54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2942 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2942  Invasion associated locus B family protein  100 
 
 		 248 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2626  invasion associated locus B  79.39 
 
 		 262 aa  363  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.194034  decreased coverage  0.0000348412 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2846  invasion associated locus B  94.02 
 
 		 263 aa  356  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.798447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1509  invasion associated locus B  79.83 
 
 		 244 aa  348  4e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.138245  normal  0.0458793 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2614  invasion associated locus B  80.93 
 
 		 253 aa  347  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0807457  normal  0.637566 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2049  invasion associated locus B  76.23 
 
 		 250 aa  345  5e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.49734  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4152  hypothetical protein  65.76 
 
 		 258 aa  294  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3828  Invasion associated locus B family protein  43.2 
 
 		 187 aa  141  8e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2193  invasion associated locus B family protein  43.56 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3575  Invasion associated locus B family protein  40.59 
 
 		 267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0837139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3693  Invasion associated locus B family protein  39.41 
 
 		 267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.468736  normal  0.931761 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3384  invasion associated locus B family protein  39.41 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.877703 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6313  invasion associated locus B family protein  43.29 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7180  Invasion associated locus B family protein  44.58 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.467749  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1657  invasion associated locus B family protein  40.48 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0264072 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0541  invasion associated locus B (IalB) protein  34.76 
 
 		 205 aa  101  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0575  hypothetical protein  34.76 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3637  invasion associated locus B family protein  34.76 
 
 		 205 aa  99.8  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1396  invasion associated locus B family protein  33.33 
 
 		 209 aa  95.5  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.213972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1734  Invasion associated locus B family protein  33.33 
 
 		 221 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.228228 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3868  invasion associated locus B family protein  33.33 
 
 		 267 aa  93.6  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1918  Invasion associated locus B family protein  33.33 
 
 		 219 aa  93.2  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2372  hypothetical protein  30.25 
 
 		 211 aa  88.2  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.889914  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2525  invasion associated locus B  28.02 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.91457 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0800  invasion associated locus B family protein  27.06 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1698  invasion associated locus B  29.01 
 
 		 204 aa  81.6  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0641  Invasion associated locus B family protein  27.1 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.285928 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0471  hypothetical protein  25.27 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0466  hypothetical protein  25.41 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1038  invasion associated locus B  27.45 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0601  Invasion associated locus B family protein  26.38 
 
 		 213 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1839  Invasion associated locus B family protein  27.55 
 
 		 166 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0465261  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4885  invasion associated locus B family protein  27.55 
 
 		 166 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349132  normal  0.015779 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0517  invasion associated locus B family protein  25.97 
 
 		 176 aa  50.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0731  invasion associated locus B family protein  23.76 
 
 		 213 aa  49.7  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0906658 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0580  invasion associated locus B family protein  24.75 
 
 		 204 aa  48.9  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4589  invasion associated locus B  24.32 
 
 		 211 aa  48.5  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0813  invasion associated locus B  22.07 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.181742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0898  Invasion associated locus B family protein  23.84 
 
 		 182 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0222  invasion associated locus B  22.97 
 
 		 195 aa  46.2  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4786  invasion associated locus B  23.76 
 
 		 191 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.979313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4649  invasion associated locus B family protein  23.47 
 
 		 190 aa  46.2  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372829  normal  0.231313 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0778  invasion associated locus B family protein  33.33 
 
 		 187 aa  45.8  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000182152  normal  0.361158 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1236  Invasion associated locus B family protein  22.77 
 
 		 185 aa  45.8  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0497767 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0740  invasion associated locus B  23.76 
 
 		 172 aa  45.8  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0254  invasion associated locus B  22.76 
 
 		 186 aa  45.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1381  invasion associated locus B family protein  26.47 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0695092  normal  0.770841 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0587  invasion associated locus B  24.82 
 
 		 186 aa  45.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0857316  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0827  hypothetical protein  22.77 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.187418 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0441  invasion associated locus B family protein  25.36 
 
 		 172 aa  44.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0581786  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3491  invasion associated locus B family protein  23.47 
 
 		 177 aa  44.3  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482775  normal  0.0568392 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0706  invasion associated locus B  27.13 
 
 		 186 aa  43.5  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3526  invasion associated locus B family protein  23.81 
 
 		 202 aa  43.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1007  Invasion associated locus B family protein  30.95 
 
 		 176 aa  43.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>