16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1121 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1121  Flp/Fap pilin component  100 
 
 		 52 aa  99.4  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.932895 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1915  Flp/Fap pilin component  78.26 
 
 		 52 aa  72  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00503365  hitchhiker  0.00635938 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2110  Flp/Fap pilin component  45.1 
 
 		 59 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2323  Flp/Fap pilin component  46.81 
 
 		 69 aa  52.8  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1035  Flp/Fap pilin component  48 
 
 		 57 aa  49.3  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.949319  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1059  hypothetical protein  47.92 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1026  Flp/Fap pilin component  50 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2707  hypothetical protein  48.84 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3202  hypothetical protein  47.83 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.281235 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0416  Flp/Fap pilin component  44 
 
 		 52 aa  44.7  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3316  hypothetical protein  43.75 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2639  Flp/Fap pilin component  37.25 
 
 		 61 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5991  Flp/Fap pilin component  40 
 
 		 60 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.848765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0768  Flp/Fap pilin component  53.19 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2405  Flp/Fap pilin component  25.49 
 
 		 64 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.842762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4389  Flp/Fap pilin component  34.69 
 
 		 68 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34971  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>