12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0755 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0755  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  184  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0756  hypothetical protein  78.57 
 
 		 87 aa  129  9e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0652  hypothetical protein  68.54 
 
 		 91 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.331917 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0651  hypothetical protein  72.09 
 
 		 102 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.329096 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0700  Flp/Fap pilin-like protein  53.41 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6869  hypothetical protein  63.41 
 
 		 93 aa  104  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.274014 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0701  hypothetical protein  54.88 
 
 		 104 aa  101  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2914  hypothetical protein  62.16 
 
 		 77 aa  94.4  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4339  hypothetical protein  53.33 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0240  hypothetical protein  63.27 
 
 		 89 aa  68.2  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2687  putative prepilin protein  70.45 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00818141  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2319  hypothetical protein  45.57 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>