40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3002 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3002  Flp/Fap pilin component  100 
 
 		 66 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4095  Flp/Fap pilin component  54 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4196  Flp/Fap pilin component  46.55 
 
 		 61 aa  53.5  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2928  Flp/Fap pilin component  48.28 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.419964  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2919  Flp/Fap pilin component  54.76 
 
 		 59 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14248  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2831  Flp/Fap pilin component  54.55 
 
 		 59 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.676625  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2639  Flp/Fap pilin component  41.07 
 
 		 61 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1839  Flp/Fap pilin component  50.98 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2075  Flp/Fap pilin component  42.86 
 
 		 58 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.514501  normal  0.606618 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3121  Flp/Fap pilin component  48.98 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0383404  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2076  Flp/Fap pilin component  41.94 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.554715  normal  0.612928 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4354  Flp/Fap pilin component  44.9 
 
 		 59 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3792  Flp/Fap pilin component  42.86 
 
 		 54 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4244  Flp/Fap pilin component  44.9 
 
 		 59 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272454  normal  0.405174 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2387  Flp/Fap pilin component  41.67 
 
 		 54 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.0065262  hitchhiker  0.00967552 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2824  Flp/Fap pilin component  42.55 
 
 		 56 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50451  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2643  Flp/Fap pilin component  46.81 
 
 		 70 aa  47.4  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1035  Flp/Fap pilin component  38.46 
 
 		 57 aa  47.4  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.949319  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0416  Flp/Fap pilin component  50 
 
 		 52 aa  46.2  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02598  putative pilin protein  48.94 
 
 		 58 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191275  normal  0.495698 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0230  Flp/Fap pilin component  46 
 
 		 54 aa  45.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1736  Flp/Fap pilin component  28.81 
 
 		 69 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000234566  hitchhiker  0.0000333634 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2489  Flp/Fap pilin component  43.14 
 
 		 59 aa  44.7  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4197  Flp/Fap pilin component  37.25 
 
 		 54 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692127  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3972  Flp/Fap pilin component  58.82 
 
 		 58 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0986245  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4185  Flp/Fap pilin component  32.76 
 
 		 61 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4473  Flp/Fap pilin component  37.5 
 
 		 62 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.837061  normal  0.806364 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5316  Flp/Fap pilin component  29.63 
 
 		 58 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351071  hitchhiker  0.000566754 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0223  component of type 4 pilus pilin subunit protein  36.36 
 
 		 61 aa  42.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668081  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1399  Flp/Fap pilin component  30.77 
 
 		 54 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.41464  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0974  Flp/Fap pilin component  39.13 
 
 		 56 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179102  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3316  hypothetical protein  39.58 
 
 		 175 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2363  Flp/Fap pilin component  31.58 
 
 		 60 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3349  Flp/Fap pilin component  38.78 
 
 		 61 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0652  Flp/Fap pilin component  42.22 
 
 		 57 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3494  Flp/Fap pilin component  36 
 
 		 54 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1960  Flp/Fap pilin component  38.89 
 
 		 55 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3484  Flp/Fap pilin component  45.24 
 
 		 56 aa  40.8  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0220876 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5317  Flp/Fap pilin component  32.65 
 
 		 58 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26673  hitchhiker  0.000600158 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0597  Flp/Fap pilin component  40 
 
 		 55 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.41654  normal  0.29106 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>