41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2831 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_2831  Flp/Fap pilin component  100 
 
 		 59 aa  118  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.676625  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2919  Flp/Fap pilin component  91.53 
 
 		 59 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14248  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2075  Flp/Fap pilin component  43.64 
 
 		 58 aa  55.5  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.514501  normal  0.606618 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2076  Flp/Fap pilin component  43.64 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.554715  normal  0.612928 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3972  Flp/Fap pilin component  56.6 
 
 		 58 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0986245  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0222  component of type 4 pilus pilin subunit protein  38.6 
 
 		 61 aa  51.6  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3349  Flp/Fap pilin component  42.37 
 
 		 61 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2928  Flp/Fap pilin component  50.98 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.419964  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0596  Flp/Fap pilin component  45.65 
 
 		 56 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302138  normal  0.298198 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4185  Flp/Fap pilin component  36.36 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3316  hypothetical protein  44.44 
 
 		 175 aa  47.4  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0652  Flp/Fap pilin component  37.25 
 
 		 57 aa  47.4  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0223  component of type 4 pilus pilin subunit protein  39.58 
 
 		 61 aa  47.4  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668081  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0798  Flp/Fap pilin component  39.22 
 
 		 57 aa  46.2  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2387  Flp/Fap pilin component  40 
 
 		 54 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.0065262  hitchhiker  0.00967552 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0597  Flp/Fap pilin component  40.82 
 
 		 55 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.41654  normal  0.29106 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2639  Flp/Fap pilin component  45.45 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0653  Flp/Fap pilin component  42.22 
 
 		 57 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1171  Flp/Fap pilin component  42.59 
 
 		 56 aa  45.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000265809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0416  Flp/Fap pilin component  40.82 
 
 		 52 aa  45.1  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1439  Flp/Fap pilin component  37.5 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719822  normal  0.158207 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2323  Flp/Fap pilin component  37.74 
 
 		 69 aa  44.3  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1307  putative pilus subunit protein  37.25 
 
 		 72 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0605  Flp/Fap pilin component  39.62 
 
 		 57 aa  44.3  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.531331  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4473  Flp/Fap pilin component  33.33 
 
 		 62 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.837061  normal  0.806364 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4849  hypothetical protein  36.36 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2956  Flp/Fap pilin  40.43 
 
 		 48 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3081  Flp/Fap pilin  40.43 
 
 		 48 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3315  hypothetical protein  44.9 
 
 		 59 aa  43.9  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2824  Flp/Fap pilin component  38 
 
 		 56 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50451  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2264  Flp/Fap pilin component superfamily protein  40.91 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1035  Flp/Fap pilin component  32.08 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.949319  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4196  Flp/Fap pilin component  35.59 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4244  Flp/Fap pilin component  37.93 
 
 		 59 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272454  normal  0.405174 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4354  Flp/Fap pilin component  37.93 
 
 		 59 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2489  Flp/Fap pilin component  36.36 
 
 		 59 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3506  Flp/Fap pilin component  36.73 
 
 		 63 aa  40.8  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171468  normal  0.803902 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1527  putative Flp/Fap pilin component  41.67 
 
 		 56 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.713475  normal  0.82875 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2546  pilin, putative  29.63 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0577216  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02598  putative pilin protein  31.03 
 
 		 58 aa  40  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191275  normal  0.495698 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0875  Flp/Fap pilin component  44.74 
 
 		 57 aa  40.4  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>