35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5992 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5992  Flp/Fap pilin component  100 
 
 		 68 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.651462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6288  Flp/Fap pilin component  66.18 
 
 		 68 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0180675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0595  Flp/Fap pilin component  45.45 
 
 		 56 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.311439  normal  0.298198 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7205  Flp/Fap pilin component  57.69 
 
 		 68 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0699567  normal  0.486498 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5502  Flp/Fap pilin component  61.9 
 
 		 68 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.253434  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6788  Flp/Fap pilin component  61.9 
 
 		 68 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.234531 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6376  Flp/Fap pilin component  61.9 
 
 		 68 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.465787 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2639  Flp/Fap pilin component  46 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0652  Flp/Fap pilin component  51.02 
 
 		 57 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0653  Flp/Fap pilin component  47.73 
 
 		 57 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5991  Flp/Fap pilin component  44.44 
 
 		 60 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.848765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1307  putative pilus subunit protein  38 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0651  Flp/Fap pilin component  52.27 
 
 		 57 aa  45.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.151252 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4196  Flp/Fap pilin component  45.76 
 
 		 61 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2956  Flp/Fap pilin  39.13 
 
 		 48 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3081  Flp/Fap pilin  39.13 
 
 		 48 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0416  Flp/Fap pilin component  43.18 
 
 		 52 aa  44.3  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3349  Flp/Fap pilin component  39.58 
 
 		 61 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0223  component of type 4 pilus pilin subunit protein  45 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668081  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0222  component of type 4 pilus pilin subunit protein  46.34 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1399  Flp/Fap pilin component  44.44 
 
 		 54 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.41464  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1439  Flp/Fap pilin component  35.71 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719822  normal  0.158207 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0596  Flp/Fap pilin component  44.44 
 
 		 56 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302138  normal  0.298198 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5317  Flp/Fap pilin component  35.42 
 
 		 58 aa  42  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26673  hitchhiker  0.000600158 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4185  Flp/Fap pilin component  35.19 
 
 		 61 aa  42  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2264  Flp/Fap pilin component superfamily protein  36 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1736  Flp/Fap pilin component  40.82 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000234566  hitchhiker  0.0000333634 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6287  Flp/Fap pilin component  42.59 
 
 		 60 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00948182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0597  Flp/Fap pilin component  44.44 
 
 		 55 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.41654  normal  0.29106 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4197  Flp/Fap pilin component  45.24 
 
 		 54 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692127  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02598  putative pilin protein  32 
 
 		 58 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191275  normal  0.495698 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2332  Flp/Fap pilin component  38.89 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.341301  normal  0.812009 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7206  Flp/Fap pilin component  41.18 
 
 		 63 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0674219  normal  0.484443 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3792  Flp/Fap pilin component  37.78 
 
 		 54 aa  40.4  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0789  Flp/Fap pilin component  38.64 
 
 		 58 aa  40  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>