30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0615 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0615  Flp/Fap pilin component  100 
 
 		 61 aa  125  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0603648  normal  0.95811 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2545  Flp/Fap pilin component  42.37 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.221854  normal  0.0466473 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0416  Flp/Fap pilin component  51.22 
 
 		 52 aa  46.2  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3349  Flp/Fap pilin component  41.3 
 
 		 61 aa  45.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2363  Flp/Fap pilin component  41.3 
 
 		 60 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3651  Flp/Fap pilin component  40 
 
 		 63 aa  44.3  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2802  putative pilus subunit protein, PilA like  39.13 
 
 		 55 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.323715 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0652  Flp/Fap pilin component  38.18 
 
 		 57 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2920  Flp/Fap pilin component  41.3 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.745426  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0222  component of type 4 pilus pilin subunit protein  36.73 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2489  Flp/Fap pilin component  47.5 
 
 		 59 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5868  Flp/Fap pilin component  38.3 
 
 		 63 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.229195 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6378  Flp/Fap pilin component  38.3 
 
 		 63 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.43993 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5504  Flp/Fap pilin component  38.3 
 
 		 63 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458126  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3316  hypothetical protein  43.48 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1649  Flp/Fap pilin component  37.78 
 
 		 59 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.132405  normal  0.784096 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4699  Flp/Fap pilin component  44.44 
 
 		 53 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0977464  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2387  Flp/Fap pilin component  41.3 
 
 		 54 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.0065262  hitchhiker  0.00967552 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0223  component of type 4 pilus pilin subunit protein  38.78 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668081  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0651  Flp/Fap pilin component  43.18 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.151252 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2639  Flp/Fap pilin component  39.22 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6287  Flp/Fap pilin component  34 
 
 		 60 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00948182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1794  Flp/Fap pilin component  36.73 
 
 		 54 aa  42  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.55004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0595  Flp/Fap pilin component  41.82 
 
 		 56 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.311439  normal  0.298198 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1839  Flp/Fap pilin component  36.36 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02598  putative pilin protein  35.85 
 
 		 58 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191275  normal  0.495698 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4196  Flp/Fap pilin component  40.91 
 
 		 61 aa  40.8  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5123  Flp/Fap pilin component  40.43 
 
 		 55 aa  40.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0326494 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2824  Flp/Fap pilin component  39.13 
 
 		 56 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50451  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3792  Flp/Fap pilin component  40 
 
 		 54 aa  40  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>