63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1406 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1406  Flp/Fap pilin component  100 
 
 		 54 aa  103  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1153  Flp/Fap pilin component  64.81 
 
 		 57 aa  66.2  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0244089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0974  Flp/Fap pilin component  58.82 
 
 		 56 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179102  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4197  Flp/Fap pilin component  51.85 
 
 		 54 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692127  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3792  Flp/Fap pilin component  53.7 
 
 		 54 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3494  Flp/Fap pilin component  55.56 
 
 		 54 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2088  Flp/Fap pilin component  50 
 
 		 54 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409092  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0223  component of type 4 pilus pilin subunit protein  55.32 
 
 		 61 aa  54.7  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668081  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1796  Flp/Fap pilin component  52.94 
 
 		 54 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.655052  normal  0.0298304 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0230  Flp/Fap pilin component  48 
 
 		 54 aa  53.9  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7028  putative Flp/Fap pilin component  59.52 
 
 		 54 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.779148  normal  0.931089 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1960  Flp/Fap pilin component  46.3 
 
 		 55 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0416  Flp/Fap pilin component  50.98 
 
 		 52 aa  50.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5123  Flp/Fap pilin component  49.06 
 
 		 55 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0326494 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2363  Flp/Fap pilin component  50 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2076  Flp/Fap pilin component  48.98 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.554715  normal  0.612928 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2075  Flp/Fap pilin component  48.94 
 
 		 58 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.514501  normal  0.606618 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2489  Flp/Fap pilin component  48.98 
 
 		 59 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0222  component of type 4 pilus pilin subunit protein  52.17 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4196  Flp/Fap pilin component  48.15 
 
 		 61 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2387  Flp/Fap pilin component  44.44 
 
 		 54 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.0065262  hitchhiker  0.00967552 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2639  Flp/Fap pilin component  44.64 
 
 		 61 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4185  Flp/Fap pilin component  48.98 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4473  Flp/Fap pilin component  48.98 
 
 		 62 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.837061  normal  0.806364 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2824  Flp/Fap pilin component  45.28 
 
 		 56 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50451  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2191  Flp/Fap pilin component  44.44 
 
 		 56 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0304  Flp/Fap pilin component  57.41 
 
 		 55 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3709  Flp/Fap pilin component  50.94 
 
 		 53 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.815351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3517  Flp/Fap pilin component  51.85 
 
 		 78 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0605  Flp/Fap pilin component  42.59 
 
 		 57 aa  44.3  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.531331  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4442  Flp/Fap pilin component  48.08 
 
 		 60 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2700  Flp/Fap pilin component  40.74 
 
 		 61 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.754645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2564  Flp/Fap pilin component  38.78 
 
 		 53 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1399  Flp/Fap pilin component  42.59 
 
 		 54 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.41464  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5991  Flp/Fap pilin component  44.68 
 
 		 60 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.848765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2264  Flp/Fap pilin component superfamily protein  48.84 
 
 		 72 aa  42.7  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2802  putative pilus subunit protein, PilA like  41.51 
 
 		 55 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.323715 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1521  hypothetical protein  51.06 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4611  Flp/Fap pilin component  39.62 
 
 		 58 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.699189 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0653  Flp/Fap pilin component  41.07 
 
 		 57 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2956  Flp/Fap pilin  48.84 
 
 		 48 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3081  Flp/Fap pilin  48.84 
 
 		 48 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1307  putative pilus subunit protein  47.73 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4095  Flp/Fap pilin component  46.94 
 
 		 60 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1522  Flp/Fap pilin component  57.5 
 
 		 58 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1035  Flp/Fap pilin component  35.85 
 
 		 57 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.949319  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1649  Flp/Fap pilin component  43.14 
 
 		 59 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.132405  normal  0.784096 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1171  Flp/Fap pilin component  47.5 
 
 		 56 aa  41.6  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000265809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1439  Flp/Fap pilin component  37.74 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719822  normal  0.158207 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0077  Flp/Fap pilin component  43.75 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256154  normal  0.964848 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0789  Flp/Fap pilin component  39.62 
 
 		 58 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2405  Flp/Fap pilin component  42 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.842762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2565  Flp/Fap pilin component  34.69 
 
 		 53 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0720  Flp/Fap pilin component  41.3 
 
 		 60 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.915545  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6287  Flp/Fap pilin component  42.55 
 
 		 60 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00948182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4699  Flp/Fap pilin component  43.48 
 
 		 53 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0977464  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0798  Flp/Fap pilin component  48.89 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0394  Flp/Fap pilin component  50.94 
 
 		 56 aa  40.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.157546  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4354  Flp/Fap pilin component  43.75 
 
 		 59 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4244  Flp/Fap pilin component  43.75 
 
 		 59 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272454  normal  0.405174 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4849  hypothetical protein  33.33 
 
 		 68 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0652  Flp/Fap pilin component  41.86 
 
 		 57 aa  40  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7207  Flp/Fap pilin component  48.84 
 
 		 63 aa  40  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.150094  normal  0.744647 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>