55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0595 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0595  Flp/Fap pilin component  100 
 
 		 56 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.311439  normal  0.298198 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0651  Flp/Fap pilin component  61.7 
 
 		 57 aa  63.5  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.151252 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2640  Flp/Fap pilin component  65.22 
 
 		 74 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5992  Flp/Fap pilin component  45.45 
 
 		 68 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.651462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6288  Flp/Fap pilin component  50 
 
 		 68 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0180675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5502  Flp/Fap pilin component  57.78 
 
 		 68 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.253434  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7205  Flp/Fap pilin component  54.76 
 
 		 68 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0699567  normal  0.486498 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6788  Flp/Fap pilin component  57.78 
 
 		 68 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.234531 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6376  Flp/Fap pilin component  57.78 
 
 		 68 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.465787 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1307  putative pilus subunit protein  46.81 
 
 		 72 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2956  Flp/Fap pilin  48.89 
 
 		 48 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3081  Flp/Fap pilin  48.89 
 
 		 48 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2264  Flp/Fap pilin component superfamily protein  50 
 
 		 72 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0416  Flp/Fap pilin component  44.68 
 
 		 52 aa  51.6  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0652  Flp/Fap pilin component  42.31 
 
 		 57 aa  51.6  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2545  Flp/Fap pilin component  50 
 
 		 97 aa  51.2  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.221854  normal  0.0466473 
 
 
-
 
NC_003296  RS02598  putative pilin protein  47.92 
 
 		 58 aa  51.2  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191275  normal  0.495698 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0596  Flp/Fap pilin component  43.75 
 
 		 56 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302138  normal  0.298198 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1399  Flp/Fap pilin component  38.78 
 
 		 54 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.41464  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0597  Flp/Fap pilin component  43.75 
 
 		 55 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.41654  normal  0.29106 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0653  Flp/Fap pilin component  42.55 
 
 		 57 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2639  Flp/Fap pilin component  38.78 
 
 		 61 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6287  Flp/Fap pilin component  39.62 
 
 		 60 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00948182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0788  Flp/Fap pilin component  43.9 
 
 		 72 aa  46.2  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5504  Flp/Fap pilin component  39.62 
 
 		 63 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458126  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4611  Flp/Fap pilin component  38.78 
 
 		 58 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.699189 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6378  Flp/Fap pilin component  39.62 
 
 		 63 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.43993 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5868  Flp/Fap pilin component  39.62 
 
 		 63 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.229195 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2489  Flp/Fap pilin component  38.3 
 
 		 59 aa  45.1  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1736  Flp/Fap pilin component  37.5 
 
 		 69 aa  45.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000234566  hitchhiker  0.0000333634 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1796  Flp/Fap pilin component  44.68 
 
 		 54 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.655052  normal  0.0298304 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0789  Flp/Fap pilin component  41.46 
 
 		 58 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3316  hypothetical protein  36.73 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2546  pilin, putative  36.73 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0577216  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2387  Flp/Fap pilin component  33.33 
 
 		 54 aa  42.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.0065262  hitchhiker  0.00967552 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7206  Flp/Fap pilin component  38.89 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0674219  normal  0.484443 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2332  Flp/Fap pilin component  46.51 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.341301  normal  0.812009 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7207  Flp/Fap pilin component  40.74 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.150094  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5991  Flp/Fap pilin component  35.85 
 
 		 60 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.848765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1937  putative fimbriae assembly related protein  34.69 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0283045  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2802  putative pilus subunit protein, PilA like  34 
 
 		 55 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.323715 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1785  pilin family protein  34.69 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.859403  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1764  pilin family protein  34.69 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0615  Flp/Fap pilin component  41.82 
 
 		 61 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0603648  normal  0.95811 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2710  pilin, putative  41.67 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4699  Flp/Fap pilin component  35.56 
 
 		 53 aa  40.8  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0977464  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1493  Flp/Fap pilin component  30.61 
 
 		 56 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000102149  hitchhiker  0.00000902291 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1037  Flp/Fap pilin component  30.61 
 
 		 56 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708738  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1517  Flp/Fap pilin component  30.61 
 
 		 56 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000857927  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2363  Flp/Fap pilin component  38.3 
 
 		 60 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1960  Flp/Fap pilin component  41.67 
 
 		 55 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1649  Flp/Fap pilin component  35.56 
 
 		 59 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.132405  normal  0.784096 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1439  Flp/Fap pilin component  33.33 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719822  normal  0.158207 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3792  Flp/Fap pilin component  33.33 
 
 		 54 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1171  Flp/Fap pilin component  46.15 
 
 		 56 aa  40.4  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000265809  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>