36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6288 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6288  Flp/Fap pilin component  100 
 
 		 68 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0180675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5992  Flp/Fap pilin component  66.18 
 
 		 68 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.651462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6788  Flp/Fap pilin component  80.95 
 
 		 68 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.234531 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5502  Flp/Fap pilin component  80.95 
 
 		 68 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.253434  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7205  Flp/Fap pilin component  74.42 
 
 		 68 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0699567  normal  0.486498 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6376  Flp/Fap pilin component  80.95 
 
 		 68 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.465787 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0595  Flp/Fap pilin component  50 
 
 		 56 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.311439  normal  0.298198 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1307  putative pilus subunit protein  44 
 
 		 72 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0416  Flp/Fap pilin component  44.68 
 
 		 52 aa  48.1  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2956  Flp/Fap pilin  44.44 
 
 		 48 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3081  Flp/Fap pilin  44.44 
 
 		 48 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0651  Flp/Fap pilin component  42.86 
 
 		 57 aa  47  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.151252 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2264  Flp/Fap pilin component superfamily protein  42 
 
 		 72 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02598  putative pilin protein  39.22 
 
 		 58 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191275  normal  0.495698 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0788  Flp/Fap pilin component  38.18 
 
 		 72 aa  44.7  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1736  Flp/Fap pilin component  40 
 
 		 69 aa  44.3  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000234566  hitchhiker  0.0000333634 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4196  Flp/Fap pilin component  42.22 
 
 		 61 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2545  Flp/Fap pilin component  33.87 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.221854  normal  0.0466473 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0653  Flp/Fap pilin component  42.55 
 
 		 57 aa  43.9  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2639  Flp/Fap pilin component  40.38 
 
 		 61 aa  43.5  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2021  Flp/Fap pilin component  40.82 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3349  Flp/Fap pilin component  34.62 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1399  Flp/Fap pilin component  40.43 
 
 		 54 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.41464  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1960  Flp/Fap pilin component  42.86 
 
 		 55 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2489  Flp/Fap pilin component  36.73 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2088  Flp/Fap pilin component  47.83 
 
 		 54 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409092  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5991  Flp/Fap pilin component  38 
 
 		 60 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.848765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5317  Flp/Fap pilin component  38.3 
 
 		 58 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26673  hitchhiker  0.000600158 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4611  Flp/Fap pilin component  35.19 
 
 		 58 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.699189 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3825  Flp/Fap pilin component  37.5 
 
 		 55 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1527  putative Flp/Fap pilin component  43.75 
 
 		 56 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.713475  normal  0.82875 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0597  Flp/Fap pilin component  40.82 
 
 		 55 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.41654  normal  0.29106 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0652  Flp/Fap pilin component  39.58 
 
 		 57 aa  40.4  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2824  Flp/Fap pilin component  36.96 
 
 		 56 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50451  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3792  Flp/Fap pilin component  34.69 
 
 		 54 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4473  Flp/Fap pilin component  30.19 
 
 		 62 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.837061  normal  0.806364 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>