17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2633 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2633  Flp/Fap pilin component  100 
 
 
66 aa  128  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.691618 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2634  Flp/Fap pilin component  74.24 
 
 
66 aa  100  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.815116 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2920  Flp/Fap pilin component  51.67 
 
 
64 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.745426  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2643  Flp/Fap pilin component  42.86 
 
 
70 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4439  Flp/Fap pilin component  42.37 
 
 
70 aa  51.2  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0309403 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2642  Flp/Fap pilin component  51.11 
 
 
71 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3651  Flp/Fap pilin component  46.81 
 
 
63 aa  45.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2928  Flp/Fap pilin component  41.67 
 
 
101 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.419964  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1527  putative Flp/Fap pilin component  48.89 
 
 
56 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.713475  normal  0.82875 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0652  Flp/Fap pilin component  39.68 
 
 
57 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5991  Flp/Fap pilin component  35.09 
 
 
60 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.848765  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0653  Flp/Fap pilin component  40.35 
 
 
57 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0597  Flp/Fap pilin component  41.51 
 
 
55 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.41654  normal  0.29106 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2639  Flp/Fap pilin component  38.89 
 
 
61 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2075  Flp/Fap pilin component  38.78 
 
 
58 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.514501  normal  0.606618 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0416  Flp/Fap pilin component  48.78 
 
 
52 aa  40.4  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3506  Flp/Fap pilin component  45.1 
 
 
63 aa  40.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171468  normal  0.803902 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>