28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1153 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1153  Flp/Fap pilin component  100 
 
 		 57 aa  110  8.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0244089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1406  Flp/Fap pilin component  64.81 
 
 		 54 aa  66.2  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3494  Flp/Fap pilin component  52.63 
 
 		 54 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1960  Flp/Fap pilin component  48.15 
 
 		 55 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4197  Flp/Fap pilin component  51.02 
 
 		 54 aa  50.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692127  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4196  Flp/Fap pilin component  44.44 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0974  Flp/Fap pilin component  52.54 
 
 		 56 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179102  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0230  Flp/Fap pilin component  44.9 
 
 		 54 aa  47.8  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2088  Flp/Fap pilin component  47.37 
 
 		 54 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409092  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0416  Flp/Fap pilin component  47.06 
 
 		 52 aa  46.6  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7028  putative Flp/Fap pilin component  61.9 
 
 		 54 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.779148  normal  0.931089 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1796  Flp/Fap pilin component  50.94 
 
 		 54 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.655052  normal  0.0298304 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3792  Flp/Fap pilin component  46.94 
 
 		 54 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0223  component of type 4 pilus pilin subunit protein  44.9 
 
 		 61 aa  43.9  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668081  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0222  component of type 4 pilus pilin subunit protein  44.9 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2639  Flp/Fap pilin component  38.46 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4185  Flp/Fap pilin component  42 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0596  Flp/Fap pilin component  40.82 
 
 		 56 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302138  normal  0.298198 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4473  Flp/Fap pilin component  42 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.837061  normal  0.806364 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0653  Flp/Fap pilin component  41.07 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3349  Flp/Fap pilin component  43.75 
 
 		 61 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2643  Flp/Fap pilin component  43.75 
 
 		 70 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5123  Flp/Fap pilin component  48.98 
 
 		 55 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0326494 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2387  Flp/Fap pilin component  38.6 
 
 		 54 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.0065262  hitchhiker  0.00967552 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2489  Flp/Fap pilin component  40.82 
 
 		 59 aa  40.8  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0605  Flp/Fap pilin component  46.94 
 
 		 57 aa  40.8  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.531331  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2824  Flp/Fap pilin component  39.29 
 
 		 56 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50451  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2363  Flp/Fap pilin component  50 
 
 		 60 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.780367 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>