39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2323 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_2323  Flp/Fap pilin component  100 
 
 		 69 aa  134  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1035  Flp/Fap pilin component  50.91 
 
 		 57 aa  61.2  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.949319  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1915  Flp/Fap pilin component  53.06 
 
 		 52 aa  60.8  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00503365  hitchhiker  0.00635938 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1121  Flp/Fap pilin component  46.81 
 
 		 52 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.932895 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2110  Flp/Fap pilin component  49.06 
 
 		 59 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1059  hypothetical protein  40.68 
 
 		 64 aa  51.2  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3202  hypothetical protein  41.51 
 
 		 64 aa  51.2  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.281235 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0653  Flp/Fap pilin component  45.1 
 
 		 57 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0801  pilus assembly protein PilA  46.55 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3316  hypothetical protein  36.84 
 
 		 175 aa  48.9  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0768  Flp/Fap pilin component  42.59 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0597  Flp/Fap pilin component  42.86 
 
 		 55 aa  47  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.41654  normal  0.29106 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1439  Flp/Fap pilin component  33.33 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719822  normal  0.158207 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1736  Flp/Fap pilin component  34.78 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000234566  hitchhiker  0.0000333634 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0652  Flp/Fap pilin component  42 
 
 		 57 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1026  Flp/Fap pilin component  42.55 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1037  Flp/Fap pilin component  40 
 
 		 56 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708738  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1517  Flp/Fap pilin component  40 
 
 		 56 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000857927  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1493  Flp/Fap pilin component  40 
 
 		 56 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000102149  hitchhiker  0.00000902291 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2489  Flp/Fap pilin component  40.74 
 
 		 59 aa  44.7  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2928  Flp/Fap pilin component  43.75 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.419964  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2831  Flp/Fap pilin component  37.74 
 
 		 59 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.676625  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0798  Flp/Fap pilin component  31.48 
 
 		 57 aa  43.9  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2643  Flp/Fap pilin component  40.74 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4439  Flp/Fap pilin component  40.38 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0309403 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1399  Flp/Fap pilin component  35.85 
 
 		 54 aa  42.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.41464  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2387  Flp/Fap pilin component  38.78 
 
 		 54 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.0065262  hitchhiker  0.00967552 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0416  Flp/Fap pilin component  41.67 
 
 		 52 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2919  Flp/Fap pilin component  37.74 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14248  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4196  Flp/Fap pilin component  33.9 
 
 		 61 aa  41.6  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0596  Flp/Fap pilin component  38.3 
 
 		 56 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302138  normal  0.298198 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2639  Flp/Fap pilin component  38.78 
 
 		 61 aa  41.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0789  Flp/Fap pilin component  38.3 
 
 		 58 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2076  Flp/Fap pilin component  42 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.554715  normal  0.612928 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0755  hypothetical protein  39.68 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4699  Flp/Fap pilin component  40 
 
 		 53 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0977464  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0652  hypothetical protein  40.38 
 
 		 91 aa  40.4  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.331917 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3315  hypothetical protein  32.73 
 
 		 59 aa  40.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2824  Flp/Fap pilin component  38.78 
 
 		 56 aa  40  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>