39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_2919 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_2919  Flp/Fap pilin component  100 
 
 
59 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14248  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2831  Flp/Fap pilin component  91.53 
 
 
59 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.676625  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2076  Flp/Fap pilin component  43.64 
 
 
68 aa  55.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.554715  normal  0.612928 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2075  Flp/Fap pilin component  41.82 
 
 
58 aa  54.7  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.514501  normal  0.606618 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3972  Flp/Fap pilin component  54.72 
 
 
58 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0986245  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0222  component of type 4 pilus pilin subunit protein  36.84 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2928  Flp/Fap pilin component  49.02 
 
 
101 aa  47.8  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.419964  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0223  component of type 4 pilus pilin subunit protein  35.09 
 
 
61 aa  47  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668081  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4185  Flp/Fap pilin component  36.36 
 
 
61 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3316  hypothetical protein  44.44 
 
 
175 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2639  Flp/Fap pilin component  45.45 
 
 
61 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3349  Flp/Fap pilin component  38.98 
 
 
61 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1171  Flp/Fap pilin component  40.74 
 
 
56 aa  44.7  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000265809  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0596  Flp/Fap pilin component  42.55 
 
 
56 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302138  normal  0.298198 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1035  Flp/Fap pilin component  35.85 
 
 
57 aa  45.1  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.949319  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0875  Flp/Fap pilin component  38.89 
 
 
57 aa  44.3  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0798  Flp/Fap pilin component  39.22 
 
 
57 aa  44.3  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2387  Flp/Fap pilin component  35.19 
 
 
54 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.0065262  hitchhiker  0.00967552 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0597  Flp/Fap pilin component  40 
 
 
55 aa  43.5  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.41654  normal  0.29106 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1439  Flp/Fap pilin component  39.13 
 
 
72 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719822  normal  0.158207 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0416  Flp/Fap pilin component  40.82 
 
 
52 aa  43.5  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02598  putative pilin protein  32.76 
 
 
58 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191275  normal  0.495698 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3315  hypothetical protein  42.86 
 
 
59 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4354  Flp/Fap pilin component  36.21 
 
 
59 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4244  Flp/Fap pilin component  36.21 
 
 
59 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272454  normal  0.405174 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4473  Flp/Fap pilin component  31.48 
 
 
62 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.837061  normal  0.806364 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2323  Flp/Fap pilin component  37.74 
 
 
69 aa  42  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2824  Flp/Fap pilin component  39.13 
 
 
56 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50451  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0653  Flp/Fap pilin component  40.91 
 
 
57 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0652  Flp/Fap pilin component  35.29 
 
 
57 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2546  pilin, putative  31.48 
 
 
65 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0577216  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4196  Flp/Fap pilin component  35.59 
 
 
61 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6366  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4849  hypothetical protein  34.55 
 
 
68 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1307  putative pilus subunit protein  37.25 
 
 
72 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3002  Flp/Fap pilin component  54.76 
 
 
66 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3081  Flp/Fap pilin  40.43 
 
 
48 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2956  Flp/Fap pilin  40.43 
 
 
48 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3506  Flp/Fap pilin component  42.86 
 
 
63 aa  40.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171468  normal  0.803902 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2489  Flp/Fap pilin component  36.36 
 
 
59 aa  40  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>