80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0827 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0827  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  408  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.187418 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4589  invasion associated locus B  86.06 
 
 		 211 aa  289  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0898  Invasion associated locus B family protein  76.88 
 
 		 182 aa  287  6e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0222  invasion associated locus B  79.23 
 
 		 195 aa  287  9e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0254  invasion associated locus B  83.63 
 
 		 186 aa  286  2e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0813  invasion associated locus B  77.42 
 
 		 214 aa  285  4e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.181742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4786  invasion associated locus B  93.66 
 
 		 191 aa  281  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.979313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4649  invasion associated locus B family protein  80.14 
 
 		 190 aa  242  3e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372829  normal  0.231313 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0731  invasion associated locus B family protein  59.9 
 
 		 213 aa  233  1.0000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0906658 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1236  Invasion associated locus B family protein  69.33 
 
 		 185 aa  226  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0497767 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4885  invasion associated locus B family protein  65.75 
 
 		 166 aa  206  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349132  normal  0.015779 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0740  invasion associated locus B  57.4 
 
 		 172 aa  205  4e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3491  invasion associated locus B family protein  65.96 
 
 		 177 aa  201  4e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482775  normal  0.0568392 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0471  hypothetical protein  60.67 
 
 		 208 aa  201  6e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0466  hypothetical protein  60.67 
 
 		 198 aa  200  9e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0601  Invasion associated locus B family protein  61.11 
 
 		 213 aa  198  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0566  Invasion associated locus B family protein  64.54 
 
 		 190 aa  198  6e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.165882 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0641  Invasion associated locus B family protein  59.21 
 
 		 213 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.285928 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1839  Invasion associated locus B family protein  65.22 
 
 		 166 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0465261  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0580  invasion associated locus B family protein  60.28 
 
 		 204 aa  195  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0591  invasion associated locus B family protein  60.96 
 
 		 180 aa  194  6e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.04899  normal  0.0705268 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0517  invasion associated locus B family protein  59.57 
 
 		 176 aa  192  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0602  Invasion associated locus B family protein  59.42 
 
 		 180 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.100157 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1038  invasion associated locus B  52.14 
 
 		 242 aa  163  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0404  invasion associated locus B family protein  40.74 
 
 		 179 aa  121  8e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1381  invasion associated locus B family protein  32.41 
 
 		 262 aa  68.6  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0695092  normal  0.770841 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3094  invasion associated locus B family protein  27.93 
 
 		 185 aa  68.2  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40204 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3526  invasion associated locus B family protein  27.91 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5774  Invasion associated locus B family protein  29.29 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.295733 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5187  Invasion protein B  28.65 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1179  invasion associated locus B family protein  30.43 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2193  invasion associated locus B family protein  23.36 
 
 		 251 aa  58.2  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3693  Invasion associated locus B family protein  25 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.468736  normal  0.931761 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3384  invasion associated locus B family protein  25 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.877703 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3575  Invasion associated locus B family protein  25.71 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0837139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1615  hypothetical protein  26.35 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.338894 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2026  invasion associated locus B  30.77 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.201863 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3828  Invasion associated locus B family protein  23.48 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0541  invasion associated locus B (IalB) protein  28.57 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0575  hypothetical protein  28.57 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1222  invasion associated locus B  26.76 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.307395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0356  invasion protein B  25.9 
 
 		 184 aa  52.4  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277938  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3637  invasion associated locus B family protein  29.63 
 
 		 205 aa  52  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0483  invasion associated locus B family protein  24.34 
 
 		 209 aa  52  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.269225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1390  invasion associated locus B family protein  28.26 
 
 		 182 aa  51.2  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.931817  normal  0.600355 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1698  invasion associated locus B  27.27 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0587  invasion associated locus B  26.24 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0857316  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3761  invasion associated locus B family protein  32.33 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3254  Invasion associated locus B family protein  28.8 
 
 		 236 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1039  invasion associated locus B family protein  29.29 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2049  invasion associated locus B  23.24 
 
 		 250 aa  48.5  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.49734  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1509  invasion associated locus B  23.24 
 
 		 244 aa  48.5  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.138245  normal  0.0458793 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2372  hypothetical protein  24.69 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.889914  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3278  Invasion associated locus B family protein  27.42 
 
 		 229 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1396  invasion associated locus B family protein  28.41 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.213972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0441  invasion associated locus B family protein  22.89 
 
 		 172 aa  47.8  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0581786  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3054  invasion associated locus B family protein  28.23 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1701  Invasion associated locus B family protein  31.19 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2614  invasion associated locus B  23.24 
 
 		 253 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0807457  normal  0.637566 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3104  invasion associated locus B family protein  20.86 
 
 		 233 aa  46.2  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1007  Invasion associated locus B family protein  24.46 
 
 		 176 aa  45.8  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1734  Invasion associated locus B family protein  27.27 
 
 		 221 aa  45.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.228228 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0942  hypothetical protein  32.41 
 
 		 179 aa  45.4  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0588  invasion associated locus B  26.72 
 
 		 149 aa  45.4  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0223596  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0706  invasion associated locus B  26.19 
 
 		 186 aa  45.4  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2778  hypothetical protein  27.14 
 
 		 222 aa  45.1  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1420  invasion associated locus B family protein  27.14 
 
 		 222 aa  45.1  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3868  invasion associated locus B family protein  23.13 
 
 		 267 aa  45.1  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6313  invasion associated locus B family protein  29.63 
 
 		 253 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2942  Invasion associated locus B family protein  22.77 
 
 		 248 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1918  Invasion associated locus B family protein  26.14 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5547  Invasion associated locus B family protein  28.08 
 
 		 169 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.572174  hitchhiker  0.000199147 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1977  Invasion associated locus B family protein  29.03 
 
 		 171 aa  43.5  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7180  Invasion associated locus B family protein  28.89 
 
 		 260 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.467749  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0304  putative invasion protein B  23.61 
 
 		 204 aa  42.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760667 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4824  invasion associated locus B family protein  24.77 
 
 		 225 aa  42.7  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0332961 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4264  invasion associated locus B  23.23 
 
 		 162 aa  42  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.536933  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0800  invasion associated locus B family protein  26.75 
 
 		 204 aa  42  0.006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2626  invasion associated locus B  20.79 
 
 		 262 aa  42  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.194034  decreased coverage  0.0000348412 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5047  invasion associated locus B family protein  25.17 
 
 		 227 aa  41.6  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.413394  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>