39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2110 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2110  Flp/Fap pilin component  100 
 
 		 59 aa  117  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1035  Flp/Fap pilin component  57.45 
 
 		 57 aa  57  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.949319  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1121  Flp/Fap pilin component  45.1 
 
 		 52 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.932895 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2323  Flp/Fap pilin component  49.06 
 
 		 69 aa  53.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1915  Flp/Fap pilin component  46.15 
 
 		 52 aa  51.6  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00503365  hitchhiker  0.00635938 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5123  Flp/Fap pilin component  42.59 
 
 		 55 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0326494 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2363  Flp/Fap pilin component  46.3 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1037  Flp/Fap pilin component  45.28 
 
 		 56 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708738  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0416  Flp/Fap pilin component  47.06 
 
 		 52 aa  48.5  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1517  Flp/Fap pilin component  45.28 
 
 		 56 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000857927  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1493  Flp/Fap pilin component  45.28 
 
 		 56 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000102149  hitchhiker  0.00000902291 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2152  hypothetical protein  52.38 
 
 		 60 aa  48.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131958 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0223  component of type 4 pilus pilin subunit protein  38.98 
 
 		 61 aa  47  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668081  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0768  Flp/Fap pilin component  54.76 
 
 		 67 aa  47  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1937  putative fimbriae assembly related protein  45.61 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0283045  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3792  Flp/Fap pilin component  43.4 
 
 		 54 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1785  pilin family protein  45.61 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.859403  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1764  pilin family protein  45.61 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3349  Flp/Fap pilin component  38.98 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2489  Flp/Fap pilin component  44.9 
 
 		 59 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4196  Flp/Fap pilin component  40.68 
 
 		 61 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1439  Flp/Fap pilin component  38.98 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719822  normal  0.158207 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2546  pilin, putative  43.86 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0577216  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1399  Flp/Fap pilin component  39.62 
 
 		 54 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.41464  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1839  Flp/Fap pilin component  43.75 
 
 		 63 aa  43.9  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0974  Flp/Fap pilin component  42.59 
 
 		 56 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179102  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2639  Flp/Fap pilin component  39.62 
 
 		 61 aa  43.5  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3202  hypothetical protein  44.19 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.281235 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1736  Flp/Fap pilin component  36.21 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000234566  hitchhiker  0.0000333634 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1059  hypothetical protein  41.67 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2643  Flp/Fap pilin component  38.89 
 
 		 70 aa  41.6  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4095  Flp/Fap pilin component  38.89 
 
 		 60 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1796  Flp/Fap pilin component  35.85 
 
 		 54 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.655052  normal  0.0298304 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2076  Flp/Fap pilin component  44.44 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.554715  normal  0.612928 
 
 
-
 
NC_003296  RS02598  putative pilin protein  36.84 
 
 		 58 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191275  normal  0.495698 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0230  Flp/Fap pilin component  42.86 
 
 		 54 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7206  Flp/Fap pilin component  40.74 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0674219  normal  0.484443 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0222  component of type 4 pilus pilin subunit protein  35.09 
 
 		 61 aa  40.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2088  Flp/Fap pilin component  34 
 
 		 54 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>