45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1796 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1796  Flp/Fap pilin component  100 
 
 		 54 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.655052  normal  0.0298304 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2088  Flp/Fap pilin component  59.26 
 
 		 54 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409092  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1960  Flp/Fap pilin component  51.85 
 
 		 55 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3494  Flp/Fap pilin component  55.56 
 
 		 54 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3792  Flp/Fap pilin component  46.3 
 
 		 54 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1406  Flp/Fap pilin component  52.94 
 
 		 54 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0230  Flp/Fap pilin component  42.59 
 
 		 54 aa  53.9  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4197  Flp/Fap pilin component  42.59 
 
 		 54 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692127  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5123  Flp/Fap pilin component  43.4 
 
 		 55 aa  52.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0326494 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0974  Flp/Fap pilin component  51.02 
 
 		 56 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179102  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2191  Flp/Fap pilin component  44.44 
 
 		 56 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0416  Flp/Fap pilin component  43.14 
 
 		 52 aa  50.8  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7028  putative Flp/Fap pilin component  52.38 
 
 		 54 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.779148  normal  0.931089 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2363  Flp/Fap pilin component  43.4 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2489  Flp/Fap pilin component  41.51 
 
 		 59 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1307  putative pilus subunit protein  41.18 
 
 		 72 aa  47.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3709  Flp/Fap pilin component  49.06 
 
 		 53 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.815351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1153  Flp/Fap pilin component  50.94 
 
 		 57 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0244089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3081  Flp/Fap pilin  42.55 
 
 		 48 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2956  Flp/Fap pilin  42.55 
 
 		 48 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2264  Flp/Fap pilin component superfamily protein  42 
 
 		 72 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3349  Flp/Fap pilin component  36.73 
 
 		 61 aa  45.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0596  Flp/Fap pilin component  38 
 
 		 56 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302138  normal  0.298198 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2477  Flp/Fap pilin component  33.33 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2700  Flp/Fap pilin component  31.48 
 
 		 61 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.754645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0223  component of type 4 pilus pilin subunit protein  29.63 
 
 		 61 aa  42.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668081  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0222  component of type 4 pilus pilin subunit protein  31.48 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4196  Flp/Fap pilin component  35.19 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0595  Flp/Fap pilin component  44.68 
 
 		 56 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.311439  normal  0.298198 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2639  Flp/Fap pilin component  34 
 
 		 61 aa  42.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2802  putative pilus subunit protein, PilA like  39.62 
 
 		 55 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.323715 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1399  Flp/Fap pilin component  35.19 
 
 		 54 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.41464  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0652  Flp/Fap pilin component  38.78 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_003296  RS02598  putative pilin protein  39.62 
 
 		 58 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191275  normal  0.495698 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2110  Flp/Fap pilin component  35.85 
 
 		 59 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2405  Flp/Fap pilin component  29.63 
 
 		 64 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.842762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0605  Flp/Fap pilin component  35.19 
 
 		 57 aa  41.6  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.531331  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5868  Flp/Fap pilin component  36.84 
 
 		 63 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.229195 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6378  Flp/Fap pilin component  36.84 
 
 		 63 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.43993 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5504  Flp/Fap pilin component  36.84 
 
 		 63 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458126  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0651  Flp/Fap pilin component  40.38 
 
 		 57 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.151252 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0798  Flp/Fap pilin component  46.67 
 
 		 57 aa  40.8  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0304  Flp/Fap pilin component  48.98 
 
 		 55 aa  40.4  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2387  Flp/Fap pilin component  32.65 
 
 		 54 aa  40  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.0065262  hitchhiker  0.00967552 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4095  Flp/Fap pilin component  42.86 
 
 		 60 aa  40  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>