38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3494 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3494  Flp/Fap pilin component  100 
 
 		 54 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1960  Flp/Fap pilin component  68.52 
 
 		 55 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2088  Flp/Fap pilin component  68.52 
 
 		 54 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409092  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4197  Flp/Fap pilin component  55.56 
 
 		 54 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692127  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0974  Flp/Fap pilin component  56.6 
 
 		 56 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179102  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1796  Flp/Fap pilin component  55.56 
 
 		 54 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.655052  normal  0.0298304 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1406  Flp/Fap pilin component  55.56 
 
 		 54 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0230  Flp/Fap pilin component  47.17 
 
 		 54 aa  53.9  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1153  Flp/Fap pilin component  52.63 
 
 		 57 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0244089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3792  Flp/Fap pilin component  48.15 
 
 		 54 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7028  putative Flp/Fap pilin component  53.7 
 
 		 54 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.779148  normal  0.931089 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1787  Flp/Fap pilin component  57.41 
 
 		 54 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.297365 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2191  Flp/Fap pilin component  48.15 
 
 		 56 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2489  Flp/Fap pilin component  47.17 
 
 		 59 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0223  component of type 4 pilus pilin subunit protein  43.4 
 
 		 61 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668081  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0304  Flp/Fap pilin component  55.56 
 
 		 55 aa  47.8  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5123  Flp/Fap pilin component  47.17 
 
 		 55 aa  47.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0326494 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4196  Flp/Fap pilin component  42.59 
 
 		 61 aa  47.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0416  Flp/Fap pilin component  47.06 
 
 		 52 aa  45.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2700  Flp/Fap pilin component  37.74 
 
 		 61 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.754645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4185  Flp/Fap pilin component  40.74 
 
 		 61 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4354  Flp/Fap pilin component  42.59 
 
 		 59 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2405  Flp/Fap pilin component  39.62 
 
 		 64 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.842762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4244  Flp/Fap pilin component  42.59 
 
 		 59 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272454  normal  0.405174 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3517  Flp/Fap pilin component  51.85 
 
 		 78 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4473  Flp/Fap pilin component  40.74 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.837061  normal  0.806364 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2387  Flp/Fap pilin component  37.04 
 
 		 54 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.0065262  hitchhiker  0.00967552 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2639  Flp/Fap pilin component  38 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5316  Flp/Fap pilin component  37.74 
 
 		 58 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351071  hitchhiker  0.000566754 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0605  Flp/Fap pilin component  46 
 
 		 57 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.531331  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02598  putative pilin protein  42.59 
 
 		 58 aa  41.2  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191275  normal  0.495698 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2332  Flp/Fap pilin component  35.19 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.341301  normal  0.812009 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2710  pilin, putative  35.19 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0222  component of type 4 pilus pilin subunit protein  37.74 
 
 		 61 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2824  Flp/Fap pilin component  36.73 
 
 		 56 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50451  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3349  Flp/Fap pilin component  39.62 
 
 		 61 aa  40.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3484  Flp/Fap pilin component  52.5 
 
 		 56 aa  40.4  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0220876 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4095  Flp/Fap pilin component  39.62 
 
 		 60 aa  40.4  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>