61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3693 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_3384  invasion associated locus B family protein  99.63 
 
 
267 aa  531  1e-150  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.877703 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3693  Invasion associated locus B family protein  100 
 
 
267 aa  533  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.468736  normal  0.931761 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3575  Invasion associated locus B family protein  94.76 
 
 
267 aa  395  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0837139  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1657  invasion associated locus B family protein  82.78 
 
 
257 aa  295  4e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0264072 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7180  Invasion associated locus B family protein  69.23 
 
 
260 aa  246  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.467749  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6313  invasion associated locus B family protein  69.61 
 
 
253 aa  246  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2193  invasion associated locus B family protein  61.76 
 
 
251 aa  211  7.999999999999999e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3828  Invasion associated locus B family protein  58.43 
 
 
187 aa  211  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2626  invasion associated locus B  40.78 
 
 
262 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.194034  decreased coverage  0.0000348412 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2942  Invasion associated locus B family protein  40.45 
 
 
248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2846  invasion associated locus B  41.21 
 
 
263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.798447  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4152  hypothetical protein  38.58 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154991  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2614  invasion associated locus B  40.48 
 
 
253 aa  125  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0807457  normal  0.637566 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1509  invasion associated locus B  39.43 
 
 
244 aa  124  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.138245  normal  0.0458793 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2049  invasion associated locus B  37.08 
 
 
250 aa  123  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.49734  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0541  invasion associated locus B (IalB) protein  32.57 
 
 
205 aa  102  6e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0575  hypothetical protein  32.18 
 
 
205 aa  101  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3637  invasion associated locus B family protein  32.57 
 
 
205 aa  99.4  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1396  invasion associated locus B family protein  34.94 
 
 
209 aa  97.8  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.213972  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1698  invasion associated locus B  30.46 
 
 
204 aa  87  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2372  hypothetical protein  26.87 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.889914  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0601  Invasion associated locus B family protein  30.64 
 
 
213 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0641  Invasion associated locus B family protein  30.91 
 
 
213 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.285928 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1734  Invasion associated locus B family protein  28.32 
 
 
221 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.228228 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1918  Invasion associated locus B family protein  28.32 
 
 
219 aa  79.3  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308909  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0471  hypothetical protein  30.41 
 
 
208 aa  78.2  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0466  hypothetical protein  30.41 
 
 
198 aa  78.6  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0580  invasion associated locus B family protein  30.5 
 
 
204 aa  73.6  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0517  invasion associated locus B family protein  30.08 
 
 
176 aa  73.6  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0740  invasion associated locus B  29.37 
 
 
172 aa  72.4  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0800  invasion associated locus B family protein  26.83 
 
 
204 aa  68.9  0.00000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1038  invasion associated locus B  27.61 
 
 
242 aa  66.2  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3868  invasion associated locus B family protein  28.81 
 
 
267 aa  65.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0587  invasion associated locus B  31.11 
 
 
186 aa  59.7  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0857316  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4589  invasion associated locus B  25 
 
 
211 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0898  Invasion associated locus B family protein  24.26 
 
 
182 aa  56.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4649  invasion associated locus B family protein  25.74 
 
 
190 aa  55.8  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372829  normal  0.231313 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4786  invasion associated locus B  25 
 
 
191 aa  56.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.979313  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0813  invasion associated locus B  25 
 
 
214 aa  55.8  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.181742  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0222  invasion associated locus B  24.26 
 
 
195 aa  55.5  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0827  hypothetical protein  25 
 
 
203 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.187418 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0254  invasion associated locus B  24.26 
 
 
186 aa  54.7  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1236  Invasion associated locus B family protein  26.06 
 
 
185 aa  53.9  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0497767 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0441  invasion associated locus B family protein  33.33 
 
 
172 aa  53.1  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0581786  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0731  invasion associated locus B family protein  23.53 
 
 
213 aa  51.2  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0906658 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1179  invasion associated locus B family protein  30.37 
 
 
172 aa  50.8  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0566  Invasion associated locus B family protein  24.49 
 
 
190 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.165882 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2525  invasion associated locus B  28.15 
 
 
205 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.91457 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0356  invasion protein B  28.89 
 
 
184 aa  48.1  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277938  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0588  invasion associated locus B  28.87 
 
 
149 aa  47  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0223596  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4885  invasion associated locus B family protein  25.37 
 
 
166 aa  47  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349132  normal  0.015779 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3491  invasion associated locus B family protein  25.37 
 
 
177 aa  47  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482775  normal  0.0568392 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1839  Invasion associated locus B family protein  26.12 
 
 
166 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0465261  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3254  Invasion associated locus B family protein  24.42 
 
 
236 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351607  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0591  invasion associated locus B family protein  25.37 
 
 
180 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.04899  normal  0.0705268 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1222  invasion associated locus B  25 
 
 
211 aa  45.8  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.307395  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0602  Invasion associated locus B family protein  25.37 
 
 
180 aa  45.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.100157 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3054  invasion associated locus B family protein  25.77 
 
 
210 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3094  invasion associated locus B family protein  25.79 
 
 
185 aa  44.3  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.40204 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0404  invasion associated locus B family protein  22.76 
 
 
179 aa  42.7  0.006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0706  invasion associated locus B  34.12 
 
 
186 aa  42.4  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.488377 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>