99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0596 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0596  Flp/Fap pilin component  100 
 
 		 56 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302138  normal  0.298198 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0597  Flp/Fap pilin component  80.36 
 
 		 55 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.41654  normal  0.29106 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2639  Flp/Fap pilin component  64.29 
 
 		 61 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0653  Flp/Fap pilin component  71.43 
 
 		 57 aa  74.3  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0652  Flp/Fap pilin component  67.86 
 
 		 57 aa  73.6  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0789  Flp/Fap pilin component  64 
 
 		 58 aa  64.7  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1307  putative pilus subunit protein  57.69 
 
 		 72 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1439  Flp/Fap pilin component  61.7 
 
 		 72 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719822  normal  0.158207 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5316  Flp/Fap pilin component  59.18 
 
 		 58 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351071  hitchhiker  0.000566754 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1736  Flp/Fap pilin component  56 
 
 		 69 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000234566  hitchhiker  0.0000333634 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2264  Flp/Fap pilin component superfamily protein  65.91 
 
 		 72 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2956  Flp/Fap pilin  64.44 
 
 		 48 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3081  Flp/Fap pilin  64.44 
 
 		 48 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7206  Flp/Fap pilin component  55.36 
 
 		 63 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0674219  normal  0.484443 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6287  Flp/Fap pilin component  55.36 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00948182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5991  Flp/Fap pilin component  53.57 
 
 		 60 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.848765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2546  pilin, putative  58 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0577216  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1399  Flp/Fap pilin component  56 
 
 		 54 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.41464  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7207  Flp/Fap pilin component  53.57 
 
 		 63 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.150094  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1937  putative fimbriae assembly related protein  58 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0283045  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1764  pilin family protein  58 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1785  pilin family protein  58 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.859403  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3792  Flp/Fap pilin component  55.77 
 
 		 54 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2387  Flp/Fap pilin component  50 
 
 		 54 aa  57  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.0065262  hitchhiker  0.00967552 
 
 
-
 
NC_003296  RS02598  putative pilin protein  55.32 
 
 		 58 aa  57  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191275  normal  0.495698 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0416  Flp/Fap pilin component  56 
 
 		 52 aa  56.6  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4699  Flp/Fap pilin component  52 
 
 		 53 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0977464  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2363  Flp/Fap pilin component  52 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5504  Flp/Fap pilin component  50 
 
 		 63 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458126  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5317  Flp/Fap pilin component  57.14 
 
 		 58 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26673  hitchhiker  0.000600158 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6378  Flp/Fap pilin component  50 
 
 		 63 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.43993 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5868  Flp/Fap pilin component  50 
 
 		 63 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.229195 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2824  Flp/Fap pilin component  48.08 
 
 		 56 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50451  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2076  Flp/Fap pilin component  48.08 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.554715  normal  0.612928 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5123  Flp/Fap pilin component  58 
 
 		 55 aa  53.9  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0326494 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2710  pilin, putative  57.45 
 
 		 79 aa  53.5  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4244  Flp/Fap pilin component  53.19 
 
 		 59 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272454  normal  0.405174 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2332  Flp/Fap pilin component  57.45 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.341301  normal  0.812009 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4354  Flp/Fap pilin component  53.19 
 
 		 59 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1649  Flp/Fap pilin component  50.94 
 
 		 59 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.132405  normal  0.784096 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0788  Flp/Fap pilin component  48.98 
 
 		 72 aa  52.4  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1527  putative Flp/Fap pilin component  64.29 
 
 		 56 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.713475  normal  0.82875 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0222  component of type 4 pilus pilin subunit protein  45.83 
 
 		 61 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2489  Flp/Fap pilin component  51.92 
 
 		 59 aa  51.6  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0801  pilus assembly protein PilA  50 
 
 		 60 aa  51.2  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2075  Flp/Fap pilin component  44.23 
 
 		 58 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.514501  normal  0.606618 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4196  Flp/Fap pilin component  54.17 
 
 		 61 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2802  putative pilus subunit protein, PilA like  44.44 
 
 		 55 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.323715 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0223  component of type 4 pilus pilin subunit protein  45.83 
 
 		 61 aa  51.2  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668081  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0605  Flp/Fap pilin component  53.85 
 
 		 57 aa  50.8  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.531331  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1794  Flp/Fap pilin component  48 
 
 		 54 aa  50.8  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.55004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2928  Flp/Fap pilin component  46.94 
 
 		 101 aa  50.4  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.419964  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3349  Flp/Fap pilin component  46.94 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3651  Flp/Fap pilin component  58.14 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0651  Flp/Fap pilin component  44.44 
 
 		 57 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.151252 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4611  Flp/Fap pilin component  51.02 
 
 		 58 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.699189 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1493  Flp/Fap pilin component  46 
 
 		 56 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000102149  hitchhiker  0.00000902291 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0230  Flp/Fap pilin component  55.77 
 
 		 54 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1037  Flp/Fap pilin component  46 
 
 		 56 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708738  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2831  Flp/Fap pilin component  45.65 
 
 		 59 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.676625  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4095  Flp/Fap pilin component  46.15 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1517  Flp/Fap pilin component  46 
 
 		 56 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000857927  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4473  Flp/Fap pilin component  44 
 
 		 62 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.837061  normal  0.806364 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3484  Flp/Fap pilin component  48.21 
 
 		 56 aa  48.1  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0220876 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0595  Flp/Fap pilin component  43.75 
 
 		 56 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.311439  normal  0.298198 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2700  Flp/Fap pilin component  40 
 
 		 61 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.754645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4185  Flp/Fap pilin component  40.38 
 
 		 61 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4197  Flp/Fap pilin component  44.23 
 
 		 54 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692127  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7028  putative Flp/Fap pilin component  56.1 
 
 		 54 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.779148  normal  0.931089 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2477  Flp/Fap pilin component  39.58 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2640  Flp/Fap pilin component  39.29 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2919  Flp/Fap pilin component  42.55 
 
 		 59 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14248  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0974  Flp/Fap pilin component  42.86 
 
 		 56 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179102  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3335  Flp/Fap pilin component  56 
 
 		 51 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2363  Flp/Fap pilin component  58.93 
 
 		 60 aa  44.7  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0798  Flp/Fap pilin component  54.76 
 
 		 81 aa  44.3  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4442  Flp/Fap pilin component  42.31 
 
 		 60 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1796  Flp/Fap pilin component  38 
 
 		 54 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.655052  normal  0.0298304 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2954  putative pilus subunit protein  63.27 
 
 		 56 aa  43.5  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3080  putative pilus subunit protein  63.27 
 
 		 56 aa  43.5  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1306  putative pilus subunit protein  63.27 
 
 		 56 aa  43.5  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0798  Flp/Fap pilin component  40.82 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5992  Flp/Fap pilin component  44.44 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.651462  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4849  hypothetical protein  43.14 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1153  Flp/Fap pilin component  40.82 
 
 		 57 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0244089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1489  Flp/Fap pilin component  68.09 
 
 		 57 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.60376 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2405  Flp/Fap pilin component  35.42 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.842762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2263  PilA-related protein  61.22 
 
 		 56 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2021  Flp/Fap pilin component  47.83 
 
 		 67 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2323  Flp/Fap pilin component  38.3 
 
 		 69 aa  41.2  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0720  Flp/Fap pilin component  38.78 
 
 		 60 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.915545  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0850  Flp/Fap pilin component  39.58 
 
 		 59 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.323889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0077  Flp/Fap pilin component  38.46 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256154  normal  0.964848 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0394  Flp/Fap pilin component  53.85 
 
 		 56 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.157546  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1915  Flp/Fap pilin component  42.55 
 
 		 52 aa  40.8  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00503365  hitchhiker  0.00635938 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4439  Flp/Fap pilin component  38.1 
 
 		 70 aa  40.8  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0309403 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2634  Flp/Fap pilin component  43.14 
 
 		 66 aa  40.4  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.815116 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2920  Flp/Fap pilin component  44.19 
 
 		 64 aa  40.4  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.745426  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3495  Flp/Fap pilin component  54.9 
 
 		 54 aa  40.4  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0166481 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>