52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3094 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3094  invasion associated locus B family protein  100 
 
 		 185 aa  379  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40204 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0222  invasion associated locus B  30.51 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0827  hypothetical protein  27.93 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.187418 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0898  Invasion associated locus B family protein  28.02 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0731  invasion associated locus B family protein  28.49 
 
 		 213 aa  67  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0906658 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4589  invasion associated locus B  26.37 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0254  invasion associated locus B  29.94 
 
 		 186 aa  67  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1222  invasion associated locus B  29.73 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.307395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0566  Invasion associated locus B family protein  28.36 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.165882 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1236  Invasion associated locus B family protein  27.34 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0497767 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0641  Invasion associated locus B family protein  26.16 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.285928 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4649  invasion associated locus B family protein  29.01 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372829  normal  0.231313 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0813  invasion associated locus B  26.4 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.181742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0601  Invasion associated locus B family protein  25.18 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0740  invasion associated locus B  25.35 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1839  Invasion associated locus B family protein  28.68 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0465261  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4786  invasion associated locus B  27.14 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.979313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4885  invasion associated locus B family protein  27.94 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349132  normal  0.015779 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0471  hypothetical protein  26.99 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0517  invasion associated locus B family protein  25.71 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0466  hypothetical protein  26.99 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3491  invasion associated locus B family protein  26.47 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482775  normal  0.0568392 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5774  Invasion associated locus B family protein  24.74 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.295733 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0580  invasion associated locus B family protein  27.66 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0541  invasion associated locus B (IalB) protein  32.22 
 
 		 205 aa  57  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0575  hypothetical protein  32.22 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0591  invasion associated locus B family protein  28.08 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.04899  normal  0.0705268 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0602  Invasion associated locus B family protein  26.87 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.100157 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1381  invasion associated locus B family protein  29.37 
 
 		 262 aa  53.9  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0695092  normal  0.770841 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1977  Invasion associated locus B family protein  28.97 
 
 		 171 aa  53.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3637  invasion associated locus B family protein  32.22 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1038  invasion associated locus B  24.29 
 
 		 242 aa  52.4  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1420  invasion associated locus B family protein  27.46 
 
 		 222 aa  52  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2778  hypothetical protein  27.46 
 
 		 222 aa  52  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1039  invasion associated locus B family protein  27.27 
 
 		 220 aa  51.6  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3526  invasion associated locus B family protein  29.33 
 
 		 202 aa  48.9  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0304  putative invasion protein B  21.48 
 
 		 204 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760667 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5784  invasion associated locus B family protein  26.85 
 
 		 205 aa  47.8  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.339896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0726  invasion associated locus B  25.79 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2372  hypothetical protein  26.87 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.889914  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1615  hypothetical protein  25.53 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.338894 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2792  invasion associated locus B family protein  28.67 
 
 		 203 aa  45.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.120653 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0326  invasion protein B  23.45 
 
 		 186 aa  44.7  0.0007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0587  invasion associated locus B  24.11 
 
 		 186 aa  43.9  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0857316  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5187  Invasion protein B  27.33 
 
 		 175 aa  43.5  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1918  Invasion associated locus B family protein  27.71 
 
 		 219 aa  42.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2026  invasion associated locus B  25 
 
 		 154 aa  42.4  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.201863 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3828  Invasion associated locus B family protein  23.57 
 
 		 187 aa  42.4  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1734  Invasion associated locus B family protein  26.51 
 
 		 221 aa  42.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.228228 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0588  invasion associated locus B  28.43 
 
 		 149 aa  41.2  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0223596  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3575  Invasion associated locus B family protein  24.44 
 
 		 267 aa  41.2  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0837139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3104  invasion associated locus B family protein  23.9 
 
 		 233 aa  40.8  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>