57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0651 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0651  Flp/Fap pilin component  100 
 
 		 57 aa  114  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.151252 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0595  Flp/Fap pilin component  61.7 
 
 		 56 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.311439  normal  0.298198 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0652  Flp/Fap pilin component  47.37 
 
 		 57 aa  57.4  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2264  Flp/Fap pilin component superfamily protein  52 
 
 		 72 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2956  Flp/Fap pilin  52.17 
 
 		 48 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3081  Flp/Fap pilin  52.17 
 
 		 48 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1307  putative pilus subunit protein  54.55 
 
 		 72 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2640  Flp/Fap pilin component  50 
 
 		 74 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0653  Flp/Fap pilin component  46.43 
 
 		 57 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2639  Flp/Fap pilin component  46.15 
 
 		 61 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0597  Flp/Fap pilin component  54.55 
 
 		 55 aa  50.1  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.41654  normal  0.29106 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0596  Flp/Fap pilin component  44.44 
 
 		 56 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302138  normal  0.298198 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5868  Flp/Fap pilin component  48.89 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.229195 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6378  Flp/Fap pilin component  48.89 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.43993 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5504  Flp/Fap pilin component  48.89 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458126  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0416  Flp/Fap pilin component  51.06 
 
 		 52 aa  47.4  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1960  Flp/Fap pilin component  44.44 
 
 		 55 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2489  Flp/Fap pilin component  45.65 
 
 		 59 aa  46.2  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7206  Flp/Fap pilin component  44.64 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0674219  normal  0.484443 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2802  putative pilus subunit protein, PilA like  41.18 
 
 		 55 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.323715 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1527  putative Flp/Fap pilin component  55 
 
 		 56 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.713475  normal  0.82875 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2021  Flp/Fap pilin component  50 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6288  Flp/Fap pilin component  42.86 
 
 		 68 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0180675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1399  Flp/Fap pilin component  38.89 
 
 		 54 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.41464  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0788  Flp/Fap pilin component  59.46 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0789  Flp/Fap pilin component  44.68 
 
 		 58 aa  46.2  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1937  putative fimbriae assembly related protein  38.18 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0283045  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5992  Flp/Fap pilin component  52.27 
 
 		 68 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.651462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1764  pilin family protein  38.18 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1785  pilin family protein  38.18 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.859403  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2387  Flp/Fap pilin component  38.89 
 
 		 54 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.0065262  hitchhiker  0.00967552 
 
 
-
 
NC_003296  RS02598  putative pilin protein  52.38 
 
 		 58 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191275  normal  0.495698 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7207  Flp/Fap pilin component  46.67 
 
 		 63 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.150094  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2546  pilin, putative  36.36 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0577216  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6287  Flp/Fap pilin component  44.19 
 
 		 60 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00948182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2928  Flp/Fap pilin component  45.65 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.419964  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4699  Flp/Fap pilin component  43.14 
 
 		 53 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0977464  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3651  Flp/Fap pilin component  38.46 
 
 		 63 aa  43.5  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4611  Flp/Fap pilin component  44.9 
 
 		 58 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.699189 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2824  Flp/Fap pilin component  38.89 
 
 		 56 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50451  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3316  hypothetical protein  33.33 
 
 		 175 aa  42.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5991  Flp/Fap pilin component  39.13 
 
 		 60 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.848765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5316  Flp/Fap pilin component  37.74 
 
 		 58 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351071  hitchhiker  0.000566754 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0615  Flp/Fap pilin component  43.18 
 
 		 61 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0603648  normal  0.95811 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1649  Flp/Fap pilin component  37.74 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.132405  normal  0.784096 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2088  Flp/Fap pilin component  40 
 
 		 54 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409092  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1736  Flp/Fap pilin component  35.85 
 
 		 69 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000234566  hitchhiker  0.0000333634 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2545  Flp/Fap pilin component  50 
 
 		 97 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.221854  normal  0.0466473 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2076  Flp/Fap pilin component  40.43 
 
 		 68 aa  41.6  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.554715  normal  0.612928 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2332  Flp/Fap pilin component  37.5 
 
 		 69 aa  41.6  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.341301  normal  0.812009 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2075  Flp/Fap pilin component  38 
 
 		 58 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.514501  normal  0.606618 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2710  pilin, putative  37.5 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1439  Flp/Fap pilin component  36 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719822  normal  0.158207 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0798  Flp/Fap pilin component  43.9 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1796  Flp/Fap pilin component  40.38 
 
 		 54 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.655052  normal  0.0298304 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1794  Flp/Fap pilin component  41.3 
 
 		 54 aa  40.4  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.55004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0801  pilus assembly protein PilA  47.37 
 
 		 60 aa  40  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>