53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2372 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2372  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  434  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.889914  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1734  Invasion associated locus B family protein  62.56 
 
 		 221 aa  280  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.228228 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1918  Invasion associated locus B family protein  71.86 
 
 		 219 aa  271  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1396  invasion associated locus B family protein  65.76 
 
 		 209 aa  263  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.213972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1698  invasion associated locus B  46.92 
 
 		 204 aa  216  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3637  invasion associated locus B family protein  52.35 
 
 		 205 aa  200  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0575  hypothetical protein  52.35 
 
 		 205 aa  199  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0541  invasion associated locus B (IalB) protein  51.76 
 
 		 205 aa  197  7e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0800  invasion associated locus B family protein  31.86 
 
 		 204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2626  invasion associated locus B  31.48 
 
 		 262 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.194034  decreased coverage  0.0000348412 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2942  Invasion associated locus B family protein  30.25 
 
 		 248 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2049  invasion associated locus B  30.36 
 
 		 250 aa  86.7  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.49734  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2614  invasion associated locus B  29.63 
 
 		 253 aa  85.9  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0807457  normal  0.637566 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2846  invasion associated locus B  30.12 
 
 		 263 aa  85.5  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.798447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6313  invasion associated locus B family protein  32.52 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4152  hypothetical protein  29.24 
 
 		 258 aa  83.2  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1509  invasion associated locus B  28.31 
 
 		 244 aa  82.8  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.138245  normal  0.0458793 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3828  Invasion associated locus B family protein  29.76 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3693  Invasion associated locus B family protein  29.09 
 
 		 267 aa  81.6  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.468736  normal  0.931761 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3384  invasion associated locus B family protein  29.09 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.877703 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3575  Invasion associated locus B family protein  29.09 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0837139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7180  Invasion associated locus B family protein  32.34 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.467749  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1657  invasion associated locus B family protein  30.91 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0264072 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2193  invasion associated locus B family protein  28.66 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0441  invasion associated locus B family protein  26.95 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0581786  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1222  invasion associated locus B  26.24 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.307395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0356  invasion protein B  28 
 
 		 184 aa  58.2  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277938  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4649  invasion associated locus B family protein  27.68 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372829  normal  0.231313 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0580  invasion associated locus B family protein  24.62 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0466  hypothetical protein  25.89 
 
 		 198 aa  51.6  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0898  Invasion associated locus B family protein  26.97 
 
 		 182 aa  51.6  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0222  invasion associated locus B  26.22 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0471  hypothetical protein  25.89 
 
 		 208 aa  51.6  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4589  invasion associated locus B  25.29 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0517  invasion associated locus B family protein  24.56 
 
 		 176 aa  50.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0601  Invasion associated locus B family protein  23.26 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0641  Invasion associated locus B family protein  23.26 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.285928 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0740  invasion associated locus B  27.71 
 
 		 172 aa  50.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0254  invasion associated locus B  26.38 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4786  invasion associated locus B  25.44 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.979313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0566  Invasion associated locus B family protein  27.68 
 
 		 190 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.165882 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0827  hypothetical protein  24.69 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.187418 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0813  invasion associated locus B  25.44 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.181742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0731  invasion associated locus B family protein  23.68 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0906658 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4885  invasion associated locus B family protein  28 
 
 		 166 aa  47  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349132  normal  0.015779 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1179  invasion associated locus B family protein  24.24 
 
 		 172 aa  47  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3526  invasion associated locus B family protein  27.44 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2525  invasion associated locus B  24.11 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.91457 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1839  Invasion associated locus B family protein  28 
 
 		 166 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0465261  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3491  invasion associated locus B family protein  24.56 
 
 		 177 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482775  normal  0.0568392 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3094  invasion associated locus B family protein  26.87 
 
 		 185 aa  46.2  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40204 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1236  Invasion associated locus B family protein  22.81 
 
 		 185 aa  44.7  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0497767 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0778  invasion associated locus B family protein  26.92 
 
 		 187 aa  43.1  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000182152  normal  0.361158 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>