104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5504 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008062  Bcen_5504  Flp/Fap pilin component  100 
 
 
63 aa  120  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458126  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5868  Flp/Fap pilin component  100 
 
 
63 aa  120  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.229195 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6378  Flp/Fap pilin component  100 
 
 
63 aa  120  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.43993 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7207  Flp/Fap pilin component  85.71 
 
 
63 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.150094  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7206  Flp/Fap pilin component  68.25 
 
 
63 aa  87.4  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0674219  normal  0.484443 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6287  Flp/Fap pilin component  68.33 
 
 
60 aa  87  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00948182  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5991  Flp/Fap pilin component  61.67 
 
 
60 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.848765  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5503  Flp/Fap pilin component  74.6 
 
 
63 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.34986  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5867  Flp/Fap pilin component  74.6 
 
 
63 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.234531 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6377  Flp/Fap pilin component  74.6 
 
 
63 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.460666 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0652  Flp/Fap pilin component  52.63 
 
 
57 aa  62.8  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0653  Flp/Fap pilin component  51.79 
 
 
57 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0789  Flp/Fap pilin component  55.56 
 
 
58 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1736  Flp/Fap pilin component  47.06 
 
 
69 aa  57  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000234566  hitchhiker  0.0000333634 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2639  Flp/Fap pilin component  44.83 
 
 
61 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2264  Flp/Fap pilin component superfamily protein  49.09 
 
 
72 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0416  Flp/Fap pilin component  55.77 
 
 
52 aa  56.6  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2075  Flp/Fap pilin component  51.79 
 
 
58 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.514501  normal  0.606618 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1307  putative pilus subunit protein  56.52 
 
 
72 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2546  pilin, putative  46.55 
 
 
65 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0577216  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1399  Flp/Fap pilin component  52 
 
 
54 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.41464  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3081  Flp/Fap pilin  56.52 
 
 
48 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2956  Flp/Fap pilin  56.52 
 
 
48 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0596  Flp/Fap pilin component  50 
 
 
56 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302138  normal  0.298198 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0597  Flp/Fap pilin component  51.92 
 
 
55 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.41654  normal  0.29106 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4699  Flp/Fap pilin component  47.06 
 
 
53 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0977464  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1937  putative fimbriae assembly related protein  46.55 
 
 
65 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0283045  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1764  pilin family protein  46.55 
 
 
65 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1785  pilin family protein  46.55 
 
 
65 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.859403  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0222  component of type 4 pilus pilin subunit protein  43.86 
 
 
61 aa  54.3  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1037  Flp/Fap pilin component  45.76 
 
 
56 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708738  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1517  Flp/Fap pilin component  45.76 
 
 
56 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000857927  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1493  Flp/Fap pilin component  45.76 
 
 
56 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000102149  hitchhiker  0.00000902291 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1439  Flp/Fap pilin component  42.62 
 
 
72 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719822  normal  0.158207 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5316  Flp/Fap pilin component  46.15 
 
 
58 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351071  hitchhiker  0.000566754 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2363  Flp/Fap pilin component  48.28 
 
 
60 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2489  Flp/Fap pilin component  52 
 
 
59 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2387  Flp/Fap pilin component  44 
 
 
54 aa  52  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.0065262  hitchhiker  0.00967552 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0223  component of type 4 pilus pilin subunit protein  40.32 
 
 
61 aa  52.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668081  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3792  Flp/Fap pilin component  55.32 
 
 
54 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4473  Flp/Fap pilin component  38.71 
 
 
62 aa  51.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.837061  normal  0.806364 
 
 
-
 
NC_003296  RS02598  putative pilin protein  52.08 
 
 
58 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191275  normal  0.495698 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2076  Flp/Fap pilin component  47.54 
 
 
68 aa  50.8  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.554715  normal  0.612928 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5317  Flp/Fap pilin component  46.15 
 
 
58 aa  50.4  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26673  hitchhiker  0.000600158 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1649  Flp/Fap pilin component  47.46 
 
 
59 aa  50.4  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.132405  normal  0.784096 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4196  Flp/Fap pilin component  46.55 
 
 
61 aa  50.4  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6366  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2332  Flp/Fap pilin component  40.35 
 
 
69 aa  50.4  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.341301  normal  0.812009 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0788  Flp/Fap pilin component  46.3 
 
 
72 aa  49.7  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3651  Flp/Fap pilin component  45.61 
 
 
63 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0605  Flp/Fap pilin component  45.28 
 
 
57 aa  49.7  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.531331  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2021  Flp/Fap pilin component  50 
 
 
67 aa  49.7  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2477  Flp/Fap pilin component  41.51 
 
 
65 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2405  Flp/Fap pilin component  43.75 
 
 
64 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.842762  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2824  Flp/Fap pilin component  44.9 
 
 
56 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50451  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1306  putative pilus subunit protein  58.93 
 
 
56 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3080  putative pilus subunit protein  58.93 
 
 
56 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2954  putative pilus subunit protein  58.93 
 
 
56 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1794  Flp/Fap pilin component  48 
 
 
54 aa  48.5  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.55004  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1527  putative Flp/Fap pilin component  46 
 
 
56 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.713475  normal  0.82875 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0798  Flp/Fap pilin component  45.83 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4185  Flp/Fap pilin component  35.48 
 
 
61 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2710  pilin, putative  40.35 
 
 
79 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3484  Flp/Fap pilin component  54.55 
 
 
56 aa  48.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0220876 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0651  Flp/Fap pilin component  48.89 
 
 
57 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.151252 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0801  pilus assembly protein PilA  50 
 
 
60 aa  47.4  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0974  Flp/Fap pilin component  44.64 
 
 
56 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179102  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2263  PilA-related protein  57.14 
 
 
56 aa  47  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2802  putative pilus subunit protein, PilA like  47.73 
 
 
55 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.323715 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3349  Flp/Fap pilin component  48.84 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4611  Flp/Fap pilin component  39.34 
 
 
58 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.699189 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2640  Flp/Fap pilin component  39.62 
 
 
74 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5123  Flp/Fap pilin component  47.83 
 
 
55 aa  45.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0326494 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0077  Flp/Fap pilin component  43.64 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256154  normal  0.964848 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4197  Flp/Fap pilin component  42 
 
 
54 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692127  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4439  Flp/Fap pilin component  41.18 
 
 
70 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0309403 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4442  Flp/Fap pilin component  40 
 
 
60 aa  45.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0595  Flp/Fap pilin component  39.62 
 
 
56 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.311439  normal  0.298198 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2700  Flp/Fap pilin component  41.67 
 
 
61 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.754645  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4095  Flp/Fap pilin component  43.75 
 
 
60 aa  45.1  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3825  Flp/Fap pilin component  50 
 
 
55 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7028  putative Flp/Fap pilin component  55.26 
 
 
54 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.779148  normal  0.931089 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1489  Flp/Fap pilin component  59.62 
 
 
57 aa  43.9  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.60376 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1035  Flp/Fap pilin component  45.65 
 
 
57 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.949319  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2920  Flp/Fap pilin component  46.51 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.745426  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0615  Flp/Fap pilin component  38.3 
 
 
61 aa  42.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0603648  normal  0.95811 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0230  Flp/Fap pilin component  43.86 
 
 
54 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4244  Flp/Fap pilin component  45.65 
 
 
59 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272454  normal  0.405174 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4354  Flp/Fap pilin component  45.65 
 
 
59 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1905  Flp/Fap pilin component  50 
 
 
59 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.691555  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1839  Flp/Fap pilin component  33.33 
 
 
63 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3316  hypothetical protein  31.58 
 
 
175 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4405  hypothetical protein  35.48 
 
 
65 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0798  Flp/Fap pilin component  38.89 
 
 
57 aa  41.6  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2088  Flp/Fap pilin component  38.6 
 
 
54 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409092  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2317  Flp/Fap pilin component  46.94 
 
 
63 aa  40.8  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.728903  normal  0.185858 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3202  hypothetical protein  30.36 
 
 
64 aa  40.8  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.281235 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4849  hypothetical protein  34 
 
 
68 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1796  Flp/Fap pilin component  36.84 
 
 
54 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.655052  normal  0.0298304 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0602  Flp/Fap pilin component  38.6 
 
 
69 aa  40.8  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1915  Flp/Fap pilin component  37.5 
 
 
52 aa  40.4  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00503365  hitchhiker  0.00635938 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>