37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0798 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0798  Flp/Fap pilin component  100 
 
 		 57 aa  113  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0875  Flp/Fap pilin component  59.57 
 
 		 57 aa  56.2  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3316  hypothetical protein  42.59 
 
 		 175 aa  50.4  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0789  Flp/Fap pilin component  41.82 
 
 		 58 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4699  Flp/Fap pilin component  41.18 
 
 		 53 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0977464  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0652  Flp/Fap pilin component  43.14 
 
 		 57 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0597  Flp/Fap pilin component  40 
 
 		 55 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.41654  normal  0.29106 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1839  Flp/Fap pilin component  46.94 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1399  Flp/Fap pilin component  44.9 
 
 		 54 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.41464  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2831  Flp/Fap pilin component  39.22 
 
 		 59 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.676625  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2387  Flp/Fap pilin component  40.82 
 
 		 54 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.0065262  hitchhiker  0.00967552 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1915  Flp/Fap pilin component  40.82 
 
 		 52 aa  45.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00503365  hitchhiker  0.00635938 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3315  hypothetical protein  38 
 
 		 59 aa  44.7  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0653  Flp/Fap pilin component  36.36 
 
 		 57 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2919  Flp/Fap pilin component  39.22 
 
 		 59 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14248  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5316  Flp/Fap pilin component  40.38 
 
 		 58 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351071  hitchhiker  0.000566754 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2323  Flp/Fap pilin component  31.48 
 
 		 69 aa  43.9  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4611  Flp/Fap pilin component  41.18 
 
 		 58 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.699189 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2824  Flp/Fap pilin component  39.22 
 
 		 56 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50451  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0416  Flp/Fap pilin component  40.82 
 
 		 52 aa  42.7  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1035  Flp/Fap pilin component  41.67 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.949319  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2363  Flp/Fap pilin component  41.51 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0596  Flp/Fap pilin component  40.82 
 
 		 56 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302138  normal  0.298198 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4196  Flp/Fap pilin component  40.82 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1649  Flp/Fap pilin component  41.67 
 
 		 59 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.132405  normal  0.784096 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6378  Flp/Fap pilin component  38.89 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.43993 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5868  Flp/Fap pilin component  38.89 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.229195 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6287  Flp/Fap pilin component  36.36 
 
 		 60 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00948182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5504  Flp/Fap pilin component  38.89 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458126  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1493  Flp/Fap pilin component  37.25 
 
 		 56 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000102149  hitchhiker  0.00000902291 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1736  Flp/Fap pilin component  33.33 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000234566  hitchhiker  0.0000333634 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1517  Flp/Fap pilin component  37.25 
 
 		 56 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000857927  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3792  Flp/Fap pilin component  39.22 
 
 		 54 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0605  Flp/Fap pilin component  37.25 
 
 		 57 aa  40.8  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.531331  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1037  Flp/Fap pilin component  37.25 
 
 		 56 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708738  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1439  Flp/Fap pilin component  32.61 
 
 		 72 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719822  normal  0.158207 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1796  Flp/Fap pilin component  46.67 
 
 		 54 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.655052  normal  0.0298304 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>