e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0497767 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0222  invasion associated locus B  59.76 
 
 		 195 aa  205  4e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0898  Invasion associated locus B family protein  58.93 
 
 		 182 aa  204  7e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4649  invasion associated locus B family protein  64.08 
 
 		 190 aa  204  8e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372829  normal  0.231313 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4589  invasion associated locus B  58.18 
 
 		 211 aa  200  9e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0827  hypothetical protein  59.6 
 
 		 203 aa  197  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.187418 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0254  invasion associated locus B  61.04 
 
 		 186 aa  197  7e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0813  invasion associated locus B  58.43 
 
 		 214 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.181742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4786  invasion associated locus B  60.99 
 
 		 191 aa  190  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.979313  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0466  hypothetical protein  56.55 
 
 		 198 aa  190  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0740  invasion associated locus B  55.9 
 
 		 172 aa  189  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0471  hypothetical protein  56.55 
 
 		 208 aa  190  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0601  Invasion associated locus B family protein  61.54 
 
 		 213 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0580  invasion associated locus B family protein  61.43 
 
 		 204 aa  185  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0641  Invasion associated locus B family protein  61.27 
 
 		 213 aa  185  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.285928 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0517  invasion associated locus B family protein  60 
 
 		 176 aa  181  6e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1038  invasion associated locus B  49.29 
 
 		 242 aa  146  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0404  invasion associated locus B family protein  34.56 
 
 		 179 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1615  hypothetical protein  29.53 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.338894 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5774  Invasion associated locus B family protein  26.71 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.295733 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3526  invasion associated locus B family protein  28.26 
 
 		 202 aa  64.3  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1222  invasion associated locus B  30.54 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.307395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1381  invasion associated locus B family protein  30.56 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0695092  normal  0.770841 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0356  invasion protein B  27.44 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277938  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1039  invasion associated locus B family protein  30.07 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3104  invasion associated locus B family protein  28.66 
 
 		 233 aa  57  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3094  invasion associated locus B family protein  27.88 
 
 		 185 aa  57  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40204 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1179  invasion associated locus B family protein  27.33 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2193  invasion associated locus B family protein  31.62 
 
 		 251 aa  54.7  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0441  invasion associated locus B family protein  25.48 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0581786  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0541  invasion associated locus B (IalB) protein  32.29 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1420  invasion associated locus B family protein  27.97 
 
 		 222 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2778  hypothetical protein  27.97 
 
 		 222 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0942  hypothetical protein  33.06 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0575  hypothetical protein  32.29 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0726  invasion associated locus B  28.49 
 
 		 207 aa  51.6  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2026  invasion associated locus B  28.39 
 
 		 154 aa  51.2  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.201863 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3637  invasion associated locus B family protein  31.25 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0587  invasion associated locus B  24.73 
 
 		 186 aa  50.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0857316  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4264  invasion associated locus B  22.97 
 
 		 162 aa  50.1  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.536933  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1698  invasion associated locus B  29.7 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3828  Invasion associated locus B family protein  28.15 
 
 		 187 aa  48.9  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1390  invasion associated locus B family protein  29.22 
 
 		 182 aa  48.9  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.931817  normal  0.600355 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1007  Invasion associated locus B family protein  24.62 
 
 		 176 aa  48.5  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5547  Invasion associated locus B family protein  27.41 
 
 		 169 aa  48.5  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.572174  hitchhiker  0.000199147 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5187  Invasion protein B  23.17 
 
 		 175 aa  48.1  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0778  invasion associated locus B family protein  27.64 
 
 		 187 aa  47.8  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000182152  normal  0.361158 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3384  invasion associated locus B family protein  25.37 
 
 		 267 aa  47  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.877703 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3693  Invasion associated locus B family protein  25.37 
 
 		 267 aa  47  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.468736  normal  0.931761 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3575  Invasion associated locus B family protein  24.63 
 
 		 267 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0837139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0588  invasion associated locus B  21.68 
 
 		 149 aa  45.8  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0223596  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6313  invasion associated locus B family protein  29.55 
 
 		 253 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1977  Invasion associated locus B family protein  27.68 
 
 		 171 aa  45.8  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4824  invasion associated locus B family protein  24.41 
 
 		 225 aa  44.3  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0332961 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1734  Invasion associated locus B family protein  29.76 
 
 		 221 aa  44.7  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.228228 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1918  Invasion associated locus B family protein  28.57 
 
 		 219 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5784  invasion associated locus B family protein  26.35 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.339896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0450  hypothetical protein  33.02 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0304  putative invasion protein B  25.17 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760667 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0706  invasion associated locus B  26.16 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3761  invasion associated locus B family protein  28.26 
 
 		 183 aa  43.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3868  invasion associated locus B family protein  22.22 
 
 		 267 aa  43.5  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0255  hypothetical protein  32.08 
 
 		 170 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2110  hypothetical protein  32.08 
 
 		 170 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2982  hypothetical protein  32.08 
 
 		 170 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.337432  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3312  hypothetical protein  32.08 
 
 		 170 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0326  invasion protein B  28.95 
 
 		 186 aa  42.7  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0267  hypothetical protein  32.08 
 
 		 170 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.443675  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3366  hypothetical protein  32.08 
 
 		 170 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0231  hypothetical protein  32.08 
 
 		 170 aa  42  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1701  Invasion associated locus B family protein  26.17 
 
 		 212 aa  42  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2149  invasion associated family protein  20 
 
 		 225 aa  41.2  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.838486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0800  invasion associated locus B family protein  25.58 
 
 		 204 aa  41.2  0.008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2372  hypothetical protein  23.68 
 
 		 211 aa  40.8  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.889914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>