81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1839 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1839  Invasion associated locus B family protein  100 
 
 
166 aa  330  8e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0465261  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4885  invasion associated locus B family protein  93.37 
 
 
166 aa  287  6e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349132  normal  0.015779 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3491  invasion associated locus B family protein  85.21 
 
 
177 aa  254  5e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482775  normal  0.0568392 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0566  Invasion associated locus B family protein  80.82 
 
 
190 aa  249  9.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.165882 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0591  invasion associated locus B family protein  79.05 
 
 
180 aa  245  3e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.04899  normal  0.0705268 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0602  Invasion associated locus B family protein  80.58 
 
 
180 aa  237  5e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.100157 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1236  Invasion associated locus B family protein  69.86 
 
 
185 aa  218  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0497767 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0731  invasion associated locus B family protein  68.87 
 
 
213 aa  218  3.9999999999999997e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0906658 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0222  invasion associated locus B  66.88 
 
 
195 aa  216  8.999999999999998e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0898  Invasion associated locus B family protein  65.22 
 
 
182 aa  213  8e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0254  invasion associated locus B  64.38 
 
 
186 aa  211  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0827  hypothetical protein  63.75 
 
 
203 aa  210  5.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.187418 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4589  invasion associated locus B  64.1 
 
 
211 aa  209  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4649  invasion associated locus B family protein  66.9 
 
 
190 aa  207  6e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372829  normal  0.231313 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0813  invasion associated locus B  60.98 
 
 
214 aa  207  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.181742  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4786  invasion associated locus B  65.25 
 
 
191 aa  203  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.979313  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0641  Invasion associated locus B family protein  61.97 
 
 
213 aa  190  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.285928 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0601  Invasion associated locus B family protein  61.97 
 
 
213 aa  189  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0466  hypothetical protein  62.14 
 
 
198 aa  189  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0471  hypothetical protein  62.14 
 
 
208 aa  189  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0580  invasion associated locus B family protein  62.14 
 
 
204 aa  189  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0740  invasion associated locus B  59.29 
 
 
172 aa  188  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0517  invasion associated locus B family protein  59.06 
 
 
176 aa  187  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1038  invasion associated locus B  47.48 
 
 
242 aa  144  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0404  invasion associated locus B family protein  34.93 
 
 
179 aa  115  3e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5774  Invasion associated locus B family protein  34.48 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.295733 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1381  invasion associated locus B family protein  33.33 
 
 
262 aa  71.6  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0695092  normal  0.770841 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1222  invasion associated locus B  32.86 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.307395  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3094  invasion associated locus B family protein  30.72 
 
 
185 aa  68.6  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.40204 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3526  invasion associated locus B family protein  28.28 
 
 
202 aa  68.2  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281562  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1615  hypothetical protein  28.86 
 
 
196 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.338894 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0356  invasion protein B  29.68 
 
 
184 aa  61.2  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277938  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1039  invasion associated locus B family protein  29.37 
 
 
220 aa  58.2  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3104  invasion associated locus B family protein  28.86 
 
 
233 aa  56.6  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0778  invasion associated locus B family protein  26.19 
 
 
187 aa  56.6  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000182152  normal  0.361158 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2193  invasion associated locus B family protein  29.63 
 
 
251 aa  55.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4264  invasion associated locus B  26.03 
 
 
162 aa  56.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.536933  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1179  invasion associated locus B family protein  27.34 
 
 
172 aa  55.5  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1977  Invasion associated locus B family protein  29.29 
 
 
171 aa  54.7  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3828  Invasion associated locus B family protein  30.37 
 
 
187 aa  54.7  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1698  invasion associated locus B  29.2 
 
 
204 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0541  invasion associated locus B (IalB) protein  31.19 
 
 
205 aa  53.1  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0575  hypothetical protein  31.19 
 
 
205 aa  52.8  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3637  invasion associated locus B family protein  31.19 
 
 
205 aa  52.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0441  invasion associated locus B family protein  26.99 
 
 
172 aa  52  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0581786  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1420  invasion associated locus B family protein  27.27 
 
 
222 aa  52  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2778  hypothetical protein  27.27 
 
 
222 aa  52  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2942  Invasion associated locus B family protein  27.55 
 
 
248 aa  51.2  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1509  invasion associated locus B  22.79 
 
 
244 aa  50.8  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.138245  normal  0.0458793 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2372  hypothetical protein  28.22 
 
 
211 aa  50.8  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.889914  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5547  Invasion associated locus B family protein  29.66 
 
 
169 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.572174  hitchhiker  0.000199147 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5187  Invasion protein B  24.16 
 
 
175 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0587  invasion associated locus B  26.06 
 
 
186 aa  50.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0857316  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2049  invasion associated locus B  23.53 
 
 
250 aa  50.4  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.49734  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3384  invasion associated locus B family protein  27.41 
 
 
267 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.877703 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0304  putative invasion protein B  26.39 
 
 
204 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760667 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3693  Invasion associated locus B family protein  27.41 
 
 
267 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.468736  normal  0.931761 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2614  invasion associated locus B  25.51 
 
 
253 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0807457  normal  0.637566 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0726  invasion associated locus B  31.11 
 
 
207 aa  49.7  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3575  Invasion associated locus B family protein  26.67 
 
 
267 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0837139  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0942  hypothetical protein  31.34 
 
 
179 aa  47.8  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0326  invasion protein B  26.71 
 
 
186 aa  47.4  0.00008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2026  invasion associated locus B  28.08 
 
 
154 aa  47.4  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.201863 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3761  invasion associated locus B family protein  27.21 
 
 
183 aa  46.6  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0706  invasion associated locus B  25.87 
 
 
186 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1396  invasion associated locus B family protein  30.68 
 
 
209 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.213972  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2626  invasion associated locus B  23.47 
 
 
262 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.194034  decreased coverage  0.0000348412 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1734  Invasion associated locus B family protein  31.82 
 
 
221 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.228228 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5784  invasion associated locus B family protein  26.06 
 
 
205 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.339896  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1390  invasion associated locus B family protein  26.09 
 
 
182 aa  45.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.931817  normal  0.600355 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1918  Invasion associated locus B family protein  30.68 
 
 
219 aa  45.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308909  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2149  invasion associated family protein  22.67 
 
 
225 aa  44.7  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.838486  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0483  invasion associated locus B family protein  24.36 
 
 
209 aa  44.7  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.269225  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6313  invasion associated locus B family protein  30.3 
 
 
253 aa  44.3  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1701  Invasion associated locus B family protein  29.17 
 
 
212 aa  44.3  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2846  invasion associated locus B  23.53 
 
 
263 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.798447  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4824  invasion associated locus B family protein  25 
 
 
225 aa  43.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0332961 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0588  invasion associated locus B  24.46 
 
 
149 aa  43.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0223596  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4152  hypothetical protein  26.73 
 
 
258 aa  42  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154991  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2792  invasion associated locus B family protein  26.67 
 
 
203 aa  42  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.120653 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3254  Invasion associated locus B family protein  25.21 
 
 
236 aa  40.8  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351607  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>