44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2021 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2021  Flp/Fap pilin component  100 
 
 		 67 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6378  Flp/Fap pilin component  50 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.43993 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5868  Flp/Fap pilin component  50 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.229195 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5504  Flp/Fap pilin component  50 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458126  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5991  Flp/Fap pilin component  47.17 
 
 		 60 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.848765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6287  Flp/Fap pilin component  49.06 
 
 		 60 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00948182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0651  Flp/Fap pilin component  50 
 
 		 57 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.151252 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0789  Flp/Fap pilin component  50 
 
 		 58 aa  45.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02598  putative pilin protein  43.14 
 
 		 58 aa  45.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191275  normal  0.495698 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2489  Flp/Fap pilin component  52.17 
 
 		 59 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2363  Flp/Fap pilin component  43.4 
 
 		 60 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3825  Flp/Fap pilin component  44.9 
 
 		 55 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3792  Flp/Fap pilin component  53.19 
 
 		 54 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7207  Flp/Fap pilin component  61.11 
 
 		 63 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.150094  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0416  Flp/Fap pilin component  54.35 
 
 		 52 aa  45.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0597  Flp/Fap pilin component  51.06 
 
 		 55 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.41654  normal  0.29106 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7206  Flp/Fap pilin component  63.89 
 
 		 63 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0674219  normal  0.484443 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0652  Flp/Fap pilin component  48.94 
 
 		 57 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4196  Flp/Fap pilin component  48.08 
 
 		 61 aa  44.7  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2639  Flp/Fap pilin component  50 
 
 		 61 aa  44.3  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1736  Flp/Fap pilin component  44.9 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000234566  hitchhiker  0.0000333634 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0605  Flp/Fap pilin component  48.94 
 
 		 57 aa  43.9  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.531331  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2643  Flp/Fap pilin component  47.92 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2088  Flp/Fap pilin component  45.65 
 
 		 54 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409092  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1493  Flp/Fap pilin component  45.83 
 
 		 56 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000102149  hitchhiker  0.00000902291 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4473  Flp/Fap pilin component  45.65 
 
 		 62 aa  42.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.837061  normal  0.806364 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1037  Flp/Fap pilin component  45.83 
 
 		 56 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708738  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6288  Flp/Fap pilin component  40.82 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0180675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06199  Flp pilus assembly protein  42.62 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3349  Flp/Fap pilin component  51.11 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1517  Flp/Fap pilin component  45.83 
 
 		 56 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000857927  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2802  putative pilus subunit protein, PilA like  38.3 
 
 		 55 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.323715 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4442  Flp/Fap pilin component  51.28 
 
 		 60 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4185  Flp/Fap pilin component  43.14 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4197  Flp/Fap pilin component  47.83 
 
 		 54 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692127  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1439  Flp/Fap pilin component  42.31 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719822  normal  0.158207 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2405  Flp/Fap pilin component  40 
 
 		 64 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.842762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0596  Flp/Fap pilin component  47.83 
 
 		 56 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302138  normal  0.298198 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2824  Flp/Fap pilin component  42.86 
 
 		 56 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50451  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0653  Flp/Fap pilin component  57.14 
 
 		 57 aa  41.6  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2075  Flp/Fap pilin component  45.1 
 
 		 58 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.514501  normal  0.606618 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0602  Flp/Fap pilin component  51.22 
 
 		 69 aa  40.8  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1649  Flp/Fap pilin component  39.58 
 
 		 59 aa  40.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.132405  normal  0.784096 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2076  Flp/Fap pilin component  45.1 
 
 		 68 aa  40  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.554715  normal  0.612928 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>