36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_3316 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_3316  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  366  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3315  hypothetical protein  62.07 
 
 		 59 aa  77.4  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2639  Flp/Fap pilin component  40.98 
 
 		 61 aa  51.6  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5991  Flp/Fap pilin component  39.29 
 
 		 60 aa  51.2  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.848765  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0798  Flp/Fap pilin component  42.59 
 
 		 57 aa  50.4  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1035  Flp/Fap pilin component  47.17 
 
 		 57 aa  49.3  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.949319  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2323  Flp/Fap pilin component  36.84 
 
 		 69 aa  48.1  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2831  Flp/Fap pilin component  44.44 
 
 		 59 aa  47.4  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.676625  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1839  Flp/Fap pilin component  36.21 
 
 		 63 aa  47.4  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2919  Flp/Fap pilin component  44.44 
 
 		 59 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14248  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2489  Flp/Fap pilin component  41.67 
 
 		 59 aa  45.8  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0416  Flp/Fap pilin component  45.65 
 
 		 52 aa  45.4  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1736  Flp/Fap pilin component  32.76 
 
 		 69 aa  45.1  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000234566  hitchhiker  0.0000333634 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1171  Flp/Fap pilin component  57.14 
 
 		 56 aa  43.9  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000265809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0597  Flp/Fap pilin component  37.5 
 
 		 55 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.41654  normal  0.29106 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0595  Flp/Fap pilin component  36.73 
 
 		 56 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.311439  normal  0.298198 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1121  Flp/Fap pilin component  43.75 
 
 		 52 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.932895 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1915  Flp/Fap pilin component  39.58 
 
 		 52 aa  43.5  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00503365  hitchhiker  0.00635938 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0875  Flp/Fap pilin component  43.48 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0615  Flp/Fap pilin component  43.48 
 
 		 61 aa  43.5  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0603648  normal  0.95811 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0651  Flp/Fap pilin component  33.33 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.151252 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6287  Flp/Fap pilin component  35.71 
 
 		 60 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00948182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7206  Flp/Fap pilin component  35.09 
 
 		 63 aa  42.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0674219  normal  0.484443 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4439  Flp/Fap pilin component  34.55 
 
 		 70 aa  42.4  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0309403 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0653  Flp/Fap pilin component  32.14 
 
 		 57 aa  42.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0798  Flp/Fap pilin component  39.13 
 
 		 81 aa  42  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0974  Flp/Fap pilin component  37.5 
 
 		 56 aa  41.6  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179102  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0652  Flp/Fap pilin component  30.36 
 
 		 57 aa  42  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0768  Flp/Fap pilin component  38 
 
 		 67 aa  41.6  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0789  Flp/Fap pilin component  35.42 
 
 		 58 aa  41.6  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5504  Flp/Fap pilin component  31.58 
 
 		 63 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458126  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0223  component of type 4 pilus pilin subunit protein  43.9 
 
 		 61 aa  41.6  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668081  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5868  Flp/Fap pilin component  31.58 
 
 		 63 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.229195 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6378  Flp/Fap pilin component  31.58 
 
 		 63 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.43993 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1399  Flp/Fap pilin component  36.73 
 
 		 54 aa  41.2  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.41464  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4185  Flp/Fap pilin component  35 
 
 		 61 aa  40.8  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>