67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1527 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1527  putative Flp/Fap pilin component  100 
 
 		 56 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.713475  normal  0.82875 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0652  Flp/Fap pilin component  67.44 
 
 		 57 aa  58.2  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2332  Flp/Fap pilin component  58.33 
 
 		 69 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.341301  normal  0.812009 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2710  pilin, putative  58.33 
 
 		 79 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0653  Flp/Fap pilin component  62.22 
 
 		 57 aa  56.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2687  Flp/Fap pilin component  68.63 
 
 		 61 aa  54.7  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4699  Flp/Fap pilin component  61.9 
 
 		 53 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0977464  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2639  Flp/Fap pilin component  62.22 
 
 		 61 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0596  Flp/Fap pilin component  64.29 
 
 		 56 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302138  normal  0.298198 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0597  Flp/Fap pilin component  62.79 
 
 		 55 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.41654  normal  0.29106 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1439  Flp/Fap pilin component  52.08 
 
 		 72 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719822  normal  0.158207 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5991  Flp/Fap pilin component  52.17 
 
 		 60 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.848765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2387  Flp/Fap pilin component  53.33 
 
 		 54 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.0065262  hitchhiker  0.00967552 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3792  Flp/Fap pilin component  60.87 
 
 		 54 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0789  Flp/Fap pilin component  57.78 
 
 		 58 aa  51.2  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6287  Flp/Fap pilin component  53.33 
 
 		 60 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00948182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5316  Flp/Fap pilin component  60 
 
 		 58 aa  50.1  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351071  hitchhiker  0.000566754 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7207  Flp/Fap pilin component  50 
 
 		 63 aa  50.4  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.150094  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0788  Flp/Fap pilin component  64.44 
 
 		 72 aa  49.7  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1307  putative pilus subunit protein  50 
 
 		 72 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2264  Flp/Fap pilin component superfamily protein  50 
 
 		 72 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2075  Flp/Fap pilin component  56.82 
 
 		 58 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.514501  normal  0.606618 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2076  Flp/Fap pilin component  60.47 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.554715  normal  0.612928 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3081  Flp/Fap pilin  50 
 
 		 48 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2956  Flp/Fap pilin  50 
 
 		 48 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0798  Flp/Fap pilin component  55.1 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0416  Flp/Fap pilin component  62.79 
 
 		 52 aa  48.9  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4611  Flp/Fap pilin component  60 
 
 		 58 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.699189 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6378  Flp/Fap pilin component  46 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.43993 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2363  Flp/Fap pilin component  50 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5868  Flp/Fap pilin component  46 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.229195 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5504  Flp/Fap pilin component  46 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458126  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1399  Flp/Fap pilin component  55.56 
 
 		 54 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.41464  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2920  Flp/Fap pilin component  53.49 
 
 		 64 aa  48.1  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.745426  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1764  pilin family protein  55.56 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1937  putative fimbriae assembly related protein  55.56 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0283045  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7206  Flp/Fap pilin component  52.17 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0674219  normal  0.484443 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1736  Flp/Fap pilin component  50 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000234566  hitchhiker  0.0000333634 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1785  pilin family protein  55.56 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.859403  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0605  Flp/Fap pilin component  54.55 
 
 		 57 aa  47.4  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.531331  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5317  Flp/Fap pilin component  60.47 
 
 		 58 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26673  hitchhiker  0.000600158 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2824  Flp/Fap pilin component  52.27 
 
 		 56 aa  47  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50451  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3484  Flp/Fap pilin component  54.55 
 
 		 56 aa  47  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0220876 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2634  Flp/Fap pilin component  57.14 
 
 		 66 aa  47  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.815116 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2546  pilin, putative  53.33 
 
 		 65 aa  47  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0577216  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2489  Flp/Fap pilin component  62.5 
 
 		 59 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0651  Flp/Fap pilin component  55 
 
 		 57 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.151252 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0801  pilus assembly protein PilA  52.17 
 
 		 60 aa  45.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0222  component of type 4 pilus pilin subunit protein  51.22 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0223  component of type 4 pilus pilin subunit protein  42 
 
 		 61 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668081  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4473  Flp/Fap pilin component  45.83 
 
 		 62 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.837061  normal  0.806364 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4185  Flp/Fap pilin component  48.89 
 
 		 61 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4196  Flp/Fap pilin component  50 
 
 		 61 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2633  Flp/Fap pilin component  48.89 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.691618 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1493  Flp/Fap pilin component  44.44 
 
 		 56 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000102149  hitchhiker  0.00000902291 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1517  Flp/Fap pilin component  44.44 
 
 		 56 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000857927  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1037  Flp/Fap pilin component  44.44 
 
 		 56 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708738  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1649  Flp/Fap pilin component  42.55 
 
 		 59 aa  43.5  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.132405  normal  0.784096 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2643  Flp/Fap pilin component  51.16 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5123  Flp/Fap pilin component  54.55 
 
 		 55 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0326494 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2928  Flp/Fap pilin component  50 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.419964  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3651  Flp/Fap pilin component  50 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3349  Flp/Fap pilin component  48.94 
 
 		 61 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6288  Flp/Fap pilin component  43.75 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0180675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2831  Flp/Fap pilin component  41.67 
 
 		 59 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.676625  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0230  Flp/Fap pilin component  57.14 
 
 		 54 aa  40  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02598  putative pilin protein  47.83 
 
 		 58 aa  40  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191275  normal  0.495698 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>