37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1915 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1915  Flp/Fap pilin component  100 
 
 
52 aa  101  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00503365  hitchhiker  0.00635938 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1121  Flp/Fap pilin component  78.26 
 
 
52 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.932895 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2323  Flp/Fap pilin component  53.06 
 
 
69 aa  60.8  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1035  Flp/Fap pilin component  54 
 
 
57 aa  56.6  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.949319  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3202  hypothetical protein  46.94 
 
 
64 aa  52  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.281235 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2110  Flp/Fap pilin component  46.15 
 
 
59 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0416  Flp/Fap pilin component  53.19 
 
 
52 aa  49.7  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0768  Flp/Fap pilin component  60.47 
 
 
67 aa  49.3  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1059  hypothetical protein  44 
 
 
64 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2075  Flp/Fap pilin component  45.1 
 
 
58 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.514501  normal  0.606618 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2076  Flp/Fap pilin component  46.81 
 
 
68 aa  47.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.554715  normal  0.612928 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0798  Flp/Fap pilin component  40.82 
 
 
57 aa  45.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1026  Flp/Fap pilin component  46.94 
 
 
121 aa  45.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4699  Flp/Fap pilin component  42.55 
 
 
53 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0977464  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6287  Flp/Fap pilin component  41.18 
 
 
60 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00948182  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3316  hypothetical protein  39.58 
 
 
175 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2639  Flp/Fap pilin component  40 
 
 
61 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2489  Flp/Fap pilin component  46 
 
 
59 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0652  Flp/Fap pilin component  41.3 
 
 
57 aa  42  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1399  Flp/Fap pilin component  38 
 
 
54 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.41464  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1171  Flp/Fap pilin component  43.14 
 
 
56 aa  41.6  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000265809  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1307  putative pilus subunit protein  41.3 
 
 
72 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2264  Flp/Fap pilin component superfamily protein  41.3 
 
 
72 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5991  Flp/Fap pilin component  37.25 
 
 
60 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.848765  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0596  Flp/Fap pilin component  42.55 
 
 
56 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302138  normal  0.298198 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3315  hypothetical protein  41.3 
 
 
59 aa  40.8  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2956  Flp/Fap pilin  41.3 
 
 
48 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3081  Flp/Fap pilin  41.3 
 
 
48 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5868  Flp/Fap pilin component  37.5 
 
 
63 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.229195 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0789  Flp/Fap pilin component  40.43 
 
 
58 aa  40.8  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6378  Flp/Fap pilin component  37.5 
 
 
63 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.43993 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5504  Flp/Fap pilin component  37.5 
 
 
63 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458126  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2387  Flp/Fap pilin component  35.29 
 
 
54 aa  40  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.0065262  hitchhiker  0.00967552 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0597  Flp/Fap pilin component  43.48 
 
 
55 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.41654  normal  0.29106 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1037  Flp/Fap pilin component  42 
 
 
56 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708738  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1493  Flp/Fap pilin component  42 
 
 
56 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000102149  hitchhiker  0.00000902291 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1517  Flp/Fap pilin component  42 
 
 
56 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000857927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>