58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_4439 on replicon NC_011879
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011879  Achl_4439  Flp/Fap pilin component  100 
 
 		 70 aa  134  5e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0309403 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2643  Flp/Fap pilin component  48.57 
 
 		 70 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2076  Flp/Fap pilin component  52 
 
 		 68 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.554715  normal  0.612928 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6287  Flp/Fap pilin component  38.98 
 
 		 60 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00948182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5991  Flp/Fap pilin component  37.29 
 
 		 60 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.848765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2633  Flp/Fap pilin component  42.37 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.691618 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4095  Flp/Fap pilin component  48.57 
 
 		 60 aa  51.2  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2920  Flp/Fap pilin component  40.62 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.745426  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0789  Flp/Fap pilin component  49.02 
 
 		 58 aa  48.9  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1399  Flp/Fap pilin component  46.94 
 
 		 54 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.41464  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2075  Flp/Fap pilin component  50 
 
 		 58 aa  48.9  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.514501  normal  0.606618 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7206  Flp/Fap pilin component  40.68 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0674219  normal  0.484443 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2639  Flp/Fap pilin component  41.79 
 
 		 61 aa  47.8  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2634  Flp/Fap pilin component  37.29 
 
 		 66 aa  47.8  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.815116 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0974  Flp/Fap pilin component  53.06 
 
 		 56 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179102  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0223  component of type 4 pilus pilin subunit protein  38.57 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668081  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6378  Flp/Fap pilin component  41.18 
 
 		 63 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.43993 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5868  Flp/Fap pilin component  41.18 
 
 		 63 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.229195 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4196  Flp/Fap pilin component  50.94 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5504  Flp/Fap pilin component  41.18 
 
 		 63 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458126  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4244  Flp/Fap pilin component  43.4 
 
 		 59 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272454  normal  0.405174 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0652  Flp/Fap pilin component  37.5 
 
 		 57 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3792  Flp/Fap pilin component  50 
 
 		 54 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4354  Flp/Fap pilin component  43.4 
 
 		 59 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2710  pilin, putative  53.49 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7207  Flp/Fap pilin component  33.82 
 
 		 63 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.150094  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2332  Flp/Fap pilin component  53.49 
 
 		 69 aa  44.3  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.341301  normal  0.812009 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5123  Flp/Fap pilin component  52.27 
 
 		 55 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0326494 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1785  pilin family protein  46.67 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.859403  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1764  pilin family protein  46.67 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1937  putative fimbriae assembly related protein  46.67 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0283045  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1493  Flp/Fap pilin component  44.9 
 
 		 56 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000102149  hitchhiker  0.00000902291 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1517  Flp/Fap pilin component  44.9 
 
 		 56 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000857927  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2546  pilin, putative  46.67 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0577216  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2323  Flp/Fap pilin component  39.62 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0597  Flp/Fap pilin component  38.18 
 
 		 55 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.41654  normal  0.29106 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1037  Flp/Fap pilin component  44.9 
 
 		 56 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708738  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4185  Flp/Fap pilin component  37.14 
 
 		 61 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1736  Flp/Fap pilin component  43.75 
 
 		 69 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000234566  hitchhiker  0.0000333634 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2928  Flp/Fap pilin component  44.44 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.419964  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1439  Flp/Fap pilin component  47.73 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719822  normal  0.158207 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4699  Flp/Fap pilin component  46.94 
 
 		 53 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0977464  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2824  Flp/Fap pilin component  48.98 
 
 		 56 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50451  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3316  hypothetical protein  34.55 
 
 		 175 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0222  component of type 4 pilus pilin subunit protein  39.62 
 
 		 61 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2387  Flp/Fap pilin component  46.94 
 
 		 54 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.0065262  hitchhiker  0.00967552 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2489  Flp/Fap pilin component  51.11 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4611  Flp/Fap pilin component  41.51 
 
 		 58 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.699189 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2363  Flp/Fap pilin component  56.76 
 
 		 60 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3427  Flp/Fap pilin component  54.55 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.108389  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0653  Flp/Fap pilin component  40.35 
 
 		 57 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3121  Flp/Fap pilin component  40 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0383404  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5316  Flp/Fap pilin component  41.67 
 
 		 58 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351071  hitchhiker  0.000566754 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0801  pilus assembly protein PilA  37.5 
 
 		 60 aa  41.2  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02598  putative pilin protein  37.7 
 
 		 58 aa  40.4  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191275  normal  0.495698 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0596  Flp/Fap pilin component  38.1 
 
 		 56 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302138  normal  0.298198 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0605  Flp/Fap pilin component  47.73 
 
 		 57 aa  40.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.531331  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4197  Flp/Fap pilin component  47.83 
 
 		 54 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>