49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2920 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2920  Flp/Fap pilin component  100 
 
 		 64 aa  123  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.745426  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2633  Flp/Fap pilin component  51.67 
 
 		 66 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.691618 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2634  Flp/Fap pilin component  41.67 
 
 		 66 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.815116 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4439  Flp/Fap pilin component  40.62 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0309403 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2928  Flp/Fap pilin component  40.68 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.419964  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2075  Flp/Fap pilin component  51.16 
 
 		 58 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.514501  normal  0.606618 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1527  putative Flp/Fap pilin component  53.49 
 
 		 56 aa  48.1  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.713475  normal  0.82875 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6287  Flp/Fap pilin component  43.86 
 
 		 60 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00948182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0222  component of type 4 pilus pilin subunit protein  43.75 
 
 		 61 aa  47.4  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2076  Flp/Fap pilin component  51.16 
 
 		 68 aa  47.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.554715  normal  0.612928 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4699  Flp/Fap pilin component  50 
 
 		 53 aa  47  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0977464  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4473  Flp/Fap pilin component  45.83 
 
 		 62 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.837061  normal  0.806364 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0223  component of type 4 pilus pilin subunit protein  42.55 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668081  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4185  Flp/Fap pilin component  47.92 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3427  Flp/Fap pilin component  43.75 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.108389  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3349  Flp/Fap pilin component  52.27 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2643  Flp/Fap pilin component  44 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7206  Flp/Fap pilin component  41.67 
 
 		 63 aa  45.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0674219  normal  0.484443 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5317  Flp/Fap pilin component  45.83 
 
 		 58 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26673  hitchhiker  0.000600158 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2642  Flp/Fap pilin component  45.24 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0615  Flp/Fap pilin component  41.3 
 
 		 61 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0603648  normal  0.95811 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2710  pilin, putative  44.68 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2332  Flp/Fap pilin component  44.68 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.341301  normal  0.812009 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1736  Flp/Fap pilin component  47.5 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000234566  hitchhiker  0.0000333634 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6378  Flp/Fap pilin component  46.51 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.43993 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7207  Flp/Fap pilin component  44.19 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.150094  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2546  pilin, putative  45.83 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0577216  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0789  Flp/Fap pilin component  44.44 
 
 		 58 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5504  Flp/Fap pilin component  46.51 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458126  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5868  Flp/Fap pilin component  46.51 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.229195 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3315  hypothetical protein  39.22 
 
 		 59 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4196  Flp/Fap pilin component  45.45 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3792  Flp/Fap pilin component  44.68 
 
 		 54 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0652  Flp/Fap pilin component  37.5 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1764  pilin family protein  45.83 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1785  pilin family protein  45.83 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.859403  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1439  Flp/Fap pilin component  45.45 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719822  normal  0.158207 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1937  putative fimbriae assembly related protein  45.83 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0283045  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2387  Flp/Fap pilin component  40.91 
 
 		 54 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.0065262  hitchhiker  0.00967552 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0416  Flp/Fap pilin component  44.44 
 
 		 52 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1794  Flp/Fap pilin component  42.55 
 
 		 54 aa  42  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.55004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3651  Flp/Fap pilin component  42.86 
 
 		 63 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5991  Flp/Fap pilin component  38.6 
 
 		 60 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.848765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5316  Flp/Fap pilin component  46.51 
 
 		 58 aa  41.2  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351071  hitchhiker  0.000566754 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1035  Flp/Fap pilin component  40.35 
 
 		 57 aa  41.6  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.949319  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0788  Flp/Fap pilin component  50 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2824  Flp/Fap pilin component  40.91 
 
 		 56 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50451  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2489  Flp/Fap pilin component  45.45 
 
 		 59 aa  40.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0596  Flp/Fap pilin component  44.19 
 
 		 56 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302138  normal  0.298198 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>