106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3709 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3709  Flp/Fap pilin component  100 
 
 		 53 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.815351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2363  Flp/Fap pilin component  71.7 
 
 		 60 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4197  Flp/Fap pilin component  69.81 
 
 		 54 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692127  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3792  Flp/Fap pilin component  66.04 
 
 		 54 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7028  putative Flp/Fap pilin component  78.57 
 
 		 54 aa  68.2  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.779148  normal  0.931089 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0974  Flp/Fap pilin component  67.35 
 
 		 56 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179102  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1937  putative fimbriae assembly related protein  62.26 
 
 		 65 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0283045  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1764  pilin family protein  62.26 
 
 		 65 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1785  pilin family protein  62.26 
 
 		 65 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.859403  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2546  pilin, putative  60.38 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0577216  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1439  Flp/Fap pilin component  62.75 
 
 		 72 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719822  normal  0.158207 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2387  Flp/Fap pilin component  58.49 
 
 		 54 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.0065262  hitchhiker  0.00967552 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5123  Flp/Fap pilin component  56.6 
 
 		 55 aa  63.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0326494 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2824  Flp/Fap pilin component  58.49 
 
 		 56 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50451  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1796  Flp/Fap pilin component  50.98 
 
 		 54 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.655052  normal  0.0298304 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1399  Flp/Fap pilin component  56.6 
 
 		 54 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.41464  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0230  Flp/Fap pilin component  56.6 
 
 		 54 aa  60.8  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1037  Flp/Fap pilin component  54.72 
 
 		 56 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708738  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0605  Flp/Fap pilin component  56.6 
 
 		 57 aa  60.1  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.531331  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1517  Flp/Fap pilin component  54.72 
 
 		 56 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000857927  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1493  Flp/Fap pilin component  54.72 
 
 		 56 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000102149  hitchhiker  0.00000902291 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0223  component of type 4 pilus pilin subunit protein  52.83 
 
 		 61 aa  59.7  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668081  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0394  Flp/Fap pilin component  73.58 
 
 		 56 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.157546  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1406  Flp/Fap pilin component  50.94 
 
 		 54 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5316  Flp/Fap pilin component  50.94 
 
 		 58 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351071  hitchhiker  0.000566754 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2700  Flp/Fap pilin component  52.83 
 
 		 61 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.754645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4699  Flp/Fap pilin component  60 
 
 		 53 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0977464  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2477  Flp/Fap pilin component  52.83 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2405  Flp/Fap pilin component  52.83 
 
 		 64 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.842762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0304  Flp/Fap pilin component  71.7 
 
 		 55 aa  57.4  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2076  Flp/Fap pilin component  52.83 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.554715  normal  0.612928 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0652  Flp/Fap pilin component  60.87 
 
 		 57 aa  57  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1736  Flp/Fap pilin component  58.82 
 
 		 69 aa  57  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000234566  hitchhiker  0.0000333634 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4095  Flp/Fap pilin component  52.83 
 
 		 60 aa  57  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0653  Flp/Fap pilin component  59.57 
 
 		 57 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2489  Flp/Fap pilin component  52.83 
 
 		 59 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0416  Flp/Fap pilin component  56 
 
 		 52 aa  55.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4473  Flp/Fap pilin component  50.94 
 
 		 62 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.837061  normal  0.806364 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3349  Flp/Fap pilin component  52.83 
 
 		 61 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5317  Flp/Fap pilin component  52.83 
 
 		 58 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26673  hitchhiker  0.000600158 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4185  Flp/Fap pilin component  50.94 
 
 		 61 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2639  Flp/Fap pilin component  49.06 
 
 		 61 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7206  Flp/Fap pilin component  54.17 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0674219  normal  0.484443 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3517  Flp/Fap pilin component  75.47 
 
 		 78 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2088  Flp/Fap pilin component  46.94 
 
 		 54 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409092  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0222  component of type 4 pilus pilin subunit protein  47.17 
 
 		 61 aa  55.1  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4196  Flp/Fap pilin component  57.14 
 
 		 61 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2802  putative pilus subunit protein, PilA like  54.9 
 
 		 55 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.323715 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0596  Flp/Fap pilin component  54 
 
 		 56 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302138  normal  0.298198 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0597  Flp/Fap pilin component  54.9 
 
 		 55 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.41654  normal  0.29106 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3494  Flp/Fap pilin component  47.17 
 
 		 54 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4611  Flp/Fap pilin component  49.06 
 
 		 58 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.699189 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7207  Flp/Fap pilin component  48.98 
 
 		 63 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.150094  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2332  Flp/Fap pilin component  49.06 
 
 		 69 aa  53.5  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.341301  normal  0.812009 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2710  pilin, putative  49.06 
 
 		 79 aa  53.5  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3081  Flp/Fap pilin  51.06 
 
 		 48 aa  52.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2956  Flp/Fap pilin  51.06 
 
 		 48 aa  52.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4354  Flp/Fap pilin component  51.02 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4244  Flp/Fap pilin component  51.02 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272454  normal  0.405174 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1649  Flp/Fap pilin component  49.06 
 
 		 59 aa  52  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.132405  normal  0.784096 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1307  putative pilus subunit protein  51.06 
 
 		 72 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1960  Flp/Fap pilin component  41.51 
 
 		 55 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5504  Flp/Fap pilin component  48.98 
 
 		 63 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458126  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5868  Flp/Fap pilin component  48.98 
 
 		 63 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.229195 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6378  Flp/Fap pilin component  48.98 
 
 		 63 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.43993 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2075  Flp/Fap pilin component  45.28 
 
 		 58 aa  50.8  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.514501  normal  0.606618 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2264  Flp/Fap pilin component superfamily protein  50 
 
 		 72 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2191  Flp/Fap pilin component  41.51 
 
 		 56 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1527  putative Flp/Fap pilin component  57.78 
 
 		 56 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.713475  normal  0.82875 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0789  Flp/Fap pilin component  45.1 
 
 		 58 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6287  Flp/Fap pilin component  50 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00948182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2110  Flp/Fap pilin component  45.28 
 
 		 59 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3495  Flp/Fap pilin component  62.26 
 
 		 54 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0166481 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5991  Flp/Fap pilin component  50 
 
 		 60 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.848765  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02598  putative pilin protein  46.94 
 
 		 58 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191275  normal  0.495698 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1787  Flp/Fap pilin component  69.81 
 
 		 54 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.297365 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3484  Flp/Fap pilin component  56.82 
 
 		 56 aa  47  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0220876 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0283  Flp/Fap pilin component  44.19 
 
 		 54 aa  47  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.026664  normal  0.0309888 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3651  Flp/Fap pilin component  50 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0077  Flp/Fap pilin component  44.44 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256154  normal  0.964848 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4442  Flp/Fap pilin component  44.64 
 
 		 60 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1794  Flp/Fap pilin component  46.94 
 
 		 54 aa  45.4  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.55004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2928  Flp/Fap pilin component  41.18 
 
 		 101 aa  45.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.419964  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0798  Flp/Fap pilin component  41.18 
 
 		 57 aa  45.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1153  Flp/Fap pilin component  42.86 
 
 		 57 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0244089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7268  hypothetical protein  44.9 
 
 		 66 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1306  putative pilus subunit protein  59.18 
 
 		 56 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0788  Flp/Fap pilin component  51.22 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3080  putative pilus subunit protein  59.18 
 
 		 56 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2954  putative pilus subunit protein  59.18 
 
 		 56 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2643  Flp/Fap pilin component  47.06 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2263  PilA-related protein  59.18 
 
 		 56 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0720  Flp/Fap pilin component  41.3 
 
 		 60 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.915545  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2812  Flp/Fap pilin component  44.9 
 
 		 56 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2617  Flp/Fap pilin component  37.25 
 
 		 60 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4439  Flp/Fap pilin component  48.89 
 
 		 70 aa  41.6  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0309403 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0801  pilus assembly protein PilA  46.67 
 
 		 60 aa  41.6  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0651  Flp/Fap pilin component  37.74 
 
 		 57 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.151252 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2634  Flp/Fap pilin component  51.16 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.815116 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1489  Flp/Fap pilin component  60.38 
 
 		 57 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.60376 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>