46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3054 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3278  Invasion associated locus B family protein  99.05 
 
 		 229 aa  417  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3054  invasion associated locus B family protein  100 
 
 		 210 aa  416  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3254  Invasion associated locus B family protein  94.19 
 
 		 236 aa  308  5e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1701  Invasion associated locus B family protein  63.5 
 
 		 212 aa  192  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5047  invasion associated locus B family protein  57.14 
 
 		 227 aa  189  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.413394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4824  invasion associated locus B family protein  57.46 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0332961 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0706  invasion associated locus B  51.39 
 
 		 186 aa  164  8e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1179  invasion associated locus B family protein  37.58 
 
 		 172 aa  115  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0356  invasion protein B  37.33 
 
 		 184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277938  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0441  invasion associated locus B family protein  37.67 
 
 		 172 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0581786  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0587  invasion associated locus B  32.88 
 
 		 186 aa  86.3  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0857316  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5187  Invasion protein B  32.39 
 
 		 175 aa  76.3  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5547  Invasion associated locus B family protein  30.14 
 
 		 169 aa  74.7  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.572174  hitchhiker  0.000199147 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0326  invasion protein B  26.71 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3526  invasion associated locus B family protein  26.32 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1236  Invasion associated locus B family protein  29.93 
 
 		 185 aa  58.2  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0497767 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1007  Invasion associated locus B family protein  27.74 
 
 		 176 aa  53.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3575  Invasion associated locus B family protein  26.81 
 
 		 267 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0837139  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0641  Invasion associated locus B family protein  28.67 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.285928 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3828  Invasion associated locus B family protein  35.37 
 
 		 187 aa  48.9  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3384  invasion associated locus B family protein  25.36 
 
 		 267 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.877703 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3693  Invasion associated locus B family protein  25.36 
 
 		 267 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.468736  normal  0.931761 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0588  invasion associated locus B  27.52 
 
 		 149 aa  47.4  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0223596  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0827  hypothetical protein  29.03 
 
 		 203 aa  48.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.187418 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0778  invasion associated locus B family protein  22.45 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000182152  normal  0.361158 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1039  invasion associated locus B family protein  28.08 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0731  invasion associated locus B family protein  27.01 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0906658 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0254  invasion associated locus B  25.47 
 
 		 186 aa  45.4  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0222  invasion associated locus B  28.21 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1977  Invasion associated locus B family protein  23.78 
 
 		 171 aa  44.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0898  Invasion associated locus B family protein  27.07 
 
 		 182 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4589  invasion associated locus B  26.72 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0813  invasion associated locus B  26.72 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.181742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4649  invasion associated locus B family protein  30.61 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372829  normal  0.231313 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2049  invasion associated locus B  24.46 
 
 		 250 aa  43.9  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.49734  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1222  invasion associated locus B  25.9 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.307395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1420  invasion associated locus B family protein  26.39 
 
 		 222 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2778  hypothetical protein  26.39 
 
 		 222 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4786  invasion associated locus B  25.66 
 
 		 191 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.979313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1615  hypothetical protein  25.16 
 
 		 196 aa  42.7  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.338894 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4885  invasion associated locus B family protein  24.64 
 
 		 166 aa  42  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349132  normal  0.015779 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1509  invasion associated locus B  24.64 
 
 		 244 aa  42  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.138245  normal  0.0458793 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0566  Invasion associated locus B family protein  22.54 
 
 		 190 aa  42  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.165882 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0517  invasion associated locus B family protein  25.9 
 
 		 176 aa  42  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0404  invasion associated locus B family protein  28.26 
 
 		 179 aa  41.6  0.009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1698  invasion associated locus B  29.23 
 
 		 204 aa  41.6  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>