41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3278 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3278  Invasion associated locus B family protein  100 
 
 		 229 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3054  invasion associated locus B family protein  99.05 
 
 		 210 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3254  Invasion associated locus B family protein  86.86 
 
 		 236 aa  312  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1701  Invasion associated locus B family protein  64.23 
 
 		 212 aa  192  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5047  invasion associated locus B family protein  57.82 
 
 		 227 aa  190  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.413394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4824  invasion associated locus B family protein  58.21 
 
 		 225 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0332961 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0706  invasion associated locus B  51.39 
 
 		 186 aa  165  5e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1179  invasion associated locus B family protein  37.58 
 
 		 172 aa  115  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0441  invasion associated locus B family protein  37.67 
 
 		 172 aa  108  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0581786  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0356  invasion protein B  36.67 
 
 		 184 aa  108  9.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277938  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0587  invasion associated locus B  32.88 
 
 		 186 aa  86.7  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0857316  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5187  Invasion protein B  32.39 
 
 		 175 aa  76.6  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5547  Invasion associated locus B family protein  30.14 
 
 		 169 aa  75.1  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.572174  hitchhiker  0.000199147 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0326  invasion protein B  27.81 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3526  invasion associated locus B family protein  26.32 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1236  Invasion associated locus B family protein  29.2 
 
 		 185 aa  57.8  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0497767 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1007  Invasion associated locus B family protein  27.74 
 
 		 176 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0588  invasion associated locus B  28.86 
 
 		 149 aa  49.7  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0223596  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0641  Invasion associated locus B family protein  27.97 
 
 		 213 aa  49.3  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.285928 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3828  Invasion associated locus B family protein  35.37 
 
 		 187 aa  48.5  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1039  invasion associated locus B family protein  27.4 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0827  hypothetical protein  28.23 
 
 		 203 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.187418 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0778  invasion associated locus B family protein  22.45 
 
 		 187 aa  47  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000182152  normal  0.361158 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0731  invasion associated locus B family protein  26.28 
 
 		 213 aa  46.6  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0906658 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0254  invasion associated locus B  24.84 
 
 		 186 aa  44.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0222  invasion associated locus B  27.35 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4589  invasion associated locus B  25.86 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0898  Invasion associated locus B family protein  26.32 
 
 		 182 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0813  invasion associated locus B  25.86 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.181742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2049  invasion associated locus B  24.46 
 
 		 250 aa  43.9  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.49734  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1222  invasion associated locus B  26.62 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.307395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4649  invasion associated locus B family protein  26.09 
 
 		 190 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372829  normal  0.231313 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1977  Invasion associated locus B family protein  21.9 
 
 		 171 aa  43.1  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1615  hypothetical protein  25.16 
 
 		 196 aa  43.1  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.338894 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2778  hypothetical protein  25.69 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1420  invasion associated locus B family protein  25.69 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4786  invasion associated locus B  24.78 
 
 		 191 aa  42  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.979313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1509  invasion associated locus B  24.64 
 
 		 244 aa  42  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.138245  normal  0.0458793 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0566  Invasion associated locus B family protein  21.83 
 
 		 190 aa  41.6  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.165882 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0517  invasion associated locus B family protein  25.18 
 
 		 176 aa  41.6  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0404  invasion associated locus B family protein  28.26 
 
 		 179 aa  41.6  0.01  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>