17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_3315 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_3315  hypothetical protein  100 
 
 		 59 aa  124  5e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3316  hypothetical protein  62.07 
 
 		 175 aa  77.4  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5991  Flp/Fap pilin component  38.78 
 
 		 60 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.848765  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0798  Flp/Fap pilin component  38 
 
 		 57 aa  44.7  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2831  Flp/Fap pilin component  44.9 
 
 		 59 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.676625  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1171  Flp/Fap pilin component  33.33 
 
 		 56 aa  43.9  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000265809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0222  component of type 4 pilus pilin subunit protein  40.38 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2639  Flp/Fap pilin component  33.96 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2920  Flp/Fap pilin component  39.22 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.745426  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2919  Flp/Fap pilin component  42.86 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14248  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4185  Flp/Fap pilin component  40.38 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0223  component of type 4 pilus pilin subunit protein  40.38 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668081  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2643  Flp/Fap pilin component  40 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1915  Flp/Fap pilin component  41.3 
 
 		 52 aa  40.8  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00503365  hitchhiker  0.00635938 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1839  Flp/Fap pilin component  42.22 
 
 		 63 aa  40.4  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2323  Flp/Fap pilin component  32.73 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4473  Flp/Fap pilin component  38.46 
 
 		 62 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.837061  normal  0.806364 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>