51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2778 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1420  invasion associated locus B family protein  100 
 
 		 222 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2778  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1039  invasion associated locus B family protein  92.13 
 
 		 220 aa  347  8e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1222  invasion associated locus B  48.11 
 
 		 211 aa  164  8e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.307395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1615  hypothetical protein  41.9 
 
 		 196 aa  160  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.338894 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1381  invasion associated locus B family protein  41.72 
 
 		 262 aa  134  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0695092  normal  0.770841 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2149  invasion associated family protein  35.06 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.838486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3526  invasion associated locus B family protein  29.22 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1236  Invasion associated locus B family protein  28.87 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0497767 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0731  invasion associated locus B family protein  27.44 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0906658 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3491  invasion associated locus B family protein  28.67 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482775  normal  0.0568392 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0813  invasion associated locus B  28.48 
 
 		 214 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.181742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0356  invasion protein B  28.57 
 
 		 184 aa  53.9  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277938  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0566  Invasion associated locus B family protein  27.89 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.165882 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0591  invasion associated locus B family protein  27.97 
 
 		 180 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.04899  normal  0.0705268 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0706  invasion associated locus B  29.81 
 
 		 186 aa  53.5  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0602  Invasion associated locus B family protein  27.97 
 
 		 180 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.100157 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4885  invasion associated locus B family protein  27.97 
 
 		 166 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349132  normal  0.015779 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4649  invasion associated locus B family protein  27.27 
 
 		 190 aa  52.4  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372829  normal  0.231313 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1839  Invasion associated locus B family protein  27.27 
 
 		 166 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0465261  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0441  invasion associated locus B family protein  28.77 
 
 		 172 aa  52.4  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0581786  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0898  Invasion associated locus B family protein  28.17 
 
 		 182 aa  52  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3094  invasion associated locus B family protein  26.8 
 
 		 185 aa  52.4  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40204 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0517  invasion associated locus B family protein  27.21 
 
 		 176 aa  52  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1179  invasion associated locus B family protein  26.53 
 
 		 172 aa  52  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4589  invasion associated locus B  26.5 
 
 		 211 aa  52  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1734  Invasion associated locus B family protein  26.71 
 
 		 221 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.228228 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0222  invasion associated locus B  27.46 
 
 		 195 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0601  Invasion associated locus B family protein  25.85 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1918  Invasion associated locus B family protein  26.03 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0740  invasion associated locus B  28.38 
 
 		 172 aa  49.7  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4786  invasion associated locus B  27.46 
 
 		 191 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.979313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0254  invasion associated locus B  26.76 
 
 		 186 aa  49.3  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0641  Invasion associated locus B family protein  25.17 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.285928 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1007  Invasion associated locus B family protein  28.47 
 
 		 176 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0827  hypothetical protein  26.76 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.187418 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1698  invasion associated locus B  24.16 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0471  hypothetical protein  25.91 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0466  hypothetical protein  25.91 
 
 		 198 aa  47.4  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5774  Invasion associated locus B family protein  26.53 
 
 		 204 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.295733 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0580  invasion associated locus B family protein  27.78 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1396  invasion associated locus B family protein  23.33 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.213972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1038  invasion associated locus B  27.7 
 
 		 242 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2026  invasion associated locus B  27.27 
 
 		 154 aa  44.7  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.201863 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5187  Invasion protein B  26.95 
 
 		 175 aa  42.7  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3575  Invasion associated locus B family protein  23.74 
 
 		 267 aa  42.7  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0837139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1701  Invasion associated locus B family protein  28.06 
 
 		 212 aa  42.7  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0778  invasion associated locus B family protein  24.82 
 
 		 187 aa  42.4  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000182152  normal  0.361158 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3384  invasion associated locus B family protein  24.46 
 
 		 267 aa  42  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.877703 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0541  invasion associated locus B (IalB) protein  22.07 
 
 		 205 aa  41.6  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4824  invasion associated locus B family protein  29.46 
 
 		 225 aa  41.6  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0332961 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>