43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1615 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1615  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  394  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.338894 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1039  invasion associated locus B family protein  49.32 
 
 		 220 aa  145  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2778  hypothetical protein  47.97 
 
 		 222 aa  141  7e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1420  invasion associated locus B family protein  47.97 
 
 		 222 aa  141  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1381  invasion associated locus B family protein  42.48 
 
 		 262 aa  120  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0695092  normal  0.770841 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1222  invasion associated locus B  39.02 
 
 		 211 aa  114  8.999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.307395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2149  invasion associated family protein  34.76 
 
 		 225 aa  89.7  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.838486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3491  invasion associated locus B family protein  31.51 
 
 		 177 aa  71.6  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482775  normal  0.0568392 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0566  Invasion associated locus B family protein  30.61 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.165882 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0591  invasion associated locus B family protein  29.53 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.04899  normal  0.0705268 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0602  Invasion associated locus B family protein  29.37 
 
 		 180 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.100157 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4885  invasion associated locus B family protein  29.53 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349132  normal  0.015779 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1839  Invasion associated locus B family protein  28.67 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0465261  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0731  invasion associated locus B family protein  27.7 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0906658 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4649  invasion associated locus B family protein  26.03 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372829  normal  0.231313 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1236  Invasion associated locus B family protein  26.35 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0497767 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0827  hypothetical protein  26.35 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.187418 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0441  invasion associated locus B family protein  27.7 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0581786  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0898  Invasion associated locus B family protein  25.16 
 
 		 182 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0641  Invasion associated locus B family protein  23.57 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.285928 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0601  Invasion associated locus B family protein  23.6 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0471  hypothetical protein  25.19 
 
 		 208 aa  53.1  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0580  invasion associated locus B family protein  25.19 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0466  hypothetical protein  25.19 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0222  invasion associated locus B  24.32 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4589  invasion associated locus B  25.68 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0813  invasion associated locus B  24.32 
 
 		 214 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.181742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0254  invasion associated locus B  24.32 
 
 		 186 aa  52.4  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0740  invasion associated locus B  23.94 
 
 		 172 aa  52.4  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0517  invasion associated locus B family protein  22.54 
 
 		 176 aa  52.8  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4786  invasion associated locus B  24.14 
 
 		 191 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.979313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5774  Invasion associated locus B family protein  26 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.295733 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1179  invasion associated locus B family protein  27.52 
 
 		 172 aa  50.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3526  invasion associated locus B family protein  25.49 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1038  invasion associated locus B  23.94 
 
 		 242 aa  48.5  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1007  Invasion associated locus B family protein  28.67 
 
 		 176 aa  48.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0800  invasion associated locus B family protein  26.27 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0778  invasion associated locus B family protein  23.16 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000182152  normal  0.361158 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0356  invasion protein B  26.62 
 
 		 184 aa  47.4  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277938  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3094  invasion associated locus B family protein  25.53 
 
 		 185 aa  46.2  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40204 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0587  invasion associated locus B  28.33 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0857316  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2193  invasion associated locus B family protein  33.33 
 
 		 251 aa  44.7  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0706  invasion associated locus B  26.52 
 
 		 186 aa  41.2  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.488377 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>