107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0597 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0597  Flp/Fap pilin component  100 
 
 		 55 aa  106  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.41654  normal  0.29106 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0653  Flp/Fap pilin component  85.71 
 
 		 57 aa  80.1  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0596  Flp/Fap pilin component  80.36 
 
 		 56 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302138  normal  0.298198 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0652  Flp/Fap pilin component  72.22 
 
 		 57 aa  77.8  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2639  Flp/Fap pilin component  73.47 
 
 		 61 aa  72  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5316  Flp/Fap pilin component  64.71 
 
 		 58 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351071  hitchhiker  0.000566754 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0789  Flp/Fap pilin component  60 
 
 		 58 aa  67.8  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7206  Flp/Fap pilin component  61.11 
 
 		 63 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0674219  normal  0.484443 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1736  Flp/Fap pilin component  61.22 
 
 		 69 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000234566  hitchhiker  0.0000333634 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1439  Flp/Fap pilin component  61.22 
 
 		 72 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719822  normal  0.158207 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1399  Flp/Fap pilin component  57.14 
 
 		 54 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.41464  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5317  Flp/Fap pilin component  58.82 
 
 		 58 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26673  hitchhiker  0.000600158 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2824  Flp/Fap pilin component  57.14 
 
 		 56 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50451  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5991  Flp/Fap pilin component  52.73 
 
 		 60 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.848765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7207  Flp/Fap pilin component  55.77 
 
 		 63 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.150094  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5123  Flp/Fap pilin component  60.78 
 
 		 55 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0326494 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2387  Flp/Fap pilin component  55.1 
 
 		 54 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.0065262  hitchhiker  0.00967552 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2332  Flp/Fap pilin component  56.86 
 
 		 69 aa  58.2  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.341301  normal  0.812009 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2710  pilin, putative  56.86 
 
 		 79 aa  58.2  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6287  Flp/Fap pilin component  53.85 
 
 		 60 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00948182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3792  Flp/Fap pilin component  56.86 
 
 		 54 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1307  putative pilus subunit protein  55.1 
 
 		 72 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2546  pilin, putative  52.73 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0577216  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2264  Flp/Fap pilin component superfamily protein  55.1 
 
 		 72 aa  57  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1937  putative fimbriae assembly related protein  52.73 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0283045  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1764  pilin family protein  52.73 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1785  pilin family protein  52.73 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.859403  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02598  putative pilin protein  50.98 
 
 		 58 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191275  normal  0.495698 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2363  Flp/Fap pilin component  52.94 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5504  Flp/Fap pilin component  51.92 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458126  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5868  Flp/Fap pilin component  51.92 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.229195 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3081  Flp/Fap pilin  57.78 
 
 		 48 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2956  Flp/Fap pilin  57.78 
 
 		 48 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6378  Flp/Fap pilin component  51.92 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.43993 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0416  Flp/Fap pilin component  53.85 
 
 		 52 aa  55.1  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4354  Flp/Fap pilin component  52.94 
 
 		 59 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4244  Flp/Fap pilin component  52.94 
 
 		 59 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272454  normal  0.405174 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3651  Flp/Fap pilin component  62.79 
 
 		 63 aa  54.3  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2076  Flp/Fap pilin component  53.06 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.554715  normal  0.612928 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4611  Flp/Fap pilin component  52.94 
 
 		 58 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.699189 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0801  pilus assembly protein PilA  53.85 
 
 		 60 aa  52.8  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0605  Flp/Fap pilin component  56.86 
 
 		 57 aa  53.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.531331  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4699  Flp/Fap pilin component  55.1 
 
 		 53 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0977464  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2928  Flp/Fap pilin component  48.98 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.419964  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1527  putative Flp/Fap pilin component  62.79 
 
 		 56 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.713475  normal  0.82875 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0230  Flp/Fap pilin component  61.22 
 
 		 54 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1037  Flp/Fap pilin component  48.98 
 
 		 56 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708738  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1517  Flp/Fap pilin component  48.98 
 
 		 56 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000857927  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2489  Flp/Fap pilin component  53.06 
 
 		 59 aa  51.6  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1493  Flp/Fap pilin component  48.98 
 
 		 56 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000102149  hitchhiker  0.00000902291 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0223  component of type 4 pilus pilin subunit protein  51.16 
 
 		 61 aa  51.2  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668081  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1794  Flp/Fap pilin component  51.02 
 
 		 54 aa  50.8  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.55004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2075  Flp/Fap pilin component  48.98 
 
 		 58 aa  50.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.514501  normal  0.606618 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0651  Flp/Fap pilin component  54.55 
 
 		 57 aa  50.1  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.151252 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4196  Flp/Fap pilin component  58.14 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2700  Flp/Fap pilin component  45.1 
 
 		 61 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.754645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0222  component of type 4 pilus pilin subunit protein  42.86 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3484  Flp/Fap pilin component  58.14 
 
 		 56 aa  48.5  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0220876 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4442  Flp/Fap pilin component  43.64 
 
 		 60 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1306  putative pilus subunit protein  69.39 
 
 		 56 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0788  Flp/Fap pilin component  47.73 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0798  Flp/Fap pilin component  40 
 
 		 57 aa  48.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3080  putative pilus subunit protein  69.39 
 
 		 56 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2954  putative pilus subunit protein  69.39 
 
 		 56 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0595  Flp/Fap pilin component  43.75 
 
 		 56 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.311439  normal  0.298198 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2802  putative pilus subunit protein, PilA like  47.83 
 
 		 55 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.323715 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3349  Flp/Fap pilin component  52.27 
 
 		 61 aa  47.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1649  Flp/Fap pilin component  52 
 
 		 59 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.132405  normal  0.784096 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2263  PilA-related protein  67.35 
 
 		 56 aa  47.4  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2323  Flp/Fap pilin component  42.86 
 
 		 69 aa  47.8  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4197  Flp/Fap pilin component  47.06 
 
 		 54 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692127  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4473  Flp/Fap pilin component  42.86 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.837061  normal  0.806364 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2831  Flp/Fap pilin component  40.82 
 
 		 59 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.676625  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4095  Flp/Fap pilin component  46.81 
 
 		 60 aa  46.2  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2477  Flp/Fap pilin component  41.18 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0798  Flp/Fap pilin component  54.55 
 
 		 81 aa  46.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4405  hypothetical protein  41.18 
 
 		 65 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2021  Flp/Fap pilin component  51.06 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7028  putative Flp/Fap pilin component  57.5 
 
 		 54 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.779148  normal  0.931089 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4185  Flp/Fap pilin component  40.82 
 
 		 61 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2544  Flp/Fap pilin component  63.46 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12736  normal  0.0443917 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0394  Flp/Fap pilin component  58.82 
 
 		 56 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.157546  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0850  Flp/Fap pilin component  43.75 
 
 		 59 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.323889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5503  Flp/Fap pilin component  59.26 
 
 		 63 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.34986  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5867  Flp/Fap pilin component  59.26 
 
 		 63 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.234531 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6377  Flp/Fap pilin component  59.26 
 
 		 63 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.460666 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4439  Flp/Fap pilin component  38.18 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0309403 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2405  Flp/Fap pilin component  39.22 
 
 		 64 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.842762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2812  Flp/Fap pilin component  40.43 
 
 		 56 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3316  hypothetical protein  37.5 
 
 		 175 aa  43.9  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2919  Flp/Fap pilin component  40 
 
 		 59 aa  43.5  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14248  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2634  Flp/Fap pilin component  41.51 
 
 		 66 aa  43.5  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.815116 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0974  Flp/Fap pilin component  44.68 
 
 		 56 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179102  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2317  Flp/Fap pilin component  44.68 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.728903  normal  0.185858 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0551  Flp/Fap pilin component  38.78 
 
 		 58 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.871798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0077  Flp/Fap pilin component  43.75 
 
 		 96 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256154  normal  0.964848 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06199  Flp pilus assembly protein  45.1 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5992  Flp/Fap pilin component  44.44 
 
 		 68 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.651462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2633  Flp/Fap pilin component  41.51 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.691618 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1489  Flp/Fap pilin component  65.96 
 
 		 57 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.60376 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>