11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1059 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1059  hypothetical protein  100 
 
 		 64 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3202  hypothetical protein  84.13 
 
 		 64 aa  110  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.281235 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2323  Flp/Fap pilin component  41.51 
 
 		 69 aa  51.2  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1915  Flp/Fap pilin component  44 
 
 		 52 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00503365  hitchhiker  0.00635938 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1035  Flp/Fap pilin component  43.4 
 
 		 57 aa  47.4  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.949319  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1121  Flp/Fap pilin component  47.92 
 
 		 52 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.932895 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2707  hypothetical protein  45.83 
 
 		 106 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2110  Flp/Fap pilin component  41.67 
 
 		 59 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1026  Flp/Fap pilin component  52.5 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0768  Flp/Fap pilin component  40 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2639  Flp/Fap pilin component  29.31 
 
 		 61 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>