67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0588 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0588  invasion associated locus B  100 
 
 
149 aa  301  2.0000000000000002e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0223596  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0441  invasion associated locus B family protein  37.16 
 
 
172 aa  78.2  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0581786  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0587  invasion associated locus B  35.42 
 
 
186 aa  74.7  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0857316  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1179  invasion associated locus B family protein  34.93 
 
 
172 aa  73.9  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0356  invasion protein B  36.49 
 
 
184 aa  72.8  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277938  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0706  invasion associated locus B  33.56 
 
 
186 aa  70.9  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5547  Invasion associated locus B family protein  30.99 
 
 
169 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.572174  hitchhiker  0.000199147 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0601  Invasion associated locus B family protein  26.21 
 
 
213 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5187  Invasion protein B  30.41 
 
 
175 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0641  Invasion associated locus B family protein  25.17 
 
 
213 aa  61.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.285928 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0517  invasion associated locus B family protein  23.78 
 
 
176 aa  61.2  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0326  invasion protein B  29.25 
 
 
186 aa  61.2  0.000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1701  Invasion associated locus B family protein  28.57 
 
 
212 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4649  invasion associated locus B family protein  25.71 
 
 
190 aa  58.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372829  normal  0.231313 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5047  invasion associated locus B family protein  26.9 
 
 
227 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.413394  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1007  Invasion associated locus B family protein  32.61 
 
 
176 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0566  Invasion associated locus B family protein  24.82 
 
 
190 aa  57  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.165882 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5774  Invasion associated locus B family protein  35.96 
 
 
204 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.295733 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3828  Invasion associated locus B family protein  27.07 
 
 
187 aa  55.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0740  invasion associated locus B  24.09 
 
 
172 aa  55.5  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0580  invasion associated locus B family protein  25 
 
 
204 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4824  invasion associated locus B family protein  26.52 
 
 
225 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0332961 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0827  hypothetical protein  26.72 
 
 
203 aa  54.3  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.187418 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0222  invasion associated locus B  27.59 
 
 
195 aa  53.5  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0471  hypothetical protein  23.45 
 
 
208 aa  53.9  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0898  Invasion associated locus B family protein  23.78 
 
 
182 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0254  invasion associated locus B  23.91 
 
 
186 aa  53.5  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0466  hypothetical protein  23.78 
 
 
198 aa  53.5  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0591  invasion associated locus B family protein  21.68 
 
 
180 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.04899  normal  0.0705268 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0602  Invasion associated locus B family protein  21.58 
 
 
180 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.100157 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0813  invasion associated locus B  23.53 
 
 
214 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.181742  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4589  invasion associated locus B  23.7 
 
 
211 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4786  invasion associated locus B  23.7 
 
 
191 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.979313  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2193  invasion associated locus B family protein  23.7 
 
 
251 aa  52  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1839  Invasion associated locus B family protein  24.46 
 
 
166 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0465261  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4885  invasion associated locus B family protein  24.46 
 
 
166 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349132  normal  0.015779 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3491  invasion associated locus B family protein  22.46 
 
 
177 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482775  normal  0.0568392 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1615  hypothetical protein  27.89 
 
 
196 aa  50.8  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.338894 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3278  Invasion associated locus B family protein  28.35 
 
 
229 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3054  invasion associated locus B family protein  27.56 
 
 
210 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0731  invasion associated locus B family protein  23.93 
 
 
213 aa  49.7  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0906658 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1236  Invasion associated locus B family protein  22.14 
 
 
185 aa  49.7  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0497767 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0404  invasion associated locus B family protein  28.68 
 
 
179 aa  49.3  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3575  Invasion associated locus B family protein  24.06 
 
 
267 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0837139  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3384  invasion associated locus B family protein  23.31 
 
 
267 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.877703 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2792  invasion associated locus B family protein  24.26 
 
 
203 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.120653 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3094  invasion associated locus B family protein  29.73 
 
 
185 aa  48.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.40204 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3254  Invasion associated locus B family protein  26.81 
 
 
236 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351607  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3693  Invasion associated locus B family protein  23.31 
 
 
267 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.468736  normal  0.931761 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0778  invasion associated locus B family protein  28.57 
 
 
187 aa  47.4  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000182152  normal  0.361158 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1038  invasion associated locus B  20.86 
 
 
242 aa  47  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1698  invasion associated locus B  27.5 
 
 
204 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1918  Invasion associated locus B family protein  36.25 
 
 
219 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308909  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1734  Invasion associated locus B family protein  35 
 
 
221 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.228228 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1977  Invasion associated locus B family protein  28.15 
 
 
171 aa  44.7  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0541  invasion associated locus B (IalB) protein  26.58 
 
 
205 aa  44.3  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0575  hypothetical protein  26.58 
 
 
205 aa  44.3  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3637  invasion associated locus B family protein  26.32 
 
 
205 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2372  hypothetical protein  30.19 
 
 
211 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.889914  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5784  invasion associated locus B family protein  29.68 
 
 
205 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.339896  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2049  invasion associated locus B  27.07 
 
 
250 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.49734  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2149  invasion associated family protein  29.61 
 
 
225 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.838486  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3526  invasion associated locus B family protein  24.64 
 
 
202 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281562  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1509  invasion associated locus B  26.32 
 
 
244 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.138245  normal  0.0458793 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1396  invasion associated locus B family protein  31.58 
 
 
209 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.213972  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2614  invasion associated locus B  24.81 
 
 
253 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0807457  normal  0.637566 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1039  invasion associated locus B family protein  25.71 
 
 
220 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>