28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2525 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2525  invasion associated locus B  100 
 
 		 205 aa  417  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.91457 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2626  invasion associated locus B  30.28 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.194034  decreased coverage  0.0000348412 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2942  Invasion associated locus B family protein  29.5 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2049  invasion associated locus B  29.58 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.49734  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1509  invasion associated locus B  28.78 
 
 		 244 aa  75.1  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.138245  normal  0.0458793 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2614  invasion associated locus B  28.17 
 
 		 253 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0807457  normal  0.637566 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2846  invasion associated locus B  28.67 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.798447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0800  invasion associated locus B family protein  29.23 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4152  hypothetical protein  28.38 
 
 		 258 aa  68.6  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1396  invasion associated locus B family protein  25.56 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.213972  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0575  hypothetical protein  28.44 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0541  invasion associated locus B (IalB) protein  28.44 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3637  invasion associated locus B family protein  28.44 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1657  invasion associated locus B family protein  33.12 
 
 		 257 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0264072 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2193  invasion associated locus B family protein  29.71 
 
 		 251 aa  53.1  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1698  invasion associated locus B  27.07 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3868  invasion associated locus B family protein  27.27 
 
 		 267 aa  52.4  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3575  Invasion associated locus B family protein  27.82 
 
 		 267 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0837139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3384  invasion associated locus B family protein  26.81 
 
 		 267 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.877703 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3693  Invasion associated locus B family protein  26.81 
 
 		 267 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.468736  normal  0.931761 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1734  Invasion associated locus B family protein  25 
 
 		 221 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.228228 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2372  hypothetical protein  24.11 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.889914  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1918  Invasion associated locus B family protein  25 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3828  Invasion associated locus B family protein  30.77 
 
 		 187 aa  46.6  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4649  invasion associated locus B family protein  29.11 
 
 		 190 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372829  normal  0.231313 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7180  Invasion associated locus B family protein  32.09 
 
 		 260 aa  43.9  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.467749  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0587  invasion associated locus B  29.6 
 
 		 186 aa  41.2  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0857316  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1222  invasion associated locus B  23.13 
 
 		 211 aa  41.6  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.307395  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>