51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0077 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0077  Flp/Fap pilin component  100 
 
 		 96 aa  184  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256154  normal  0.964848 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0223  component of type 4 pilus pilin subunit protein  48.39 
 
 		 61 aa  58.2  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668081  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06199  Flp pilus assembly protein  41.38 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6287  Flp/Fap pilin component  48.15 
 
 		 60 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00948182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2824  Flp/Fap pilin component  47.27 
 
 		 56 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50451  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0222  component of type 4 pilus pilin subunit protein  43.55 
 
 		 61 aa  51.2  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2387  Flp/Fap pilin component  46.3 
 
 		 54 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.0065262  hitchhiker  0.00967552 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4473  Flp/Fap pilin component  44.44 
 
 		 62 aa  50.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.837061  normal  0.806364 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4197  Flp/Fap pilin component  48.15 
 
 		 54 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692127  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5991  Flp/Fap pilin component  46.3 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.848765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7206  Flp/Fap pilin component  46.15 
 
 		 63 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0674219  normal  0.484443 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4095  Flp/Fap pilin component  54 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4196  Flp/Fap pilin component  43.64 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0230  Flp/Fap pilin component  43.4 
 
 		 54 aa  47.8  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5316  Flp/Fap pilin component  39.29 
 
 		 58 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351071  hitchhiker  0.000566754 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2076  Flp/Fap pilin component  36.76 
 
 		 68 aa  45.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.554715  normal  0.612928 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2075  Flp/Fap pilin component  42.11 
 
 		 58 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.514501  normal  0.606618 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3349  Flp/Fap pilin component  47.27 
 
 		 61 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4185  Flp/Fap pilin component  41.27 
 
 		 61 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6378  Flp/Fap pilin component  43.64 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.43993 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5868  Flp/Fap pilin component  43.64 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.229195 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5504  Flp/Fap pilin component  43.64 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458126  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7207  Flp/Fap pilin component  43.14 
 
 		 63 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.150094  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1736  Flp/Fap pilin component  39.68 
 
 		 69 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000234566  hitchhiker  0.0000333634 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2546  pilin, putative  38.6 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0577216  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0602  Flp/Fap pilin component  35.59 
 
 		 69 aa  44.7  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1439  Flp/Fap pilin component  38.18 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719822  normal  0.158207 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1937  putative fimbriae assembly related protein  38.6 
 
 		 65 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0283045  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5317  Flp/Fap pilin component  42.31 
 
 		 58 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26673  hitchhiker  0.000600158 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1785  pilin family protein  38.6 
 
 		 65 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.859403  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1764  pilin family protein  38.6 
 
 		 65 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0652  Flp/Fap pilin component  40.38 
 
 		 57 aa  45.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0789  Flp/Fap pilin component  46.15 
 
 		 58 aa  44.3  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7028  putative Flp/Fap pilin component  53.49 
 
 		 54 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.779148  normal  0.931089 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0974  Flp/Fap pilin component  41.82 
 
 		 56 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179102  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2639  Flp/Fap pilin component  40 
 
 		 61 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0653  Flp/Fap pilin component  45.1 
 
 		 57 aa  43.9  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2317  Flp/Fap pilin component  40.98 
 
 		 63 aa  43.9  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.728903  normal  0.185858 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4699  Flp/Fap pilin component  40.38 
 
 		 53 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0977464  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0597  Flp/Fap pilin component  43.75 
 
 		 55 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.41654  normal  0.29106 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2956  Flp/Fap pilin  42 
 
 		 48 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3081  Flp/Fap pilin  42 
 
 		 48 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1307  putative pilus subunit protein  40.82 
 
 		 72 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1406  Flp/Fap pilin component  43.75 
 
 		 54 aa  41.2  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0303  Flp/Fap pilin component  38.98 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4611  Flp/Fap pilin component  32.73 
 
 		 58 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.699189 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0596  Flp/Fap pilin component  38.46 
 
 		 56 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302138  normal  0.298198 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1493  Flp/Fap pilin component  56.67 
 
 		 56 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000102149  hitchhiker  0.00000902291 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1649  Flp/Fap pilin component  36.07 
 
 		 59 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.132405  normal  0.784096 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1517  Flp/Fap pilin component  56.67 
 
 		 56 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000857927  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1037  Flp/Fap pilin component  56.67 
 
 		 56 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>