40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1839 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1839  Flp/Fap pilin component  100 
 
 		 63 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2639  Flp/Fap pilin component  46.77 
 
 		 61 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4095  Flp/Fap pilin component  45.61 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0652  Flp/Fap pilin component  40.35 
 
 		 57 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6287  Flp/Fap pilin component  42.11 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00948182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0605  Flp/Fap pilin component  43.48 
 
 		 57 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.531331  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4196  Flp/Fap pilin component  45.83 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6366  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0798  Flp/Fap pilin component  46.94 
 
 		 57 aa  47.8  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3316  hypothetical protein  36.21 
 
 		 175 aa  47.4  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0801  pilus assembly protein PilA  46 
 
 		 60 aa  47.4  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5991  Flp/Fap pilin component  40.35 
 
 		 60 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.848765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1035  Flp/Fap pilin component  38.18 
 
 		 57 aa  45.1  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.949319  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4354  Flp/Fap pilin component  44.44 
 
 		 59 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3792  Flp/Fap pilin component  41.07 
 
 		 54 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2643  Flp/Fap pilin component  34.48 
 
 		 70 aa  44.7  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4244  Flp/Fap pilin component  44.44 
 
 		 59 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272454  normal  0.405174 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0416  Flp/Fap pilin component  44.44 
 
 		 52 aa  43.9  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2110  Flp/Fap pilin component  43.75 
 
 		 59 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1399  Flp/Fap pilin component  40.68 
 
 		 54 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.41464  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2928  Flp/Fap pilin component  43.14 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.419964  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3484  Flp/Fap pilin component  47.5 
 
 		 56 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0220876 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7207  Flp/Fap pilin component  38.33 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.150094  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2546  pilin, putative  40.38 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0577216  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1649  Flp/Fap pilin component  36.51 
 
 		 59 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.132405  normal  0.784096 
 
 
-
 
NC_003296  RS02598  putative pilin protein  42.22 
 
 		 58 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191275  normal  0.495698 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6378  Flp/Fap pilin component  33.33 
 
 		 63 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.43993 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5868  Flp/Fap pilin component  33.33 
 
 		 63 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.229195 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5504  Flp/Fap pilin component  33.33 
 
 		 63 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458126  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2387  Flp/Fap pilin component  40.91 
 
 		 54 aa  41.2  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.0065262  hitchhiker  0.00967552 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1937  putative fimbriae assembly related protein  38.46 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0283045  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0615  Flp/Fap pilin component  36.36 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0603648  normal  0.95811 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1785  pilin family protein  38.46 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.859403  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1764  pilin family protein  38.46 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4699  Flp/Fap pilin component  44.19 
 
 		 53 aa  41.2  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0977464  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2700  Flp/Fap pilin component  36.67 
 
 		 61 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.754645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7206  Flp/Fap pilin component  38.6 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0674219  normal  0.484443 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0974  Flp/Fap pilin component  39.58 
 
 		 56 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179102  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3315  hypothetical protein  42.22 
 
 		 59 aa  40.4  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4185  Flp/Fap pilin component  37.1 
 
 		 61 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5316  Flp/Fap pilin component  41.46 
 
 		 58 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351071  hitchhiker  0.000566754 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>